传染病监测对POCT的需求

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1、传染病监测对 POCT的需 求CDC的传染病监 测 发病和流行趋势分析 发现暴发 发现新病原 深入了解传染病流行规律 估计疾病负担,确定防控优 先 评估控制项目 制订控制策略 传染病防控行动传染病监测多位点 多源 时间变 化与连续 多机构与多学科- 传染病的特点所决定自然环 境传 播监测人群传染病的监测 目标传染病监测 的信息来源医院 监 测 网报 告疾控机 构调 查媒体病人自 主报 告传染病监测信 息监测与应 对Mission Impossible为什么细菌感染性腹泻美国的监测 :每年有超过五百万的细菌性腹泻发生。WHO:估计每年腹泻30-50亿人次,500-1000万病例死亡 ETEC所致

2、病例(每年):估计21亿,38万例死亡。 发展中国家:5岁以下婴幼儿腹泻的最主要病原菌。0-4岁ETEC腹泻发病率:0.5次/人/年;5岁ETEC腹泻发病率:0.1次/人/年。Jelinek and Kollaritsch. Expert Rev Vaccines 2008./ Wenneras C, et al. J Health Popul Nutr 2004. / Steffen R, et al. J Travel Med 2005. / Niyogi SK. J Microbiol 2005.The New England Journal of Medicine, 2009, 361

3、;16:1560.监测仍心存疑虑 : 家底不清 有多少病例? 是什么病原?检测 到细菌,是不是致病原因? 单份血中检测 到抗体,怎么判断?。确 诊 病例采样检 测就 诊患者检出 率就诊 率采样 率我们能发现 多少传染病病例- 疾病流行程度的估算- 疾病负担测算传染病监测 存在的问 题常见病多发病被忽略 :- 急性健康损害低或病死率低- 病原种类多、检测 困难河南,2007, 1,526 例门诊病例北京,2010.4-2011.124,803 例深圳, 5年22,085 例腹泻病例云南,2012, 797例门诊病 例腹泻病原谱复 杂病原种类菌株数 (%)致泻性大肠杆菌140 (9.2)轮状病毒7

4、9 (5.2)志贺菌69 (4.5)沙门菌66 (4.3)诺如病毒56 (3.7)病原种类菌株数 (%*)志贺菌286 (6.0)弧菌251 (5.2)沙门菌192 (4.0)致泻性大肠杆菌77 (1.6)气单胞菌40 (1.0)病原菌种类菌株数量 (%)副溶血弧菌1288 (5.8)沙门菌486 (2.2)产毒大肠杆菌ETEC142 (0.64)非ETEC大肠杆菌109 (0.49)志贺菌77 (0.35)病原菌种类检出率 (%)致泻性大肠杆菌11.9气单胞菌9.8类志贺邻单 胞菌2.5沙门菌2.3志贺菌1.1既往流行而当前少见或罕见的疾病被忽略 :疟疾 立克次体类感染。传染病监测 存在的问

5、 题临床诊断标准缺乏特异 性传染病监测 存在的问 题检测出的微生物是不是致病原因 ?传染病监测 存在的问 题病原确定依然是挑战 病原体 条件致病菌混合感染?这些标本中存在大量的不同种类的细菌 正常定植菌完成(符合)哪些指标,可确定是疾病的病原?Kochs Postulates “科赫原则”,1890 细菌必须存在于每一个病例中细菌能够从病例中分离到并且纯培养细菌纯培养物接种健康敏感宿主能够复制出相同的疾病从实验感染的宿主中能够重新分离到这个细菌但也存在问题!如何提高基层医疗单 位的传染病诊断能力?多数病例到基层医疗单 位就诊治疗 分级诊疗 制度传染病网络直报是基于病原学定义疾病和分类、报告 的

6、传染病监测 存在的问 题发展普及传染病POCT技术 提高检测监测水平是敏感发现 新发突发传 染病疫情的重要依 托微生物基因组测 序 推动POCT技术发展国际人类基因组计划(HGP )1990年启动,2003年完成,一个基因组花费27亿美 元2014年:花费1千美元Reagent* cost per genome $797 Hardware price $137*DNA extraction, sample prep and labor $55-$65 Total Price = $989-$999Source: Illumina诊断标识的选 择 促进特异基因的选择 表面标识 抗原的基因? 毒力基因?基于表面标识 抗原(O抗原K抗原H抗原)的检测 , 还 是基于毒力因子的检测 ?O104:H4集聚黏附性大肠杆菌,产2型志贺毒素 检测 O157还是O104?促进特异蛋白、糖结构区域的选择拟态 弧菌分离株携带了霍乱毒素基因,产生霍乱毒素。 那么, 什么是霍乱?怎样诊 断霍乱?POCT应用于传染病监测报 告 对技术本身的要求 准确性评价,灵敏度特异度 提供诊断依据:一定程度上、基本的、完全的 纳入诊断标准能否、如何

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