新疆紫草科dna条形码研究及其系统发育分析

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1、时间就是金钱,效率就是生命!唯有惜时才能成功,唯有努力方可成就!新疆新疆紫草科草科 DNA 条形码研究及其系统发育分析条形码研究及其系统发育分析高晓阳1,2 梁 雪1 李 岩1,2 刘 斌1,21.中科院新疆生态与地理研究所系统基因组研究中心,乌鲁木齐,8300112.中国科学院研究生院,北京,100049新疆紫草科种类繁多,具有重要的药用及生物学价值,但其形态学、孢粉学、化学分类上存在一定的不确定性。DNA 条形码技术作为物种快速准确鉴定方法,成为分子分类学研究的新兴领域。本文采用叶绿体基因 rbcL 为目的片段,对紫草科植物进行总 DNA 提取,PRC 扩增和产物测序,结合 GenBank

2、 数据库紫草科 rbcL 序列,通过属内属间遗传距离差异性比较,同时以亲缘关系较近的马鞭草科(Verbenacea)作为外类群,采用 NJ(neighbor joining),MP(maximum parsimony),BI(Bayesian inference)构建系统发生树。结果表明:紫草科平均遗传距离 0.0159,属内平均遗传距离 0.004,属间平均遗传距离 0.014,属内属间差异显著(p=0.01890),序列可分为两个单系群,各种属之间亲缘关系远近分明,可见rbcL 条形码的变异性足以用作唇形科植物的种属亲缘与进化关系分析的的分子分类学证据。分析还表明新疆裂叶荆芥属(Schiz

3、onepeta)植物与荆芥属(Nepeta)为姊妹群(Bootstrap90) ,新疆新风轮菜(Calamintha nepeta)与迷迭香(Rosmarinus officinalis L) 、青兰(Dracocephalum moldavica)为姊妹群(Bootstrap85),新疆糙苏(phlomis umbrosa)与野芝麻属(Lamium L.) 、夏至草属(Marrubium)亲缘关系较为接近(Bootstrap50) 。本研究显示 DNA 条形码技术在唇形科植物的物种鉴定上有较好的应用前景。唇形科植物多为药用植物,对唇形科药用植物与其易混物种进行分子鉴定,具有特定的生物学意义及

4、应用价值。时间就是金钱,效率就是生命!唯有惜时才能成功,唯有努力方可成就!运用运用 DNA 条形码对新疆干旱区十字花科短命与非短命物条形码对新疆干旱区十字花科短命与非短命物进行比较系统发育分析进行比较系统发育分析尹彦强 李 岩 梁 雪 刘 斌中国科学院新疆生态与地理研究所系统基因组学研究中心,乌鲁木齐,830011十字花科植物是显花植物(被子植物)中具有重要的生物学研究、农业和其它经济价值的种类繁盛的一类植物。其在新疆干旱区广泛分布,由 67 属 251种组成,其中短命植物 38 种,该科具有基于叶绿体 ndhF 基因系统发生分析得到的三个主要世系。然而,有些短命植物的识别与鉴定存在困难,物种

5、水平上的系统发生关系尚未明确,故我们基于测得的该地区十字花科 13 种短命植物与30 余种非短命植物的 DNA 条形码(可用于物种识别与鉴定的 matK, rbcL 或 ITS等分子标记)以及 GenBank 上已发表的序列重建系统发生关系。本研究利用matK 和 rbcL 组合分析得知种间遗传距离大于种内的,并构建了最大简约树(MP tree),初步理顺了所研究物种之间的亲缘关系,它们的系统分类地位得到分子水平的验证和进一步明确,比较系统发生关系的分析表明该科短命与非短命植物在进化过程中出现分歧,我们推测其分化时间与最后的冰期和该干旱区的形成时期有关。新疆地区柽柳与古柽柳的系统发生关系的初步

6、研究新疆地区柽柳与古柽柳的系统发生关系的初步研究赵 海1 姜凤琴2 尹彦强2 梁 雪2 李 岩2 刘 斌2 吴玉虎3 潘伯荣21 伊犁师范学院化学与生物科学学院,伊宁 835000;2 中国科学院新疆生态与地理研究所系统基因组学研究中心,乌鲁木齐 830011;3 中科院西北高原生物学研究所 西宁 810008 柽柳(Tamaricaceae)是一个古老的物种,起源于第三纪,分布在包括中亚地区在内的“古地中海”沿岸地区。柽柳(Tamaricaceae)属于石竹目(Caryo- phyllales)柽柳科(Tamaricaceae)柽柳属(Tamarix) ,中国拥有18个种1个变种,主要分布于

