SDS-PAGE原理(中)

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1、过硫酸铵过硫酸铵 分子式分子式分子式分子式: : (NH4)2S2O8(NH4)2S2O8 分子量分子量分子量分子量: : 228.20228.20 性状:性状:性状:性状:过硫酸铵是一种白色、无味晶体,常作强氧化剂使用,过硫酸铵是一种白色、无味晶体,常作强氧化剂使用,也可用作单体聚合引发也可用作单体聚合引发剂剂。它几乎不吸潮,由于能达到很高的纯度而具有特别好的稳定性,便于储存。另外,。它几乎不吸潮,由于能达到很高的纯度而具有特别好的稳定性,便于储存。另外,它还具有使用方便、安全等优点。它还具有使用方便、安全等优点。储存及使用注意事项:储存及使用注意事项: 过硫酸铵属于非易燃品,但由于能释放氧

2、而有助燃作用,因此必须在一定条件下过硫酸铵属于非易燃品,但由于能释放氧而有助燃作用,因此必须在一定条件下储存。首先必须存放在干燥、密闭的容器中,其次应避免阳光直射、热源、潮湿等不储存。首先必须存放在干燥、密闭的容器中,其次应避免阳光直射、热源、潮湿等不利因素。另外,一些杂质如脏物、铁锈、少量金属以及还原剂可能引起过硫酸铵的分利因素。另外,一些杂质如脏物、铁锈、少量金属以及还原剂可能引起过硫酸铵的分解,在存放和使用过程中也必须注意。由于潮湿的过硫酸铵粉末及其水溶液有漂白和解,在存放和使用过程中也必须注意。由于潮湿的过硫酸铵粉末及其水溶液有漂白和轻微的腐蚀作用,因此使用过程中应避免眼睛、皮肤和衣物

3、直接与其接触。轻微的腐蚀作用,因此使用过程中应避免眼睛、皮肤和衣物直接与其接触。过硫酸铵的应用:过硫酸铵的应用:过硫酸铵提供驱动丙烯酰胺和双丙烯酰胺聚合所必需的自由基过硫酸铵提供驱动丙烯酰胺和双丙烯酰胺聚合所必需的自由基。须。须新鲜配制新鲜配制。 过硫酸铵是乳胶或丙烯酸单体聚合液、醋酸乙烯、氯乙烯等产品的引发剂,过硫酸铵是乳胶或丙烯酸单体聚合液、醋酸乙烯、氯乙烯等产品的引发剂,同时也是苯乙烯、丙烯腈、丁二烯等胶体发生共聚作用的引发剂。同时也是苯乙烯、丙烯腈、丁二烯等胶体发生共聚作用的引发剂。过硫酸铵过硫酸铵-TEMED(四甲基乙二胺)系统(四甲基乙二胺)系统:在:在Acr和和Bis的溶液中放入

4、这个的溶液中放入这个催化系统后,过硫酸铵催化系统后,过硫酸铵(NH4)2S2O8产生出游离氧原子使单体成为具有产生出游离氧原子使单体成为具有游离基的状态,从而发生聚合作用。聚合的初速度和过硫酸铵浓度的平方根游离基的状态,从而发生聚合作用。聚合的初速度和过硫酸铵浓度的平方根成正比。这种催化系统需要在碱性条件下进行。例如,在成正比。这种催化系统需要在碱性条件下进行。例如,在pH8.8条件下条件下7的丙烯酰胺溶液的丙烯酰胺溶液30分钟就能聚合完毕;在分钟就能聚合完毕;在pH4.3时聚合很慢,要时聚合很慢,要90分钟才分钟才能完成。温度与聚合的快慢成正比。通常在室温下就很快聚合,温度升高聚能完成。温度

5、与聚合的快慢成正比。通常在室温下就很快聚合,温度升高聚合更快。如将混合后的凝胶溶液放在近合更快。如将混合后的凝胶溶液放在近0的地方,就能延缓聚合。一般来的地方,就能延缓聚合。一般来讲,温度过低,有氧分子或不纯物质存在时都能延缓凝胶的聚合。为了防止讲,温度过低,有氧分子或不纯物质存在时都能延缓凝胶的聚合。为了防止溶液中气泡含有氧分子而妨碍聚合,在聚合前须将溶液分别抽气,然后再混溶液中气泡含有氧分子而妨碍聚合,在聚合前须将溶液分别抽气,然后再混合。合。不连续系统由上层浓缩胶和下层的分离胶组成。浓缩胶(不连续系统由上层浓缩胶和下层的分离胶组成。浓缩胶(pH6.7,孔径大)主要,孔径大)主要作用是使样

6、品浓缩,使样品在未进入分离胶前,被浓缩成很窄的条带,从而提高作用是使样品浓缩,使样品在未进入分离胶前,被浓缩成很窄的条带,从而提高分离效果。分离胶(分离效果。分离胶(pH8.9,孔径小)通过分子筛效应和电荷效应,把样品中的,孔径小)通过分子筛效应和电荷效应,把样品中的各组分按分子量和电荷的大小而分开。各组分按分子量和电荷的大小而分开。如果要利用凝胶电泳测定某一蛋白质的分子量就必须将电荷效应去掉或减少到可如果要利用凝胶电泳测定某一蛋白质的分子量就必须将电荷效应去掉或减少到可以忽略不计的程度,使蛋白质泳动率的大小完全取决于分子量。如何去除电荷效以忽略不计的程度,使蛋白质泳动率的大小完全取决于分子量

