《大豆芽菜相关性状QTL的关联定位》由会员分享，可在线阅读，更多相关《大豆芽菜相关性状QTL的关联定位（69页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、A S S O C I A T l 0 NM A P P I N Go FQ U A N T I T A T I V ET R A I TL O C Io FS o Y B E A NS P R O U T R E L A T E DT R A I T SB yL e iJ u nT h eT h e s i sS u b m i t t e dt oN a n ji n gA g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t yN a n j i n gP R C h i n aI nP a r t i a lF u l f i l l m e n to ft h
2、 eR e q u i r e m e n t sf o rT h eM a s t e rD e g r e eS u p e r v i s e dB vP r o f e s s o rX i n gH a nC o m p l e t e di n2 01 2原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者( 需亲笔) 签名：t 彰彳I 釜
3、) 。2 年s 月五沔学位论文作者( 需亲笔) 签名：留彳笙 力f ) 年。( 月2 泊义VP 。一。鼬。学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权南京农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编学位论文。保密口，在年解密后适用本授权书。本学位论文属于不保密匈( 请在以上方框内打“”)学位论文作者( 需亲笔) 签名：移气殳导师( 需亲笔) 签名：劢j 年0 月西日加f 力年5 月万目目录目录摘要IA B S
4、 T R A C T I I I缩略词表V第一章文献综述l1 大豆芽菜研究概况l1 1 大豆芽菜生产方法11 2 大豆芽菜的营养价值及其保健功能21 3 大豆芽菜相关性状的研究31 4 大豆芽菜遗传与育种的研究32 关联分析简介52 1 连锁不平衡62 2 关联分析的基本方法92 3关联分析与连锁作图的比较1 12 4 关联分析在植物研究中的应用及发展趋势1 23 本研究的目的与技术路线1 5第二章材料与方法1 71 实验材料172 实验设计与表型数据测量1 73D N A 提取1 74 标记的选取与P C R 扩增1 74 1S S R 标记的选取1 74 2P C R 扩增及产物检测185
5、 数据分析1 85 1 表型数据分析1 85 2 位点多态性分析185 3 群体结构( Q 矩阵) 分析185 4 连锁不平衡估算1 95 5 性状与标记间的关联分析1 9第三章大豆芽菜相关性状的分析与优异种质筛选2 11 结果与分析2 1大豆芽菜相关性状Q T L 的关联定位1 1 大豆芽菜鲜产量及其相关性状的变异2 11 2 大豆芽菜鲜产量及其相关性状间的相关性分析2 21 3 高产大豆芽菜品种筛选2 32 讨论2 42 1大豆芽菜实验条件的控制2 42 2 大豆用量的选择2 52 3 大豆芽菜相关性状的研究2 5第四章大豆芽菜相关性状的关联定位。2 71 结果与分析2 71 1S S R
6、 标记遗传多样性分析2 71 2 连锁不平衡分析2 71 3 关联分析群体的群体结构分析2 91 4 大豆芽菜产量及其相关性状的关联分析3 01 5与大豆芽菜相关性状稳定关联标记位点的优异等位变异发掘3 32 讨论3 52 1遗传多样性及群体结构分析3 52 2 大豆芽菜相关性状Q T L 位点同己报到位点的比较3 52 3 与多性状同时关联的标记位点3 62 4 优异等位变异在育种中的应用3 7第五章全文结论和创新点3 91 全文结论3 92 创新点4 0附录4 1参考文献。5 3致谢6 1摘要大豆芽菜相关性状Q T L 的关联定位摘要大豆芽菜是大豆种子在人工控制适宜的温度和水分条件下，经过
7、萌芽生长而成的一种芽苗蔬菜，是我国的传统优质蔬菜，有着悠久的生产和食用历史。大豆芽菜相关性状多由多基因控制的数量性状，对这些数量性状进行定位，不仅能了解这些数量性状的遗传规律，所定位的数量性状位点( Q T L ) 也能作为基因克隆的基础和分子标记辅助选择的依据。本研究选用大豆微核心种质为研究材料，进行了2 年的重复实验。在对该群体大豆芽菜鲜产量、干产量、芽长、根长、成芽率和百粒重6 个性状的表型变异分析基础上，利用1 3 8 个S S R 标记对这6 个性状进行关联定位分析。主要结果如下：1 大豆芽菜鲜产量、干产量、芽长、根长、成芽率和百粒重6 个性状的变异范围十分广泛，品种间差异达极显著水
8、平，适于进行关联分析。相关分析表明，大豆芽菜鲜产量与其他5 个性状显著相关，初步筛选出1 4 份鲜产量较高的材料。2 1 3 8 个S S R 标记在2 4 3 份大豆材料中共检测出7 5 2 个等位变异，每个标记检测出2 1 6 个等位变异，平均5 4 5 个。每个位点的多态性信息量( P I C ) 变化为0 2 0 4 0 8 6 4 ，平均为0 5 6 9 ，其中引物S a t0 7 4 位点的P I C 最大为O 8 6 4 ，引物S a t t 4 0 5位点的P I C 最小为0 2 0 4 。3 在2 0 个连锁群上1 3 8 个S S R 位点的9 4 5 3 种两两位点组合
9、中，不论共线性组合，还是非共线性组合，都有一定程度连锁不平衡( L D ) 存在。不平衡程度D I 0 5的组合数较少，仅占总位点组合的O 1 8 ，得到统计概率( P 0 5W a sv e r ys m a l l ，w h i c hW a so n l y0 18 o ft o t a l B a s e do nt h er e s u l t s ，w ef o u n dD o fm i n iC O r ec o l l e c t i o n so fc u l t i v a t e ds o y b e a ni nC h i n aw a sr a p i dd e c
10、 a yw i t hg e n e t i cd i s t a n c e A c c o r d i n gt ot h eH a r d y - W e i n b e r gI I I大豆芽菜相关性状Q T L 的关联定位e q u i l i b r i u mm o d e l ，t h em i n ic o r ec o l l e c t i o n so fc u l t i v a t e ds o y b e a r lmC h i n aw e r ed i v i d e di n t ot w os u b p o p u l a t i o n sb yS T
11、 R U C T U R Es o f t w a r e A s s o c i a t i o nm a p p i n ga n a l y s i sw a sc o n d u c t e db yu s i n gt h eG L Mm o d e lw i t l lt h em o d i f i e dp o p u l a t i o ns t r u c t u r ea sc o v a r i a n t U n d e rt h es i g n i f i c a n c el e v e lb e l o w0 0 5 ，t w e n t y e i g h tm a r k e r sl i n k e dt os i xs o y b e a ns p r o u t r e l a t e dt r a i t s 4 U n d e rt h es i g n i f i c a n c el e v e lb e l o w0 01 ，e i g h tm a k e r sl i n k e dt o10 0 - s e e dw e i g h t ，t w ol i n k e dt of r e
