遗传的分子基础3中讲

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1、 第三章第三章 遗传的分子基础遗传的分子基础 一、染色质与核酸结构一、染色质与核酸结构 0.5学时学时二、二、DNADNA复制复制 0.50.5学时学时三、三、RNARNA转录与加工转录与加工 0.60.6学时学时四、遗传密码与翻译四、遗传密码与翻译 0.30.3学时学时五、基因概念与发展五、基因概念与发展( (自学自学) 0.1) 0.1学时学时目目 录录染色质水解实验(一)染色质(一)染色质(chromatin) 1974年Kornberg等,小球菌核酸,酶消化、剪切、离心、凝胶电泳、电镜观察。染色质是由100埃的核小体组成丝状结构,呈DNA单链。一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构 细胞

2、分裂过程中染色质聚缩成棒状结构。(二)染色体(二)染色体(chromosome)化学组成DNA: 27% RNA : 6%蛋白质:67%基本结构单位核小体连接丝一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构1.结构单位核苷酸(nucleotides) 包括:磷酸、糖基及碱基(三)(三)DNA结构结构腺苷酸(dAMP)鸟苷酸(dGMP)胞苷酸(dCMP)胸苷酸(dTMP)尿苷酸(dUMP)核苷酸种类:5种DNA特有核苷酸RNA特有核苷酸一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构2.一级结构多聚核苷酸(polynucleotides) 35 方向连接与DNA极性螺旋氢键相连与变性和复性复制转录碱基排列与生物多样性

3、; 某基因有1kb能多少种遗传信息?(三)(三)DNA结构结构一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构 DNA双螺旋结构,即DNA二级结构双链反向平行,产生向心力,维持DNA双螺旋结构氢键相链产生结合力,维持DNA双螺旋结构。碱基堆积产生堆积力,维持DNA双螺旋结构。 DNA高级结构是超螺旋结构和折叠状染色体结构3.双螺旋结构(double helix)(三)(三)DNA结构结构一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构1.tRNA结构(四)(四)RNA结构结构一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构 tRNA有3300余种,2个共同点75-94bp, 发夹状二级结构,有3环1臂反密码子环:识别三联密码双氢

4、尿苷环:识别氨基酸假尿嘧啶环:识别核糖体氨基酸臂: 连接氨基酸。2.rRNA结构(四)(四)RNA结构结构一、染色质与核酸结构染色质与核酸结构 rRNA,120-2900bp,发夹状主要功能区tRNA识别结合区:如5SrRNA就有5CGAAC序列能识别核糖体不同rRNA亚基识别区:能与分子量不同的核糖体结合。与基因表达调控密切相关CAU就是mRNA起始密码AUG密码。tRNA结合区与不同亚基识别能识别AUG1、半保留复制(semiconservative replication) Meselsen 15N标记E.coli 3代DNA复制:亲代为底峰,一代为中峰,二代中、上峰各半证明了半保留复制

5、。 Taylor蚕豆根尖减数分裂姊妹染色单体差别染色二、DNA复制复制2、半不连续复制(semidiscontinous replication) DNA53链连续合成,另一条链先合成冈奇用片段,在DNA聚合酶、引物酶、连接酶、拓扑异构酶解旋酶等30多种蛋白质作用下完成DNA复制。二、DNA复制复制3、复制方向 型双方向复制 Cairns(1963), E.coli DNA , 3H-dTMP标记,子一代呈小点园圈,二代呈Y形复制叉(replication fork) ;称型复制模型。 型单方向复制 E.coli有致育因子为雄性,无者为雌性。致育因子是从单连切口单方向、边滚动边复制,既滚环复制

6、,又称型复制。二、DNA复制复制4、复制起点与引物 E.coliDNA出现多个复制叉,说明有多个复制起点,并都有短RNA片段引物引导。二、DNA复制复制5、D型不对称不同步复制 线粒体DNA(mtDNA)是不对称、不同步的D环复制。 mtDNA重链H先复制,并置换亲链产生D环,当D环置换到轻链L起点时(约2/3长度)H反向复制新链,H.L同步复制结束后子代释放,1/2子代基因组因H链继续完成新链复制。这种不对称不同步DNA复制称D环复制。二、DNA复制复制 染色体端粒有多个Gn(A/T)m重复序列防止核酸酶降解,端粒酶(telomerase)完成端粒。 动物多以TTAGGG重复,端粒酶RNA核