7、西北、内蒙 古和华北等地,新疆有16种。柽柳是典型的防时间就是金钱,效率就是生命!唯有惜时才能成功,唯有努力方可成就!风固沙植物,此外柽柳还具有药用、观赏的价值。 本研究运用DNA条形码技术研究新疆地区柽柳属的系统分类地位和亲缘关系。利用通用引物分别对采自新疆地区柽柳属的8个种和青海同德的古柽柳(甘蒙柽柳)的matK基因进行PCR扩增。以matK基因序列与GenBank中石竹目(Caryo- phyllales)蓼属(Polygonum) 、马齿苋科(Portulacaceae)以及柽柳属(Tamarix)matK基因序列构建系统发生树。结果表明新疆地区柽柳属和青海同德古柽柳构成一个单系群,

8、新疆地区柽柳之间和新疆地区柽柳与古柽柳之间的亲缘关系很近。本研究首次进行了新疆柽柳(灌丛型)和青海古柽柳(乔木型)的比较系统发生关系分析,证明它们可能发生于同一祖先类群,并提供了分子系统发生关系分析的基础分子数据,对于柽柳进化的研究和柽柳资源的应用具有一定意义。ScALDH21 基因表达载体的构建及亚细胞定位基因表达载体的构建及亚细胞定位杨红兰 张道远 李小双 裴金玲中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所, 新疆 乌鲁木齐 830011首次从齿肋赤藓(Syntrichia caninervis)中克隆了ScALDH21基因,该基因参与植物体抗逆过程。生物信

9、息学分析表明,获得的 ScALDH21基因具备完整的ORF,全长1452bp,编码483个氨基酸。SDS-PAGE显示为蛋白分子量53 kDa左右,与理论相符。利用PCR方法扩增ScALDH21全长,经SalI和BamHI酶切后连接入pBI221真核表达载体,构建pGFP-ALDH21重组表达质粒,原生质体法转化拟南芥叶细胞进行瞬时表达,利用激光共聚焦显微镜观察ScALDH21蛋白亚细胞定位情况,结果表明 ScALDH21蛋白定位于细胞核和细胞质中,可能该蛋白发挥多种生物学功能。霸王生长对长期大风的响应霸王生长对长期大风的响应南 江 赵晓英新疆师范大学生命科学学院,新疆 乌鲁木齐 830054

10、 生长大风是一个重要的生态因子,对植物的进化有着重要影响。霸王时间就是金钱,效率就是生命!唯有惜时才能成功,唯有努力方可成就!(Zygophyllum xanthoxylum)是达坂城大风区植被的共建种,也是该区植被恢复潜在的先锋植物。霸王在长期的大风环境中形成了特殊的适应机制,本研究旨在搞清长期大风对霸王生长的影响。在实验田,模拟不同强度( 12 m/s, 7 m/s,3 m/s)的风,对霸王持续吹92天,测定植物的株高、迎风面和背风面茎的直径、叶的数量、叶面积、叶柄的长和直径、根系的直径和长,分析长期大风对植物地上部分和地下部分的影响。结果表明:( 1)长期的大风和中强度风对霸王的株高无影

11、响,但长期弱风明显减小霸王的株高。(2)大风对霸王基径和叶面积无明显影响。 (3)风越大,第一片叶叶柄越短,越纤细,对第三片叶则没有影响。 (4)持续大风对霸王根系的长度和直径没有影响。由此可见:霸王在生长方面通过减小株高和叶片数以及叶柄变纤细等方式适应长期大风。不同地理居群准噶尔无叶豆繁殖体特性不同地理居群准噶尔无叶豆繁殖体特性及种子萌发差异研究及种子萌发差异研究刘会良1,2 张道远1 尹林克11 中国科学院生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所 乌鲁木齐 8300112 中国科学院研究生院, 北京 100049本文探讨了沙丘稀有植物-准噶尔无叶豆 6 个不同居群间繁殖

