原核生物转录及其调控原核生物转录及其调控l原核生物转录和翻译是偶联的,其mRNA为编码多种蛋白的多顺反子原核生物 因子协助RNA聚合酶识别启动子基本元件并由此起始转录 ,并在具有发卡结构的终止子处(或在因子协助下)结束转录 因子是基因选择性转录的调控因子启动子上游具有能结合转录激活因子如CAP的调控元件从而大幅度地提高转录效率l操纵子是原核生物转录调控的主要模式,其中最典型的代表为乳糖操纵子和色氨酸操纵子除了调控蛋白(阻遏蛋白)与操纵元件结合阻止RNA聚合酶前进达到降低转录效率主要调控途径外,还存在一种称之为“弱化子”特殊调控模式弱化子通过前导肽的翻译过程中核糖体占位是否影响前导mRNA的终止子形成而控制后续mRNA分子合成转录单位Figure8.2编码链/ +链模板链/ -链转录起始不需要引物RNA聚合酶不具备识别启动子的能力,需要基本转录因子的协助转录过程如下:起始-延伸-终止启动子(启动子(promoterpromoter)是能启动转录的一段)是能启动转录的一段DNADNA片段常含有转录因子识别和结合的保守的和特异顺式元常含有转录因子识别和结合的保守的和特异顺式元件(件(cis-elementscis-elements),用以控制基因的转录起始。
用以控制基因的转录起始上游特异元件上游特异元件 TTGACA TATAAT CA/GT-35序列序列-10序列序列+1特异转录因子结合元件特异转录因子结合元件基本转录因子结合元件基本转录因子结合元件转录起始位点转录起始位点控制基因特异表达(控制基因特异表达(何时何地多少何时何地多少 )招募招募RNA聚合酶组装转录起始复合物聚合酶组装转录起始复合物原核生物转录调控模型原核生物转录调控模型RNARNA聚合酶聚合酶3.3.在转录期间在转录期间在转录期间在转录期间RNARNA聚合酶的结构和功能位点聚合酶的结构和功能位点聚合酶的结构和功能位点聚合酶的结构和功能位点(+)链)链 ( )(-)链)链 Enzyme Movement解旋解旋 ()复旋复旋 ()覆盖约覆盖约40bp,其中约其中约17 bp解链区解链区 The channel through the enzyme (denoted c) is closed in the core and open in the holoenzyme. Overall shapes of E. coli RNA polymerase core (a) and holoenzyme (b) deduced from electron microscopy studies on two-dimensional crystals of the enzymes.25BindingofRNApolymerasetopromoterClosedpromotercomplexOpenpromotercomplex- factor selects the promoters to which RNA polymerase will bind tightly. The genes adjacent to these promoters will then be transcribed. 延伸延伸l l起始成功后,聚合起始成功后,聚合起始成功后,聚合起始成功后,聚合酶释放出酶释放出酶释放出酶释放出因子,因子,因子,因子,形成核心酶形成核心酶形成核心酶形成核心酶-DNA-DNA-新生新生新生新生RNARNA链三元链三元链三元链三元(三聚)复合物。
