分兩大節：一、從聖教中安立阿賴耶識二、在理論上成立阿賴耶識所知依分第一58 所知依異名n阿賴耶識n阿陀那識n心n阿賴耶n根本識n窮生死蘊n異熟識：異時而熟、異類而熟、變異而熟59 從聖教中安立阿賴耶識分兩科一、釋名以證本識之有體二、遮異釋60 釋名以證本識之有體分四科甲、阿賴耶教（分二：引經證、釋名義）乙、阿陀那教（分二：引經證、釋名義）丙、心教（分三：引教、釋意、釋心）丁、聲聞異門教戊、總結成立61 第二章、所知依 第一節、從聖教中安立阿賴耶識 第一項、釋名以證本識之有體 甲、阿賴耶教 一、引經證 此中最初且說所知依，即阿賴耶識 世尊何處說阿賴耶識名阿賴耶識？ 謂薄伽梵於《阿毗達磨大乘經》伽陀中說：無始時來界，一切法等依，由此有諸趣，及涅槃證得62 伽陀n即偈頌，又分為：q孤起頌（伽陀、偈陀）：與前後文沒有關係 例如：諸行無常，是生滅法； 生滅滅已，寂滅為樂q重頌（祇夜、耆夜）：重說長行的文義 例如：一切有為法，如夢幻泡影， 如露亦如電，應作如是觀63 無始時來界n無始：向前推不到第一因n界：因，即種子64 一切法等依，由此有諸趣n一切法：心王、心所、色法、不相應行法n諸趣：q三界：欲界、色界、無色界q五趣：n天（欲界天、色界四禪天、無色界四空天）n人n地獄n餓鬼n畜生n這顯示流轉的相貌65 及涅槃證得n顯示由於阿賴耶識能攝藏清淨法種子，所以能證涅槃66 即於此中復說頌曰：由攝藏諸法，一切種子識，故名阿賴耶，勝者我開示。
勝者：菩薩顯此教理唯對菩薩開示67 無明無明↓行行生有生有本有本有死有死有中有中有生有生有識識↓名色名色 觸觸↑→六入六入→受受→愛愛→取取─→有有──→生生─→老死老死 二、釋名義n如是且引《阿笈摩》證復何緣故此識說名阿賴耶識？一切有生雜染品法於此攝藏為果性故；又即此識，於彼攝藏為因性故；是故說名阿賴耶識或諸有情攝藏此識為自我故，是故說名阿賴耶識69 阿笈摩n為「阿含」的異譯n意為「傳來」，過去經文以背誦方式口耳相傳；或說佛法的道理由過去諸佛展轉傳來n本來《阿含經》特指四部阿含：雜阿含、中阿含、長阿含、增一阿含現在泛指一切大小乘經典70 一切有生雜染品法n「有」即三有，即欲界有、色界有、無色界有n在三界受生，欲界有不善業；色界、無色界因為定力攝持，沒有粗顯的不善法，但是內心愛著自己所成就的定境，還有癡、愛、見、慢煩惱活動，所以都是雜染品法n或說「有生」就是有為法、生滅法、因緣法；但此處唯說「雜染品」，不說無漏清淨品71 於此攝藏為果性故n造業因的是前六識，前六識活動時，在阿賴耶識熏習成種子相對於造業，種子是果阿賴耶識(心田)末那識意識 眼 耳 鼻 舌 身 72 又即此識，於彼攝藏為因性故 n當果報現前時，有情自體、受用的境界是從阿賴耶識的種子生現行；阿賴耶識能生起一切法，一切法由阿賴耶識所攝，所以名為因識73 或諸有情攝藏此識為自我故，是故說名阿賴耶識n阿賴耶識的性格：q無覆──沒有煩惱心所相應；無記──苦、樂、捨三受中，唯與捨相應q恆轉如瀑流，阿羅漢位捨n阿賴耶識一類恆時相續無間，為一切法根本所依，第七識緣之故執為我n第七不執餘識為自我的原因：q餘識不常而有間斷；善、惡、無記三性前後轉易，非同一類74 乙、阿陀那教 一、引經證n復次，此識亦名阿陀那識。
此中《阿笈摩》者，如《解深密經》說： 阿陀那識甚深細，一切種子如瀑流， 我於凡愚不開演，恐彼分別執為我 75 n阿陀那：執持義n深：有我執的凡夫不能窺其底蘊──凡n細：二乘趣寂聲聞不能通達其微細境──愚76 二、釋名義n何緣此識亦復說名阿陀那識？執受一切有色根故，一切自體取所依故所以者何？有色諸根，由此執受，無有失壞，盡壽隨轉又於相續正結生時，取彼生故，執受自體是故此識亦復說名阿陀那識 77 n執受：執持而有覺受q執謂執持，令不壞爛q受謂領受q安危共同，識去身固壞，身壞識亦去n一切自體取所依故q自體：三界五趣的根身如胎生者正結生時，執取父母精血攝為自體n「相續」有情異名，心識相續生命不斷，故名相續n結生；捨前生已另取餘生，由識執受得彼生故，名為結生78 丙、心教 一、引教 此亦名心如世尊說：心、意、識三 此中意有二種第一、與作等無間緣所依止性、無間滅識，能與意識作生依止第二、染汙意，與四煩惱恆共相應一者、薩迦耶見；二者、我慢；三者、我愛；四者、無明此即是識雜染所依識復由彼第一依生，第二雜染；了別境義故等無間義故、思量義故，意成二種79 等無間意（緣）；八識心王都有等無間緣第一念第二念第三念第四念…………眼識→意識→…………意識→耳識→眼識→意識→……………………深度睡眠…………意識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→80 染汙意阿賴耶識(心田)末那識第七識（末那識）活動時，念念與薩迦耶見、我慢、我愛、無明一起活動使得前六識都被我見、我慢、我愛及無明染汙了我見、我慢、我愛及無明81 n薩迦耶見：「薩迦」是身，或名壞聚；我們的色、受、想、行、識會變異，名為壞聚。