7、心序列为AAUCCCAAU,是端粒复制模板,能与TTA配对;每复制 1个TTAGGG后,移位复制出下一个。多次循环后重复序列够以折回形成 t 环,完成端粒DNA复制。6、T型折回成环复制二、DNA复制复制1、RNA聚合酶(一)(一)RNA转录(转录(transcription)三、三、RNA转录与加工转录与加工 RNA聚合酶以A、U、G、C为原料,与DNA模板链形成RNA/DNA杂合链,35为方向合成RNA。 有5个作用:识别启动子、解链、合成RNA、定转录方向和识别终点。 2、RNA转录(一)(一)RNA转录(转录(transcription)步骤 识别转录终止释放强、弱终子释放RNA有3大

8、差别:有无回文环结构之别富含GC与富C贫G之别不依赖与依赖 之别特点空间性,有意链特定区时间性,特定时间同步性,边开边录边闭三、三、RNA转录与加工转录与加工1、 mRNA前体加工(二)(二)RNA加工(加工(processing)三、三、RNA转录与加工转录与加工 核内不均一前体RNA (heterogeneos nucleus RNA) ,即初转录出来的RNA前体。它在基因长度和性质上差异很大、很不均匀。需要剪切加工才有活性。 小鼠淀粉酶基因hnRNA有7993bp,该基因成熟mRNA 仅1663bp,相差6330bp。2、 tRNA加工(二)(二)RNA加工(加工(processing)

9、 前体tRNA为多个tRNA串联体,需剪切加工。 单个tRNA没有CCA氨基酸臂,需添加加工。氨基酸臂添加加工三、三、RNA转录与加工转录与加工1、三联密码性质三联性:3bp为1密码子。连续性:密码子间无逗号。简并性(degeneracy):1氨基酸多密码子,21简1非通用性:生命界通用。摇摆性:1反密码子识别多个密码子,21摇1非。特定性:起始密码 AUG终止密码 UAA、UAG、UGA分别称诸石、虎珀和乳白型。四、遗传密码与翻译四、遗传密码与翻译(一)三联体密码(一)三联体密码(triplet code)四、遗传密码与翻译四、遗传密码与翻译2、反三联密码摆动学说(一)三联体密码(一)三联体

10、密码(triplet code)摆动(wobble)学说 1个反密码子能识别2个以上密码子的现象。 摆动条件:前2个bp严格配对、且第2个bp为嘧啶时第3位才摆动 。反密码子识别密码子数目多少主受第1个bp性质决定。第1个bp是A 、第2个bp为嘌呤时识别1个密码子;第1个bp是C/U/G时识别2个密码子;第1个bp是I (次黄嘌呤)时识别3个密码子。即mRNA密码子 :51 2 3 3 第3位bp: U CU GU AG ACU tRNA反密码子:33 2 1 5 第1位bp: A G C U I四、遗传密码与翻译四、遗传密码与翻译3、tRNA种类(一)三联体密码(一)三联体密码(tripl

11、et code)tRNA种类 氨基酸结合到tRNA上后,靠tRNA完成三联密码识别。据此,tRNA可以划分成三类。起始与延伸tRNA:2类,fMet-tRNA是起始tRNA,其他称延伸tRNA。同工tRNA:21类,简并密码子的tRNA。因同工tRNA有不同反密码子,其二、三结构能识别氨基酸不同的同义密码子。校正tRNA:抑制突变基因表达的tRNA。无义突变3类,错义多类 无义突变使氨基酸密码子突变成UAA诸石型、UAG虎珀型、UGA乳白型终止密码子,但tRNA反密码子发生相对应抑制突变,就能恢复原氨基酸翻译。错义突变也能通过校正tRNA恢复原氨基酸翻译。四、遗传密码与翻译四、遗传密码与翻译4