12、体特性及种子萌发差异,旨在揭示准噶尔无叶豆繁殖体特性及种子萌发差异的原因,阐述准噶尔无叶豆繁殖体特性及萌发特性的生态适应意义。结果显示:不同居群间,果实和种子的长、宽、高、重量及果实多子率存在显著差异,样地 E 和 F(位于沙漠北缘)和 C 点(沙漠腹地) (大种子)显著高于其他居群(小种子) ,可能的原因有三:一,繁殖体特性差异主要受母体影响,二,E 和 F 位于沙漠最北缘,水分及其他资源较好,用于生殖分配的资源就较多,繁殖体的各项指标就高;三,虽然 C 点位于沙漠腹地,但由于位于石油作业区,受人为干扰较重,植株密度较小,植株冠幅较大,即使水分资源较少,但分配于单株的资源反而较大,增大了生殖

13、分配的比例;对比不同居群间的种子萌发特性发现:所有居时间就是金钱,效率就是生命!唯有惜时才能成功,唯有努力方可成就!群的大部分种子存在物理性休眠现象,人为划破种皮处理都能显著提高种子萌发率,但在低温(15/5 度)条件下,萌发率都较低;C、E 和 F 点(大种子)人为划破处理后,种子萌发率显著高于 A、B 和 D 点(小种子) ,说明小种子种群的种子不仅存在种子物理性休眠现象,也存在种子生理性休眠现象,其通过种子物理性休眠保护种子延长了种子寿命,而且当物理休眠释放后种子生理性休眠来调节种子萌发,避免种子全部萌发的风险,是小种子种群适应干旱条件的另一种保护机制。不同激素诱导百合器官快繁的初步研究

14、不同激素诱导百合器官快繁的初步研究王傲立 马 赟 龚 健 索菲娅新疆大学生命科学与技术学院 新疆乌鲁木齐 830046 百合(Lilium spp.)隶属百合科百合属的多年生草本植物,是世界上著名的观赏花卉,近年来百合作为食用和药用产品的开发也在不断发展,逐渐增强了其在国际市场的地位,因而备受世人瞩目。百合以有性方式(种子繁殖)和无性方式进行繁殖,而以无性繁殖为主,生产上主要靠扦插繁殖和分球繁殖等方式繁殖。这些方法不但繁殖速度慢,而且由于长期采用营养繁殖,病毒日趋严重而导致百合种性退化,产量、品质下降,远远不能满足生产的需要。组织培养技术在百合上的应用将会大大提高百合名优品种的繁殖速度,并可获

15、得无病毒苗。关于百合离体繁殖的研究已有许多报道,本实验采用两种激素诱导兰州百合(Lilium davidii var .unicolor)器官生长的最佳条件,以百合花柄、组培苗的叶片为外植体,将这两种外植体接种于含 9 个不同比例的 BA 和 2,4-D 的 MS培养基上培养,观察百合在 30 天内的出芽率以及根部的生长情况。结果显示:在 MS+0.4 2,4-D+ 1.6 BA 培养基上培养的花柄有较高的诱导率且生长较快,8天后可诱导小鳞茎的形成,并进一步分化成不定芽,继而得到健壮、数量多的丛芽,在一定范围内芽诱导率以及所得芽的直径与 BA 和 2,4-D 的比例呈正相关;在 2,4-D 与

16、 BA 一定比例范围内的 MS 培养基上叶片均可以脱分化为黄绿色愈伤组织,进而分化为带根苗,而在 MS+0.6 2,4-D+1.4 BA 培养基上培养叶片得到植株芽最大,根粗细适中,为最佳搭配。同一激素比例的培养基,叶片时间就是金钱,效率就是生命!唯有惜时才能成功,唯有努力方可成就!切段和花柄反应不同,叶片趋向于脱分化,花柄趋向于生长出小鳞茎。百合育种工作中选育出来的优良株系和野生的百合资源数量有限,很难进行资源保存,所以采用叶片作为外植体是较好的选择,其优点是取材容易,繁殖周期短,节省培养基,为百合的优良株系扩繁和野生百合资。采自新疆虫草体中一种真菌的分离鉴定采自新疆虫草体中一种真菌的分离鉴定及抑菌活性的初步研究及抑菌活性的初步研究马 赟 索菲娅 黄罗冬 王傲立 新疆大学生命科学与技术学院 新疆乌鲁木齐 830046 对采自阿尔泰山脉的虫草进行其伴生菌的分离鉴定,经过多批次分离纯化,发现一株出现频率较高的黄绿色菌株(SFY00C3) ,对其菌落进行形态学及电子显微镜观察,再结合分子生物学手段 IT

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