三聚)复合物三聚)复合物三聚)复合物随着转录泡的移动,随着转录泡的移动,随着转录泡的移动,随着转录泡的移动,不断地解螺旋和再不断地解螺旋和再不断地解螺旋和再不断地解螺旋和再螺旋(解螺旋区域螺旋(解螺旋区域螺旋(解螺旋区域螺旋(解螺旋区域的大小稳定地保持的大小稳定地保持的大小稳定地保持的大小稳定地保持在在在在17bp17bp),),),),RNARNA链不断的延长链不断的延长链不断的延长链不断的延长Figure 8.16终止子终止子l l终止序列的特点: 1)发夹结构(减速) 2)4个或更多的U残基 (脱离)(脱离)Figure8.6依赖的转录终止l l不形成强的发夹结构,不形成强的发夹结构,必须一种辅助因子即必须一种辅助因子即蛋白来帮助转录终蛋白来帮助转录终止六聚体蛋白,识止六聚体蛋白,识别别72bp序列(特异序列(特异结构),依赖单链结构),依赖单链RNA水解水解ATP依依赖赖 的的转录终转录终止止Rho factor ()-dependent termination操纵子与乳糖操纵子操纵子与乳糖操纵子1.1.1.1.提出:提出:19611961年年, Jacob , Jacob (雅格布)(雅格布)-Monod-Monod(莫诺)(莫诺). .l l2.2.操操纵纵子子:操操纵纵子子是是基基因因表表达达和和调调控控的的单单元元,典典型型的的操操纵纵子包括:子包括:结构基因、调控元件和阻遏蛋白编码基因。
l l大大肠肠杆杆菌菌K12K12中中共共有有41364136个个基基因因,以以操操纵纵子子结结构构存存在在的的基基因因接接近近1/4 1/4 (256 256 操纵子操纵子 控制控制879879基因)基因)操纵子结构l l 结构基因:控制某一代谢途径关键酶的多顺反子结构基因:控制某一代谢途径关键酶的多顺反子l l调控元件:启动子调控元件:启动子 和操纵区(覆盖在启动子和编码区交叉和操纵区(覆盖在启动子和编码区交叉区,是阻遏调节蛋白质的结合位点)区,是阻遏调节蛋白质的结合位点)l l调节基因:编码阻遏蛋白质独立的基因调节基因:编码阻遏蛋白质独立的基因乳糖操纵子转录激活因子CAP启动区启动区PlaclacZlacAlaclOlaclacY调控元件调控元件结构基因结构基因 -半乳糖苷透性酶半乳糖苷透性酶分解乳糖分解乳糖半乳糖和葡萄糖半乳糖和葡萄糖运送乳糖透过细胞壁运送乳糖透过细胞壁乙酰辅酶乙酰辅酶A A 乙酰半乳糖乙酰半乳糖 -半乳糖苷酶半乳糖苷酶-半乳糖苷转乙酰酶半乳糖苷转乙酰酶乳糖转化乳糖转化异乳糖异乳糖调节基因调节基因A YZ操纵区操纵区转录方向转录方向转录单元转录单元转录单元转录单元lacZYAlacZYAlacZYAlacZYA分解分解X-gal蓝色蓝色乳糖阻抑物乳糖阻抑物RNAlaclPlacI乳糖阻抑物单体乳糖阻抑物单体乳糖阻抑物四聚体乳糖阻抑物四聚体lacZlacYlacA透性酶透性酶-半乳糖苷酶半乳糖苷酶转乙酰酶转乙酰酶PlaclacZlacAlaclOlaclacY含回文结构(含回文结构(-5/+21-5/+21)PlaclacZlacAlaclOlaclacYPlaclacZlacAlaclOlaclacY异乳糖异乳糖诱导物诱导物安慰诱导物安慰诱导物IPTGRNA聚合酶聚合酶iRNARNA聚合酶聚合酶lacZlacYlacA被激活的乳糖阻抑物四聚体被激活的乳糖阻抑物四聚体乳乳 糖糖转化转化色氨酸阻抑物色氨酸阻抑物Ptrp Otrp色氨酸所需的酶色氨酸所需的酶TrpETrpDTrpCTrpBTrpA7kbRNA弱化子弱化子(162 nt )TrpETrpATrpRTrpBTrpCTrpD前导序列前导序列结构基因结构基因被激活色氨被激活色氨酸阻抑物酸阻抑物色氨酸色氨酸mRNA色氨酸操纵子色氨酸含量色氨酸含量色氨酸含量色氨酸含量高高高高的时候的时候的时候的时候: :色氨酸含量色氨酸含量色氨酸含量色氨酸含量低低低低的时候的时候的时候的时候: :。