12、、密码子例外属性(一)三联体密码(一)三联体密码(triplet code)偏离密码子 线粒体AGA/AGG是终止密码,与核基因精氨酸密码发生偏离。目前已知22类tRNA,摇摆说认为,1个tRNA能识别1个密码子家族时仅需23类tRNA, ,线粒体AGA/AGG减少1种tRNA 后正好数目吻合。偏离启发。偏爱密码子 简并密码子在特定生物中有明显使用偏爱。如Ecoli苏氨酸密码AUC.ACCACA使用率分别为36/65.26/65.3/65,有偏爱密码子。稀有密码子 硒代半光氨酸是UGA终止密码编码,是硒代-丝氨酸-tRNA识别,合成丝氨酸后修饰而成。启动与活化:30S+50S+mRNA翻译循环

13、,进位:氨酰基tRNA进入A 成肽:A、P位点上的氨基酸成肽 转位:从A移到P,空出A备用 移位:mRNA移动一个codon延生和终止:1-4步重复延生,终止子结束、释放(二)蛋白质合成(二)蛋白质合成四、遗传密码与翻译四、遗传密码与翻译(一一)、拟等位基因(、拟等位基因(pseudo allele)1、拟等位基因提出 杏红白眼F1杏红,Wb对W是显性,是等位基因。 F2红眼0.1%,说明Wb与W之间发生了基因交换。能交换就是非等位基因。Wb与W不是等位也不是非等位基因,命名为拟等位基因。Wb + Wb + 杏 红 + W Wb + 杏 红Wb W Wb + 杏 红 + + Wb + 红 眼9

14、9.9%0.1 %Wb + Wb + 杏 红 + W+ W Y Y 白 眼Wb + + W 杏 红 W Wb b + + Y Y 杏 红五五 基因的概念与发展基因的概念与发展(一一)、拟等位基因(、拟等位基因(pseudo allele)2、拟等位基因与顺反子(cistron) 将F2红眼绘制成图1, 得wb与w顺排,呈红眼; 将F2杏红眼绘成图2 ,得wb与w反排,呈为杏红眼。即基因内不同位点间顺反排列差异导致了基因功能差异。 顺反排列差异能产生基因功能差异的基因称拟等位基因。 顺反排列差异能产生功能差异的区间,称为顺反子(cistron) + + Wb W 红 眼trans + W Wb

15、+ 杏 红cis五五 基因的概念与发展基因的概念与发展(二二)顺反子、重组子和突变子顺反子、重组子和突变子 1、顺反子(cistron)五五 基因的概念与发展基因的概念与发展 顺反排列差异能产生遗传功能差异的区间称顺反子。 即,有不同遗传功能的顺反排列基因称同一个顺反子(如图A)、没有遗传功能差异的顺反排列基因为两个不同的顺反子(如图AB)。 一个顺反子就是一个基因,但顺反子揭示了基因内空间结构与遗传功能的差异。(二二)顺反子、重组子和突变子顺反子、重组子和突变子 2、Benzer试验五五 基因的概念与发展基因的概念与发展 Benzer,对T4phage r区3000多个突变体,采用双重感染法

16、获得了3000多个基因的距离;用成对直接感染法确定3000多个基因的功能。 结果发现:3000多个基因归属于A、B两个顺反子内。如r47至r106顺反子A内有1000多个小基因, r51至r106基因间距离虽然很近,但分别属于A、B两个顺反子 。 说明基因不是功能的最小单位,顺反子才是。3. 重组子(recon)五五 基因的概念与发展基因的概念与发展 能发生交换重组的基因片段称重组子。如r区A顺反子内有1000多个小基因,各小基因间均能发生交换重组,则有1000多个重组子。 说明基因不是交换的最小单位,重组子才是。(二二)顺反子、重组子和突变子顺反子、重组子和突变子4、突变子(muton) 能

