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1、用 Graphpad 做出 SCI 统计图1. 柱状图柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的 X 轴对应的是组别而不是数值,因此在 GraphPad 分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例2.1 根据 Table 5 的原始数据做柱状图Table 5Control A Control B Sample1 0.942 0.717Sample2 0.846 0.836Sample3 0.691 0.653Sample4 0.515 0.483选择 Column graphs 栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Me
2、an&SD), 如下图。在 Data 分栏中输入以下数据软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图2.2 根据 Table6 的原始数据做两组数据比较的柱状图Table 6Group A Group BControl0.942 0.846 0.691 0.515, 0.717 0.836 0.653 0.483Treated 0.408 0.367 0.342 0.231 0.451 0.409 0.335 0.196这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择 grouped 栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped 栏并不是像 Column graphs 栏一样默认输入的是原始数
3、据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是 4,因此我们相应地设置样本为 4,见下图。在 Data 分栏中输入以下数据软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。2.3 如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到 Graphpad,现在我们用Table7 中的数据做一个柱状图Table 7Control Mean SD A 1.000 0.17B 1.725 0.21C 2.133 0.41D 1.859 0.56仍然选择 Grouped 栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图软件及时生成柱状图,如下图2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图用 Table 8 的数
4、据做成两组比较的柱状图Control TreatedA 1.000 0.17 3.604 0.31B 1.725 0.21 2.534 0.43C 2.133 0.41 3.381 0.74D 1.859 0.56 3.913 0.93操作步骤和 2.3 一样,只需多输入一组数据,仍然选择 Grouped 栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图在 data 栏中输入数据软件即时生成的图如下图折线图和柱状图的处理都讲完了,在 graphpad 数据表类型的选择上小编总结出了 2 条规律一折线图,散点图这种有一一对应的 X,Y 值一般都选择 XY 栏二柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件
5、计算的选择 column 栏,处理加工过的数据一般选择 group 栏。折线图折线图作为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的 X 轴值和 Y 轴值,所以我们在用 graphpad 做折线图时在数据表类型的选择上一般选 XY 图(XY graphs)。如下文实例。1.1 根据 Table1 的 1 组原始数据(4 个样本在 4 个时间点分别测得的 OA 值)做折线图打开 Graphpad prism 5 软件,选择 XY 图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的 Y 值的样本数
6、是多少,这边的样本数是 4,因此我们把样本数设为 4,如下图Time (days) OA0. 0.942 0.846 0.691 0.5154. 0.717 0.836 0.653 0.48324. 0.408 0.367 0.342 0.23148. 0.451 0.409 0.335 0.196在 Data 分栏中将数据粘贴进去,如下图软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了。1.2 根据 Table2 的原始数据(治疗组和对照组的 4 个样本在 4 个时间点分别测得的 OA 值做折线图打开 insert 菜单的
7、New Data Table 功能,加入一张新的数据表,见下图仍然选择 XY 图(XY graphs),告诉软件样本数是 4Time (days) Control Treated0. 0.717 0.942 0.691 0.303 0.942 0.846 0.691 0.5154. 0.836 0.527 0.988 0.321 0.717 0.836 0.653 0.48324. 0.653 0.401 0.691 0.169 0.408 0.367 0.342 0.23148. 0.483 0.342 0.776 0.917 0.451 0.409 0.335 0.196在 Data 栏中
8、输入数据软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图1.3 用已经处理好的 1 组数据做折线图如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc.)已经处理过的,Graphpad prism 也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用 Table3 的 1 组数据做折线图Table3OATime (days) Mean SD0. 1.000 0.174. 1.725 0.2124. 2.133 0.4148. 1.859 0.56新建一个数据表,仍然选择 XY 图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图在 data 栏中
9、粘贴数据,如下图打开 Graphs 栏目下的 Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了1.4 用已经处理好的 2 组数据做折线比较图如果要用 Table4 所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和 1.3 的一样。Control TreatedTime (days) Mean SD Mean SD0. 1.000 0.17 3.604 0.314. 1.725 0.21 2.534 0.4324. 2.133 0.41 3.381 0.7448. 1.859 0.56 3.913 0.93仍然选择 XY 图(XY graphs),告诉软件你输入的是计
10、算好的值,见下图将数据粘贴进去软件即时生成的图如下图所示折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做2.3.组合和导出图片点击 layout 栏,出现下图所示界面根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是 6 张图分成 3 排排列将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示然后导出图片点击 File 目录下的 Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关 SCI 杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图点击 ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图4.压缩图片由于导出的图片文件太大,不利于投稿时的网络传输,我们需要使用 photosh
11、op 对图片进行无损压缩。我们用 photoshop 打开这张刚导出的图片。用 photoshop 打开图片后你可以做一些自己需要癿修改,这个就看你的需要了。然后我们点击”文件“-”存储“(或存储为)。保存的时候我们依然选择 tiff 格式。注意如果你在 photoshop 中修改过图片,特别是新建过图层的话,保存的时候要确保下面癿”图层“前面的勾没有勾上(保存图层会让图片大小增大不便于网络传输)。保存癿时候会跳出 tiff 选项,如下图。这里我们选择 LZW 压缩。(这是一种无损压缩。你可以形象癿理解为不压缩前,图片连续癿白色部分有比如 10000 个像素,要连续记录一万次。而采用 LZW 压缩癿时候图片采叏另外一种记录方式”接下来有一万个像素“。通过这样的方式可以大大的减少这种有很大白色面积的线条图的大小。当然啦,只是便于你理解。真实的压缩算法不是这样的。图表类图、黑白的图、都建议用 LZW 压缩方式)保存后我们看看现在的图片吧,如下图。大小压缩到 241KB,依然是尺寸上 3734*3024 像素。由于是无损压缩,图片质量是没有任何损失的。