喀什地区DNA数据库升级软件硬件配置400万库容

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1、喀什地区DNA数据库升级软件、硬件配置方案(400万库容)1、 DNA硬件服务器升级配置:(100-400万库容):序号配置说明硬件配置(单台)软件环境厂商配置数量(台)1MIS系统数据库服务器2台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:1T x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise EditionDNA专业数据库DELLR730 E5-2640V4*2/32G/1T SAS *4/DVD/H310/495W双电/导轨22MIS系统应用服务器2台CPU

2、:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition配置比对引擎模块300万/秒DELLR730 E5-2640V4*2/64G/1T SAS *2/DVD/H310/495W双电/导轨23LIMS系统数据库服务器1台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:1T x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2

3、64bit SP2 Enterprise EditionDNA专业数据库DELLR730 E5-2640V4*2/32G/1T SAS *4/DVD/H310/495W双电/导轨24LIMS系统应用服务器1台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition配置比对引擎模块300万/秒DELLR730 E5-2640V4*2/64G/1T SAS *2/DVD/H310/495W双电/导轨25DI

4、S比对服务器5台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition配置比对引擎模块300万/秒DELLR730 E5-2640V4*2/64G/1T SAS *2/DVD/H310/495W双电/导轨6合计2、 原服器数据校验、数据完整性备份、数据迁移、新服务器程序环境架设、新服务器程序性能调优序号内容1原服务器数据校验:数据完整性校验、上级数据同步校验、比中结果同步校验、数据格式合法性校验2原服

5、务器数据备份:整库备份3数据迁移:原服务器数据完整性迁移至新服务器并且4新服务器程序环境架设:操作系统可行性验证、第三方软件辅助架设、新服务器程序架设5新服务器程序性能调优:第三方软件性能调优、解决用户实际使用操作等问题3、 原LIMS实验室管理系统升级序号内容1增加从检验鉴定系统中直接转移委托2增加多种新的鉴定方法3新的实验仪器投入使用,LIMS必须及时满足系统和测序仪的数据写入导出等要求4通过与系统身份证关联,对于待检验的血样,LIMS可以在检验前确定该血样所属个体是否已经检验建库过5实时异地备份数据、延迟3分钟6保证区县LIMS与此系统数据无差传输7DNA LIMS系统数据库(100万份

6、)基础上扩容至300万份8核酸分析仪获取的常染色体图谱原始文件9核酸分析仪获取的Y染色体图谱原始文件10将核酸分析仪数据转换成可用于比对的格式11新增家系录入模块12家系的整合13Y染色体基因信息入库14个体识别比对速度提升至200万/秒(容差1对)15在比对方法中添加混合样本比对模式16可以对外来数据进行手工快速比对。17在原有的常染色体双倍体比对模式基础上增加Y-STR单倍体比对模式18分析FSA文件系统19分析HID文件系统20参考国家库二期数据结构,提升程序运行效率21针对海量实验室数据设计相关表结构22针对上报样品设计相关表结构23针对样品图谱等大数据设计相关表结构24混合样品模拟人

7、为操作,实现样品分离多样化比对25实现自动从混合样品内提取可疑位点DNA数据库优化硬件环境和软件配置建议一、 省级DNA实验室及其数据库:“金盾工程”二期后省级DNA实验室及其数据库将建立DNA实验室信息管理系统(LIMS系统)、DNA数据检索比对系统(DIS系统)、DNA综合管理信息系统(MIS系统),其具体硬件环境和软件配置优化建议如下:序号系统数据量配置数量配置说明硬件配置(单台)软件环境1LIMS系统100万以上共需要2台服务器数据库服务器1台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系

8、统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition数据库:Oracle 11gR2(64位)应用服务器1台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:8G以上硬盘:600G x 4 10K SAS ,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition中间件:WebSphere 7.0(64位)系统软件:LIMS系统 + 比对模块50100万共需要2台服务器数据库服务器1台CPU:2颗6核2.4GHz以上CPU内存:8G以上硬盘:300

9、G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition数据库:Oracle 11gR2(64位)应用服务器1台CPU:2颗6核2.4GHz以上CPU内存:8G以上硬盘:600G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition中间件:WebSphere 7.0(64位)系统软件:LIMS系统 + 比对模块50万以下共需要1台服务器数据库

10、服务器 / 应用服务器共用CPU:2颗6核2.4GHz以上CPU内存:16G以上硬盘:600G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition数据库:Oracle 11gR2(64位)中间件:WebSphere 7.0(64位)系统软件:LIMS系统 + 比对模块2DIS系统300万以上共需要5台服务器比对服务器5台CPU: 2颗8核2.4GHz以上CPU内存:32G及以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系

11、统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition系统软件:DIS系统100300万共需要4台服务器比对服务器4台CPU: 2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G及以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition系统软件:DIS系统100万以下共需要3台服务器比对服务器3台CPU: 2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G及以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或

12、RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition系统软件:DIS系统3MIS系统/共需要4台服务器数据库服务器2台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G及以上硬盘:300G x 4 10K SAS ,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition数据库:Oracle 11gR2(64位)应用服务器2台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16G及以上硬盘:600G x 4 10

13、K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition中间件:WebSphere 7.0(64位)系统软件:MIS系统4二、 地市级DNA实验室及其数据库:“金盾工程”二期后地市级DNA实验室及其数据库将建立DNA实验室信息管理系统(LIMS系统)、DNA综合管理信息系统(MIS系统),其具体硬件环境和软件配置优化建议如下:序号系统数据量配置数量配置说明硬件配置(单台)软件环境1LIMS系统100万以上共需要2台服务器数据库服务器1台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:16

14、G以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition数据库:Oracle 11gR2(64位)应用服务器1台CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU内存:8G以上硬盘:600G x 4 10K SAS ,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition中间件:WebSphere 7.0(64位)系统软件:LIMS系统 + 比对模块50100万共需要2台服务器数据库服务器1台CPU:2颗6核2.4GHz以上CPU内存:8G以上硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10网卡:1000M操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP1 Enterprise Edition数据库:Oracle 11gR2(64位)应用服务器1台CPU:

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