17、产生非野生型突变的区间称突变子。如:r区A基因内有1000多个突变体,即有1000多个基因突变位点发生了突变,为1000多个突变子。 说明基因不是突变的最小单位,突变子才是。五五 基因的概念与发展基因的概念与发展(二二)顺反子、重组子和突变子顺反子、重组子和突变子(三)断裂基因与重叠基因(三)断裂基因与重叠基因( split and over lapping gene)1、断裂基因 结构基因内的间隔序列。 Chambon(法),1977年,首次发现猴病毒 SV40DNA间隔序列,打破了结构基因为连续DNA片段的观念,是真核生物普遍现象。如兔血清蛋白4与3间断裂。五五 基因的概念与发展基因的概念

18、与发展2、重叠基因(over lapping gene)(四)断裂基因与重叠基因(四)断裂基因与重叠基因 多个基因共用同一段DNA序列 phageX174核苷酸:5258个gene : 9个 氨基酸:2000个 欠614个核苷酸是B被包含在A基因内,E被包含在D基因内,基因重叠。 Sanger发现了重叠基因(1978)五五 基因的概念与发展基因的概念与发展(五)基因的现代概念(五)基因的现代概念五五 基因的概念与发展基因的概念与发展 合成有功能的多肽或RNA分子所必需且完整的DNA序列。包括启动子、RNA编码区(含内含子和外显子)和终止子。1.Mendel: 颗粒因子互不粘染,彼此独立;2.M

19、organ:基因直线排列在染色体上;3.Beadle: 基因通过蛋白质控制性状表达;4.Benzer: 顺反子、交换子、突变子分别是功能、交换、突变的最小单位。5.Waston、Crick:DNA上特定碱基序列;6.Jacob : 基因是1个操纵调控表达系统;7.Chambon: 基因内有内含子,断裂基因;8.Meclintodk:能转座的基因称转座基因;9.Berg : 基因组间DNA重组子能在受体中表达;10.genome: 基因组编码与非编码区有内在联系。(六)基因概念发展(六)基因概念发展五五 基因的概念与发展基因的概念与发展第第3章章 作业及复习题作业及复习题一、一、作业:P57 2

20、.10二、二、复习题 (一)名词注释(一)名词注释1.Polynucleotides; 2.double helix3.semiconservative replication;4.semidiscontinous replication5.Promotr; 6.enhancer7.triplet code; 8.degeneracy9.pseudo allele; 10.recombination plementation test; 12.muton13.Recon; 14.cistron15.Intron; 16.extron(二)填空(二)填空1、DNA螺旋结构中,双链同轴盘缠的主要是

21、DNA双链极性相反产生了向心力,除此之外还有( )力及( )力都是维持DNA空间结构的主要动力。2、测得某双链DNA分子中,G的含量为0.24,则该DNA中T的含量为( ),C 的含量为( )。3、用3H-dTMp培养基28下培养E.coli,20min后,提取E.coliDNA。发现该DNA仅一条DNA链上有放射性标记。这说明DNA复制是( 半保留)方式复制。若在35下培养30mm后,提取E.coliDNA。发现一条DNA长链及很多DNA片断上均有放射性标记,且含量各占1/2左右。该试验说明DNA复制是( 半保留)复制。4、DNA特有的碱基是( 腺嘌呤 ),RNA特有的碱基是(鸟嘌呤 )。5

22、、若在106NtRNA的核苷酸的排列是随机的,而各种碱基的比例是20%A,25%C, 25%U 和30%G,你预计5-GUUA-3序列可出现( )次,5-UUA-3序列可出现( )次6、从细菌的噬菌体中分离DNA,DNA中含33%A,26%T,18%G,和23%C,该测定数据可以推测此噬菌体DNA的结构是( )结构,而真核生物DNA结构是( )结构7、tRNA的二级结构为三叶草状,其特点是有22个恒定的碱基、5端配对、3-OH永远是单链区;和其特有的三环一臂。三个茎环是( )( )( ),一臂是( )。8、Alu家族是人、鼠等所有脊椎动物中广泛分布的一种基因家族,有14个重复基因,各基因之间的