7、。如何去除电荷效应呢?现常用的是十二烷基硫酸钠(应呢?现常用的是十二烷基硫酸钠(SDS)。)。SDS是一种阴离子去污剂。在电泳是一种阴离子去污剂。在电泳体系中加入一定浓度的体系中加入一定浓度的SDS,SDS以一定的比例和蛋白质分子结合成复合物,使以一定的比例和蛋白质分子结合成复合物,使蛋白质分子带负电荷,这种负电荷远远超过了蛋白质分子原有的电荷,从而减低蛋白质分子带负电荷,这种负电荷远远超过了蛋白质分子原有的电荷,从而减低或消除了各种蛋白质分子天然电荷的差异。或消除了各种蛋白质分子天然电荷的差异。十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠 SDSSDS 是阴离子型表面活性剂,它能

8、按一定比例与蛋白质分子结合成带负电荷的复合物,是阴离子型表面活性剂,它能按一定比例与蛋白质分子结合成带负电荷的复合物,再与再与PAGE技术结合,则谱带差异更加明显、清晰,并可测定蛋白质分子量。技术结合,则谱带差异更加明显、清晰,并可测定蛋白质分子量。在有去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰胺凝胶电泳。在有去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰胺凝胶电泳。SDS-PAGE只是按照只是按照分子大小分离的,而不是根据分子所带的电荷和大小分离的。分子大小分离的,而不是根据分子所带的电荷和大小分离的。SDS带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带的负电荷大大超过了蛋白质原带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时

9、,所带的负电荷大大超过了蛋白质原有的负电荷,因而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,使蛋白质均有的负电荷,因而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而可利用带有相同密度的负电荷,因而可利用Mr差异将各种蛋白质分开。差异将各种蛋白质分开。最广泛使用的不连续缓冲系统最早是由最广泛使用的不连续缓冲系统最早是由Ornstein(1964)和和Davis(1964)设计的设计的,样品和浓缩胶中含样品和浓缩胶中含Tris-HCl(pH6.8),上下槽缓冲上下槽缓冲液含液含Tris-甘氨酸甘氨酸(pH8.3),分离胶中含分离胶中含Tris-HCl(pH8.8)

10、。系统中所有组。系统中所有组分都含有分都含有0.1%的的SDS(Laemmli,1970)。样品和浓缩胶中的氯离子形。样品和浓缩胶中的氯离子形成移动界面的先导边界而甘氨酸分子则组成尾随边界,在移动界面的两成移动界面的先导边界而甘氨酸分子则组成尾随边界,在移动界面的两边界之间是一电导较低而电位滴度较陡的区域边界之间是一电导较低而电位滴度较陡的区域,它推动样品中的蛋白质它推动样品中的蛋白质前移并在分离胶前沿积聚。此处前移并在分离胶前沿积聚。此处pH值较高,值较高,有利于甘氨酸的离子化,有利于甘氨酸的离子化,所形成的甘氨酸离子穿过堆集的蛋白质并紧随氯离子之后,沿分离胶泳所形成的甘氨酸离子穿过堆集的蛋

11、白质并紧随氯离子之后,沿分离胶泳动。从移动界面中解脱后,动。从移动界面中解脱后,SDS-蛋白质复合物成一电位和蛋白质复合物成一电位和pH值均匀的值均匀的区带泳动穿过分离胶,并被筛分而依各自的大小得到分离。区带泳动穿过分离胶,并被筛分而依各自的大小得到分离。甘氨酸甘氨酸浓缩效应:浓缩效应:凝胶由两种不同的凝胶层组成。上层为浓缩胶,下层为分离凝胶由两种不同的凝胶层组成。上层为浓缩胶,下层为分离胶。浓缩胶为大孔胶,缓冲液胶。浓缩胶为大孔胶,缓冲液pH6.7,分离胶为小孔胶,缓冲液,分离胶为小孔胶,缓冲液pH8.9。在上下电泳槽内充以在上下电泳槽内充以Tris甘氨酸缓冲液甘氨酸缓冲液(pH8.3),这

12、样便形成了凝胶孔,这样便形成了凝胶孔径和缓冲液径和缓冲液pH值的不连续性。在浓缩胶中值的不连续性。在浓缩胶中HCl几乎全部解离为几乎全部解离为Cl-,但只,但只有极少部分甘氨酸解离为有极少部分甘氨酸解离为H2NCH2COO-。蛋白质的等电点一般在。蛋白质的等电点一般在pH5左左右,在此条件下其解离度在右,在此条件下其解离度在HCl和甘氨酸之间。当电泳系统通电后,这和甘氨酸之间。当电泳系统通电后,这3种离子同向阳极移动。其有效泳动率依次为种离子同向阳极移动。其有效泳动率依次为Cl-蛋白质蛋白质H2NCH2COO-,故,故C1-称为快离子,而称为快离子,而H2NCH2COO-称为慢离子。电称为慢离

