《一维体系的DMRG方法和缩水甘油及其水复合物VCD的理论研究》由会员分享，可在线阅读，更多相关《一维体系的DMRG方法和缩水甘油及其水复合物VCD的理论研究（161页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、山东大学博士学位论文一维体系的DMRG方法和缩水甘油及其水复合物VCD的理论研究姓名：孙文起申请学位级别：博士专业：物理化学指导教师：刘成卜20070420山东大学博士论文的关系：生化反应过程的立体选择性与分子的立体构型之间的关系：各类天然有机物分子的立体构型与它们表现出的生物活性之间的关系；还有高分子材料的立体构型与性能之间的关系等等，已经成为当今化学的一个非常重要的研究领域。在自然界，特别是在生物体中，手住( c h i r a l i t y ) 化合物是广泛存在的。手性这个命题对于化学、分子生物学、医学和药学的理论和实践都有重大的意义。由于自然界生命体存在的手性属性，也就产生了药物的手
2、性问题。手性药物是手性化合物的重要组成部分，在许多情况下，手性化合物的一对对映体在生物体内的药理活性、代谢过程、代谢速率及毒性等均存在显著的差异，可能存在以下不同的情况：( 1 ) 只有一种对映体有活性，而另种无显著的药理作用；( 2 ) 两个对映体具有等同或相近的同一药理活性；( 3 ) 两个对映体具有完全不同的生理活性：( 4 ) 两个对映体中一个有活性，另一个不仅没有活性，反而有毒副作用；( 5 ) 对映体中两个都有相近的活性面从全面平衡仍宜选用单一异构体；( 6 ) 对映体中，一个有活性而另一个不但没有活性而且发生拮抗作用。由此可见，对手性化合物分子构型的鉴定是非常重要的，目前测定手性
3、化合物绝对构型的方法有以下几种：( 1 ) 应用圆二色性光谱和旋光谱测定分子构型：( 2 ) X 射线衍射法；( 3 ) 似外消旋的F r e d g e 方法；( 4 ) 利用非对映异构体性质的经验关系；( 5 ) 用化学相关法确定手性化合物的绝对构型。其中圆二色谱方法具有：使用简便快速，需要的样品量相对较少，且对样品无破坏等优点，所以它已经成为现代分子生物学研究的重要手段。圆二色谱方法可以测定手性分子的构型，在核酸、多糖等生物聚合物的研究方面也有大量的应用。圆二色光谱在测定子性化合物的构型和构象、确定某些山东大学博士论文官能团( 如羰基) 在手性分子中的位置方面有独到之处，是其他光谱无法代
4、替的缩水甘油( g l y c i d 0 1 ) 分子具有手性，是一种十分重要的环氧化合物( c p o x i d c s ) 主要用作环氧树脂稀释荆，塑料和纤维改性剂、卤代烃类稳定剂、食品保藏剂、杀菌剂、制冷系统干燥剂、芳烃萃取剂等。其衍生物是树脂、塑料和助剂等重要的工业原料。缩水甘油及其衍生物也是合成抗癌药的前体( s t a r t i n gm a t e r i a l s ) 。另外，缩水甘油具有毒性，它能中度刺激皮肤和粘膜。可使中枢神经系统兴奋继而抑郁。工业生产主要是以烯丙醇为原料，采用过氧化氢环氧化法和过乙酸环氧化法制备。然而，对缩水甘油的分子结构的研究却非常有限，我们从理
5、论上研究了( S ) 一缩水甘油及其水复合物的振动吸收光谱和圆二色性光谱，对它们的不同构型的稳定性以及分子内、分子间氢键的作用作了详细深入的探讨。本论文在简单介绍一些量子力学基础理论及密度矩阵重整化群方法常用到的几个哈密顿模型后，详细推导了密度矩阵重整化群方法中无限链长算法和有限链长算法的计算公式，讨论了密度矩阵重整化群方法的一些内禀性质，运用所编写的密度矩阵重整化群方法的程序对一维及准一维体系进行了计算，另外，推导出计算圆二色性光谱强度所需的基本物理量的公式，计算了( S ) 一缩水甘油及其水复合物圆二色性光谱，从理论上详细分析了( s ) 一缩水甘油及其水复合物不同构型的稳定性以及不同构象
6、、构型间圆二色性光谱的区别。主要取得如下结果：( I ) 从模型哈密顿出发，推导了密度矩阵重整化群方法的基本公式，例如：新系统块( 系统块加计算原胞) 、新环境块( 环境块加计算原胞) 以及体系超块哈密顿量的构造公式，由基态波函数构造密度矩阵公式等。并且对传统的密度矩阵重整化群方法加以改进，即在构造环境块的哈密顿量时，不再简单地使用系统块的映射。而是根据具体问题重新构造环境块哈密顿量。编写了密度矩阵重整化群方法无限链长算法和有限链长算法的F o r t r a n 程序，并对一维H e i s e n b e r g 链以及准二维体系的聚省m山东大学博士论文I V和聚菲苯环链进行了计算，计算结
7、果令人满意。( I I ) 运用密度泛函理论研究了( S ) - 缩水甘油各种稳定构型的能量、振动吸收光谱以及圆二色性光谱。找到( S ) 一缩水甘油8 个稳定构型，分析了分子内氢键以及环状结构对分子稳定性的作用，根据( S ) 一缩水甘油不同构型振动吸收光谱中o - H 伸缩振动频率的红移，以及c - o - H 弯曲频率的篮移，可以推断哪些构型中有分子内氢键形成；为了迸一步鉴定两个含有分子内氢键的构象之间几何结构的区别，可以根据( S ) 一缩水甘油不同构型的圆二色性光谱的差别，推断两个有分子内氢键的构型的绝对结构从理论上说明圆二色性光谱是研究手性分子绝对构型的主要手段。( I I I )
8、 运用密度泛函理论研究了( s ) 缩水甘油水复合物的各种稳定构型的能量、振动吸收光谱以及圆二色性光谱。结果表明，非手性分子( T k ) 与手性分子( 缩水甘油) 形成复合物时也表现出光活性；同时为开发圆二色性光谱在研究手性分子与非手性分子复合物构型方面的应用提供了理论支持。山东大学博士论文A b s t r a c tT h ed e n s i t y - n 曲i xr e n o r m a l i z a t i o ng r o u p ( D 黼e s t a b l i s h e d0 1 1t h eb a s i so ft h eW i l s o n sn u m
