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1、基于 ChIP-Seq 的高通量表观基因组数据的分析技术项目简介项目名称项目名称：基于 ChIP-Seq 的高通量表观基因组数据的分析技术研究内容及意义研究内容及意义：表观遗传修饰包括 DNA 甲基化、组蛋白密码等多种共价修饰，它们构成基因和表型间信息传递的关键媒介。表观遗传修饰的异常是导致癌症的重要因素，然而表观遗传修饰在癌症发生发展过程中的具体作用机制仍不明确。在研究癌症等复杂疾病的表观遗传调控机制的过程中，需要使用大量的基因组学和表观遗传修饰位点数据，如基因表达谱、DNA 甲基化修饰位点数据、组蛋白修饰位点数据等。对各种表观基因组数据进行比较可以获得这些数据，但是，庞大的表观基因组数据规
2、模加之数据高度的不均一性给计算机分析造成了不小的麻烦。本项目从系统生物的角度整合癌症和正常组织中的表观遗传修饰（DNA 甲基化、组蛋白修饰） 、基因表达谱等高通量的表观基因组和基因组数据，融合收集到的和自主开发的表观遗传学算法及模型，应用于乳腺癌、肺癌、结肠癌、前列腺癌等癌症，用以挖掘癌症特异的甲基化模式改变的基因以及组蛋白修饰异常的基因，构建表观遗传学实验数据处理、统计学分析、机器学习、功能注释的分析模块，并开发可视化的软件。通过整合的生物信息学的策略和方法，应用表观基因组和基因组数据挖掘基因组范围的癌症表观遗传变异的基因，发现癌症特异的表观遗传修饰、致病基因及相关通路，对研究癌症发生机制及表观遗传修饰在癌症发生过程的作用模式有一定的应用价值。经费使用经费使用：文章版面费，计算及耗材等。对学生的能力培养对学生的能力培养：培养学生科研意识、良好的科研习惯、独立进行科研的能力。通过查找、阅读文献，科研选题到科研设计，文章撰写等激发学生从事科研的兴趣。对学生要求对学生要求：具有一定的英语水平，具备一定的计算机操作能力，对表观遗传学研究领域有浓厚的兴趣。