13、子。电泳开始后,快离子在前,在它后面形成离子浓度低的区域即低电导区。泳开始后,快离子在前,在它后面形成离子浓度低的区域即低电导区。电导与电压梯度成反比,所以低电导区有较高的电压梯度。这种高电压电导与电压梯度成反比,所以低电导区有较高的电压梯度。这种高电压梯度使蛋白质和慢离子在快离子后面加速移动。在快离子和慢离子之间梯度使蛋白质和慢离子在快离子后面加速移动。在快离子和慢离子之间形成形成个稳定而不断向阳极移动的界面。由于蛋白质的有效移动率恰好个稳定而不断向阳极移动的界面。由于蛋白质的有效移动率恰好介于快慢离子之间,因此蛋白质离子就集聚在快慢离子之间被浓缩成介于快慢离子之间,因此蛋白质离子就集聚在快

14、慢离子之间被浓缩成条狭窄带。这种浓缩效应可使蛋白质浓缩数百倍。条狭窄带。这种浓缩效应可使蛋白质浓缩数百倍。电荷效应电荷效应:样品进入分离胶后,慢离子甘氨酸全部解离为负离子,泳动:样品进入分离胶后,慢离子甘氨酸全部解离为负离子,泳动速率加快,很快超过蛋白质,高电压梯度随即消失。此时蛋白质在均一速率加快,很快超过蛋白质,高电压梯度随即消失。此时蛋白质在均一的外加电场下泳动,但由于蛋白质分子所带的有效电荷不同,使得各种的外加电场下泳动,但由于蛋白质分子所带的有效电荷不同,使得各种蛋白质的泳动速率不同而形成一条条区带。但在蛋白质的泳动速率不同而形成一条条区带。但在SDS-PAGE电泳中,电泳中,由于由

15、于SDS这种阴离子表面活性剂以一定比例和蛋白质结合成复合物,使这种阴离子表面活性剂以一定比例和蛋白质结合成复合物,使蛋白质分子带负电荷,这种负电荷远远超过了蛋白质分子原有的电荷差蛋白质分子带负电荷,这种负电荷远远超过了蛋白质分子原有的电荷差别,从而降低或消除了蛋白质天然电荷的差别;此外,由多亚基组成的别,从而降低或消除了蛋白质天然电荷的差别;此外,由多亚基组成的蛋白质和蛋白质和SDS结合后都解离成亚单位,这是因为结合后都解离成亚单位,这是因为SDS破坏了蛋白质氢键、破坏了蛋白质氢键、疏水键等非共价键。与疏水键等非共价键。与SDS结合的蛋白质的构型也发生变化,在水溶液结合的蛋白质的构型也发生变化

16、,在水溶液中中SDS-蛋白质复合物都具有相似的形状,使得蛋白质复合物都具有相似的形状,使得SDS-PAGE电泳的泳动电泳的泳动率不再受蛋白质原有电荷与形状的影响。因此,各种率不再受蛋白质原有电荷与形状的影响。因此,各种SDS-蛋白质复合蛋白质复合物在电泳中不同的泳动率只反映了蛋白质分子量的不同。物在电泳中不同的泳动率只反映了蛋白质分子量的不同。Acr-Bis产品简介:产品简介:40%Acr-Bis(39:1)即为含即为含40acrylamide-bisacrylamide的水溶液,其中的水溶液,其中acrylamide和和bisacrylamide的比例为的比例为39:1。40%Acr-Bis

17、(39:1)常用于配制各种常用于配制各种PAGE凝胶,例如凝胶,例如EMSA凝胶、凝胶、RPA凝胶等,凝胶等,可以用于蛋白或核酸等的分离,是实验室的常用可以用于蛋白或核酸等的分离,是实验室的常用储备液。储备液。保存条件:保存条件:4避光保存。避光保存。注意事项:注意事项:40%Acr-Bis(39:1)有一定毒性,使用时请注意适当防护。有一定毒性,使用时请注意适当防护。为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。 聚丙烯酰胺凝胶电泳是以聚丙烯酰胺凝胶作为载体的一种区带电泳。这种凝胶聚丙烯酰胺凝胶电泳是以聚丙烯酰胺凝胶作为载体的一种区带电泳

18、。这种凝胶是以丙烯酰胺单体(是以丙烯酰胺单体(Acrylamide,简写为,简写为Acr)和交联剂)和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰甲叉双丙烯酰胺(胺(N,N-MethylenaBisacrylamide,简写为,简写为Bis)在催化剂的作用下聚合而成)在催化剂的作用下聚合而成的。的。Acr和和Bis在它们单独存在或混合在一起时是稳定的,且具有神经毒性,操作时在它们单独存在或混合在一起时是稳定的,且具有神经毒性,操作时应避免接触皮肤。但在具有自由基团体系时,它们聚合。引发产生自由基团的应避免接触皮肤。但在具有自由基团体系时,它们聚合。引发产生自由基团的方法有两种,即化学法和光化学法。方法有两种,即化学法和光化学法。

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