9、e r i c a lr c n o r m a l i z a t i o ng r o u pm e t h o d , t h ek e yp o 证o fw h i c hw a st h a tt h ed e c i m a t i o np i o o 剃u r oo ft h eH i l b e f ts p a c ei st ot a k et h el o w e s t - l y i n ge i g e u s t a t e so ft h ec o m p o u n db l o c k H o w e v a f , t h et n m e a t i
10、o np r o c e d u r et os y s t e ms t a t e so fD M R Gp r e s e r v e sam a x i m u mo fs y s t e m - e n v i r o n m e n te n t a n g l e m e n tb a s i n go nt h ee i g e n v a l u e so ft h er e d u c e dd e n s i t y - m a t r i 】LS i n c et h ed e n s i t y - m a ( x i xr e n o r m a l i z a t
11、 i o ng r o u pw a so r i g i n e db yS W h i t ei n1 9 9 2 ，i ti san u m e r i c a lM g o f i t h mf o rt h ee f f i c i e n tt r u n c a t i o no ft h eH i l b e r ts p a c eo fl o w - d i m e n s i o n a ls t r o n g l yc o r r e l a t e dq u a n t u ms y s t e m sb a s e do nar a t h e rg e n e
12、r a ld e c i m a t i o np r e s c r i p t i o n D M R Gc a nb eu s e dt oc a l c u l a t em o r el a r g em a n y - b o d yp r o b l e mt h a ne x a c td i a g o n a l i z a t i o n D ) ，a n dD M R Gh a sn on e g a t i v e - s i g np r o b l e mt h a tp l a g u e st h eq u a n t u mM o n t eC a r l
13、o ( Q M C ) m e t h o d I tw a st h en e g a t i v e - s i g np r o b l e mt h a tl i m i t e dQ M Cb e e n u s e df o rf i - u s t r a t e ds p i no rf e r m i o n i cs y s t e m D M R Gh a sa c h i e v e du n p r e c e d e n t e dp r e c i s i o ni nt h ed e s c r i p t i o no fo n e - d i m e n s
14、 i o n a lq u a n t u ms y s t e m s I th a st h e r e f o r eq l l i c k l yb e c o m et h em e t h o do fc h o i c ef o rn u m e r i c a ls t u d i e so fs u c hs y s t e m s I t sa p p l i c a t i o n st ot h ec a l c u l a t i o no fs t a t i c ，d y n a m i c ( w i t ht h eh d po fG r e e nf u n
15、 c t i o nm e t h o d ) , a n dt h e r m o d y n a m i cq u a n t i t i e s ( c o m b i n e dw i t ht h e 订a n s f c rm a u i xr e n o r m a l i z a f i o ng r o u p , n 曝G ) i nt h e s es y s t e m sa r ed e v e l o p e d Af i e l di nw h i c hD I V I R Gw i l lm a k ei n c r e a s i n g l yi m p o
16、 r t a n tc o n t r i b u t o n si nt h en e x tf e wy e a r si sq u a n t u mc h e m i s t r y W h i l et h ef i r s tq u a n t u m - c h e m i c a lD M R Gc a l c u l a t i o n so nc y c l i cp o l y e n ea n dp o l y a c e t y l e n ew e r es t i l lv e r ym u c hi nt h es p i r i to fe x t e n d e dH u b b a r dm o d e l s ，m o r er e c e n t w o r kh a sm o v e do nt oc a l c u l a t i o n si ng e n e t i cb a s e sw i t ha r b i t r a r yi n t e r a c t i o n s