其中沒有常恆住、不變異的體性，但是外道認為其中有我，名壞聚見 此處指第七識執著第八識為我此處指第七識執著第八識為我n有我的執著→我慢（心高舉）n有我就有我愛→貪n身見、慢、貪，都是因為無明（不明白緣起無自性的道理）而生起；因無明而有生死82 七種慢（六識）n慢：於劣計己勝，於似計己似n過慢：於似計己勝，於勝計己等n慢過慢：於勝計己勝n我慢：第六識執著五蘊有我；第七識執阿賴耶識為我n增上慢：未得謂得，未證謂證n下劣慢：於勝計己少分劣n邪慢：實無德謂己有德83 因此論中說：n識（前六識）復由彼第一依（等無間緣）生；即前一念識要滅去，第二念才生起n究實說，八個識都要前一念滅去第二念才生起，都有各自的等無間緣n（前六識）由第二（染汙意）而雜染84 了別境義：前六識阿賴耶識(心田)末那識不緣外境，唯緣阿賴耶識意識 眼 耳 鼻 舌 身 外境85 結 識復由彼第一依生，第二雜染；了別境義故等無間義故、思量義故，意成二種86 ２、染意存在之理證 復次，云何得知有染汙意？謂此若無，不共無明則不得有，成過失故又五同法亦不得有，成過失故所以者何？以五識身必有眼等俱有依故。
又訓釋詞亦不得有，成過失故又無想定與滅盡定差別無有，成過失故謂無想定染意所顯，非滅盡定；若不爾者，此二種定應無差別又無想天一期生中，應無染污成過失故，於中若無我執我慢又一切時我執現行現可得故，謂善、不善、無記心中；若不爾者，唯不善心彼相應故，有我、我所煩惱現行，非善無記是故若立俱有現行，非相應現行，無此過失87 一、不共無明n又名為恆行無明n第六識的無明有時候不行，例如起善念、作善事的時候；n但是第七識的無明沒有間斷；是生死輪迴的根本88 二、五同法n又名為五同法喻n眼識要依眼根才能了別青黃赤白的色境；耳識要依耳根而了別聲境；鼻識要依鼻根才能了別氣味；舌識要依舌根才能了別味境；身識要依身根才能了別觸境；n依五同法喻，第六識（精神性的活動）也要依止根才能在境界上活動；顯示第七識是第六識的根89 三、訓釋詞n「訓」以簡釋難n心：集起，積集種子，生起現行n識：了別，認識色、聲、香、味、觸等境界n意：？理應指思量義n思量，恆審思量，即相續不間斷地執著阿賴耶識為我90 阿賴耶識→ 阿賴耶識→ 阿賴耶識→ 阿賴耶識→ 阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→末那→阿賴耶識→無想定是外道修的定，執著無想定是涅槃滅盡定是三果以上的聖人，已經得非想非非想處定，他作休息想，滅去第六識、第七識，入滅盡定四、無想定與滅盡定無差別；五者、無想天一期生中應無染汙91 六、一切時我執現行現可得n善心中有我執n不善心中有我執n非善非不善心中也有我執92 是故若立俱有現行，非相應現行，無此過失 n俱有現行：即第七識相應的我執，比喻如地球的自轉n相應現行：第六識相應的我執，如在地球上的有情自主性的一切活動93 不承認染汙意的過失：n一、不共無明的教法不成立；n二、五同法喻不成立；n三、訓釋詞不成立；n四、無想定、滅盡定二定無差別；n五、生無想天的有情應無我執生起；n六、一切有情恆有我執隨逐，若不承認，則善心、無記心中應無我執 94 以四頌作結 此中頌曰：此中頌曰： 若不共無明，及與五同法，訓詞，二定別，無皆 若不共無明，及與五同法，訓詞，二定別，無皆成過失。
成過失 （（無想生應無無想生應無，，我執轉我執轉））成過成過我執我執恆恆隨逐隨逐，， 一切種，無一切種，無有有 離染 離染意意無有無有，，二三成二三成相違，無相違，無此此（（一切處一切處，， 我執不應有我執不應有）） 真義心當生，常能為 真義心當生，常能為障礙障礙，，俱俱行一切行一切分分，，謂謂不不共共 無無明 95 第一頌 此中頌曰： 此中頌曰： 若不共無明，及與五同法，訓詞，二定別， 若不共無明，及與五同法，訓詞，二定別，無皆成過失無皆成過失n此即六種過失的前四種 96 第二頌 無想生應無我執轉成過；我執恆隨逐一切種無有（接下一頌的「離染意」） 若無染意，即有六種過失的第五、第六種 97 第三頌 （「一切種無有」）離染意，無有，二三成相違；無此，一切處我執不應有n第二、第三句重說五種過n「二三」不是序數，是分別指二事、三事：q「二事」：佛所開示的不共無明、五同法喻q「三事」：訓釋詞、二定別、無想生中我執恆行這三件事n一切時我執可得也不能成立；第六種過失展98 第四頌： 真義心當生，常能為障礙，俱行一切分，謂不共無明 n「真義心」即能證真理的心n如果沒有第七識，我們應當一切時都能見真理。
因為末那識的俱生我執作祟，令有情在一切時中都有我的執著而不能契入真理；從這個地方得知有不共無明的存在。