定性分析-xcalibur定性浏览器操作说明

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1、Xcalibur 定性浏览器 1 双击图标,进入 Xcalibur 工作站 2 点击进入定性浏览器 3 快捷图标解释如下: 4 点击图标打开一张谱图 5 提取不同的离子通道:点击总离子流图右上角图钉激活窗口,鼠标右键选择 Ranges 出现 如下对话框,点击 Scan filter 的下拉框选择不同的离子通道; 提取单个离子: 在 Scan filter 中选完离子通道之后, 将 Plot type 改为 Mass Range, 在 Range(s) 中输入要提取的离子的质荷比。 平滑点数:在数据图谱中任何位置点击鼠标右键选择 Ranges,在对话框中选择 Automatic processi

2、ng,在 Smoothing 中的 Enable 打钩,Points 中输入平滑点数,只能输入 115 之内的 奇数。 设置质量精度和小数点后位数,只适用于 Q Exactive,LTQ Obitrap, Fusion 等高分辨质谱: 在数据图谱中任何位置点击鼠标右键选择 Ranges,在对话框中选择 Automatic processing, 在 Mass tolerance 中设置质量精度,一般设置 10ppm;Mass precision 设置精确到小数点后第几 位。 6 将多张谱图添加到一个 cell 中进行比较 点击总离子流谱图右上角图钉激活,鼠标右键选择 Ranges 出现如下对话

3、框,点击红色圈内 的图标,选择另外一个样品图谱进行比较; 7 扣除背景 (1) 在原图上选择一段时间的扫描作为背景进行扣除 激活质谱图右上角图钉,鼠标右键 Subtract Spectra,选择一段 1 Range 或者两段 2 Ranges 时 间扣除,在对应的总离子流谱图背景区域内拖动鼠标左键; (2) 做一个基质空白作为背景进行整个样品背景扣除 菜单栏 Tools/Background Subtract,弹出如下窗口: Input/File 中添加样品数据, Background/File 中添加空白基质数据, Output/Name 中是扣除基 质空白之后样品的名称(不可修改) ,Fo

4、lder 是保存路径(可修改) 。 8 建立和使用 layout 文件 (1)建立 layout 文件 对谱图进行一系列处理之后,点击菜单栏 File/Layout/Save as,会弹出对话框,给 layout 文 件选择保存路径并命名。 (2)使用 layout 文件 打开一张谱图后, 点击菜单栏 File/Layout/Apply, 会弹出对话框, 选择要应用的 layout 文件。 9 显示积分峰面积及信噪比信息 对色谱图进行积分: (1) 自动积分 点击快捷图标(对单个谱图进行积分) 或者(同时对一个 cell 中的所有谱图都进行积分) (2) 手动积分 点击快捷图标,鼠标左键从色谱

5、峰开始处拖动至积分结尾处 对谱图进行积分之后, 点击鼠标右键 Display Options/Labels 选择 Area 和 Signal to noise 的选 项,即可在图中显示峰面积和信噪比的信息。 10 查看扫描点数 激活总离子流图,点击鼠标右键 Display Options/Style/Plotting 中选择 Stick 选项,即可更改 总离子流图的显示形式,每一根棒棒就是一个扫描点,一个色谱峰里面最佳扫描点是 1218 个。 11 左侧信息栏内容 (1) 元素组分 激活一张质谱图,鼠标右键Display Options /Composition选项卡。选择Element comp.、 RDB equiv、Delta。点击OK,在质谱图上就会显示元素组成的信息。 (2) 质谱图模拟 点击信息栏中的图标,在Chemical formula中输入分子式,在Adduct中选择加合离子, 点击左上角New即可得到模拟的质谱图。

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