23、间隔序列称为( ),它与( )基因同源。9、第一代分子遗传标记技术就是指( )遗传标记技术,它是基于( )酶切割DNA的片段长度不同,通过克隆探针检测不同长度DNA片段多态性差异的遗传标记计算。10、生物性细胞内基因组C值大小与生物进化程度不符的现象称为( ),它告诉我们生物基因组内必有大量的( )基因。(三)选择填空(三)选择填空1、已知T4噬菌体A区,1、3、5号突体为同一个顺反子,2、4号突变体为另一个顺反子。则1号突变体与2、3、4、5号突变体的互补测验结果应为( )。a、-+ -+ b、+ - + c、+ -+ - d、-+ -2、3-TACAAT- DNA链,转录mRNA的结果为(

24、 )。 5-ATGTTA-a、UACAAU b、AUGUUA c、-ATGTTA- d、-TACAAT-3、DNA切除修复,当胸腺嘧啶二聚体剪开切口,互补合成填补上二聚体空缺之后,损伤DNA片断由( )酶切掉。 a、核酸内切酶 b、DNA聚合酶 c、核酸外切酶 E、DNA连接酶4、因基因突变密码子GAA变为AAA。从密码子功能上分类,该突变为( )突变。a、同义突变 b、错叉突变 c、无义突变 d、无突变5、tRNA、rRNA基是( )的基因。a、既转录又翻译 b、不转录不翻译c、只转录不翻译 d、不复制不转录6、DNA切除修复,当TT剪开切口,合成新互补链DNA片断后,被置换出来的损伤DNA

25、片断,由( )酶切掉。 a.内切酶 b.聚合酶 c.外切酶 d.连接酶 7、GAA密码子突变成AAA密码子,该突变为( )突变a.同义突变 b. 错义突变 c.无义突变 d.点突变8、转录和复制都是遗传物质合成的过程,但转录特点与下列特点不吻合的是( )。a、转录仅一条模板链; b、转录需要引物;c、转录不需要底物; d、转录的开链区不扩大,只移动。9、RNA pol的主要功能有五个,下面与其功能不吻合的是( )。a、直接识别启动子; b、使DNA解链;c、合成RNA; d、校正DNA序列。10、下列物质中不是组成型异染色质的是( )。a、着丝粒; b、端粒; c、次缢痕 d、巴氏小体11、下

26、列物质中不是组兼性异染色质的有( )。a、假基因; b、内含子; c、结构基因; d、巴氏小体12、复杂多基因家族是指下面( )基因。a、人体珠蛋白间隔基因; b、5srRNA多个重复基因;c、果蝇H1、H2A、H2B、H3、H45个组蛋白基因; d、鼠血红蛋白间隔基因13、下面的三联体密码不是终止密码子的是( )。a、UUA; b、UAG; c、UGA; d、UAA四、是非题(正确题画四、是非题(正确题画,错误题画,错误题画)1、由于碱基互补,真核生物DNA中(G+C)/(A+T)=1。( )2、单链DNA病毒中,G/C与A/T之比总是相等的。( )3、核小体中心颗粒是由H2A、H2B、H3

27、、H44个组蛋白分子各2个分子组成的8分子颗粒。( )4、基因转录具有空间性、时间性、同步性。( )5、2n=4x生物基因组的DNA含量为4C。( )6、女人体细胞中XX染色体早期随机失活会出现1个巴氏小体。( )(五)复习题(五)复习题1、有什么证据表明DNA中只有两种碱基对A-T和G-C构成?2、将下例各种DNA和相应的染色质相匹配起来DNA类型 染色质类型Barr小体 常染色质着丝粒 兼性异染色质端粒 组成性异染色质大部分表达基因 3、我们希望使基因组随机切成很小的片段 (250bp) 左右,应当选择什么样的限制酶,若想切成4kb的随机片段需要选什么样的限制性酶?4、在E.coli的色氨酸合成酶的蛋白质A的第223位点上观察到aspglycys的替换,假定每个氨基酸的替换是由一个核苷酸引起的,利用遗传密码表,指出是哪些密码子发生了一些什么类型的碱基替代?

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