《动物育种学-第六章-个体遗传评定之选择指数法3》由会员分享,可在线阅读,更多相关《动物育种学-第六章-个体遗传评定之选择指数法3(29页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、遗传评定概述 单性状育种值估计 多性状综合遗传评定,Genetic Evaluation,个体遗传评定,第三节 多性状综合遗传评定,多性状选择概述 综合选择指数的估计 选择指数应用的注意事项,多性状选择概述,育种工作中,不仅希望单个性状得到改进,更追求在多个性状上同时获得进展 畜禽的育种目标涉及多个性状: 奶牛:产奶量、乳脂率、乳蛋白率 猪:日增重、瘦肉率和产仔数 蛋鸡:产蛋数和蛋重 绵羊:剪毛量、毛长和细度,?,多性状选择概述,多性状选择方法,顺序选择法(tandem selection) 指对育种目标中待选择的几个性状逐一进行选择 例如奶牛的育种目标:产奶量、乳脂率、乳蛋白率 缺点:花时太
2、长、性状的选择顾此失彼,已不使用,多性状选择概述,产奶量,乳脂率,乳蛋白率,2-3个世代,2-3个世代,2-3个世代,独立淘汰法(independent culling) 指育种目标中包含的每个性状都有一个最低选择标准,各性状都超过相应标准的个体留作种畜 改进:同时考虑多个性状,优于顺序淘汰法 缺点:选择的个体可能在各性状上都表现平平,多性状选择概述,综合选择法(index selection,I ) 根据育种目标中各性状的遗传基础和经济重要性,分别给予各性状一个适当的加权系数,综合到一个指数中,根据指数的大小进行选择 选择效果优于独立淘汰法和顺序选择法,多性状选择概述,独立淘汰法,顺序选择法
3、,综合选择法,综合选择指数的特征 反映的个体种用价值较为全面 不仅考虑性状的遗传基础和经济重要性,而且还考虑性状间的遗传相关 选择效率较高,在BLUP之前被广泛应用,综合选择指数,多性状选择概述 综合选择指数的估计 选择指数应用的注意事项,综合选择指数的基本公式:,综合选择指数的估计,I、AT:综合选择指数 Wi:第 i 个性状的经济加权值 Ai:第 i 个性状的育种值,根据各性状在育种和经济上的重要性,给予相应的经济加权值,I 的计算公式:,综合选择指数的估计,矩阵形式:,b: 含遗传基础和经济意义的偏回归系数向量 p : 为不同来源的信息性状表型值,多元回归方法,:与p对应的均数,综合选择
4、指数的估计,综合选择指数计算的关键步骤: 偏回归系数b的计算 计算偏回归系数的正规方程组(求极大值方法),V:信息性状表型值之间的方差协方差矩阵 D:被估个体与信息来源个体间的亲缘系数对角矩阵 A:信息性状与目标性状间的遗传方差协方 差矩阵 w:经济加权值向量,(6-16),目标性状与信息性状 目标性状:综合育种值所包含的性状,即育种目标中待改进的性状(如:产奶量、乳脂量) 信息性状:育种值估计中提供信息资料的性状 (如:产奶量、乳脂率),估计综合选择指数的步骤:,综合选择指数的估计,例: 对某奶牛场的青年公牛进行综合选择指数计算,目标性状为乳脂量和日增重。 已知一公牛现有如下信息性状记录:
5、母亲乳脂量PD1=170kg, 对应均数为140kg 父亲日增重PS2=1180g, 对应均数为1290g 本身日增重PE2=1350g, 对应均数为1300g,综合选择指数的估计,综合选择指数的估计,两性状的经济加权值和有关遗传参数为:,两性状间的遗传相关,解:先求矩阵 , 结果如下:,综合选择指数的估计,综合选择指数的估计,于是,,综合选择指数的估计,偏回归系数为:,综合选择指数的估计,综合选择指数为:,评价综合选择指数准确度的指标:真实育种值与选择指数间的相关系数rAI,综合选择指数的估计,综合选择指数的估计,本例的综合选择指数准确度为:,多性状选择概述 综合选择指数的估计 应用选择指数
6、法的注意事项,应用选择指数法的前提 不存在系统环境效应 被估个体与表型观测值来源于同一总体 遗传参数已估计出来,选择指数应用的注意事项,满足上述条件时,估计育种值为最佳线性无偏估计。I 的应用受到上述条件的制约,制定选择指数的注意事项 1) 目标性状 要突出。一个选择指数包括24个最重要的性状 例如:种公猪包括达100kg体重日龄和活体背膘 种母猪再增加总产仔数性状 避免有高的负遗传相关性状。必须考虑时,可合并为一个性状,如产奶量与乳脂率合并为4标准奶,综合选择指数应用的注意事项,2) 信息性状 易于度量:日增重、活体背膘、饲料利用率 早期性状:头胎产奶量,育种值估计方法,选择指数法,BLUP法,MBLUP法,育种值估计的初级阶段,目前广为应用的育种值估计方法,未来的育种值估计方法,Thank you!,