没有p的qpcr

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1、 没有没有 P 的的 qPCR qPCR 中的 P 代表什么？Polymerase，聚合酶。如果 qPCR 少了聚合酶，你一定觉得这是在开玩笑，巧妇难为无米之炊，没有聚合酶，定量 PCR 还怎么做。 一直以来，研究人员在尝试创造自我复制的酶。实现这个目标的方法之一是用 RNA 酶来催化RNA 分子的复制，包括 RNA 酶本身。这已经通过交叉催化（cross-catalytic）系统来实现了，它包括两个 RNA 酶，它们能利用四种底物成分来催化彼此的合成。 “R3C”就是一种能自我复制的 RNA 酶，但不是从核苷酸到核苷酸，而是通过碱基配对将两个RNA 核苷酸连在一起。但是，这个过程效率很低，因

2、为底物形成了无生产力的复合物， 限制了指数级的增长，而倍增时间长达 17 小时。美国斯克里普斯研究所（Scripps Research Institute）的 Gerald Joyce 和他的同事就一直在研究并改进“R3C”连接酶。 他们将 R3C 转变成交叉催化的形式，在那里正链酶将两个 RNA 分子组合起来，产生非常相似的负链酶，这个负链酶反过来又连接两个底物，形成正链酶。 随后， Joyce 他们利用体外演化 （in vitro evolution）来改善这种 RNA 酶的催化性质。在他们的努力下，当加入新鲜的寡核苷酸和镁离子之后，这些酶能够在 42C 的恒温下以指数方式自我扩增，倍增时

3、间缩短至 1 小时。 Joyce 认为：“这种复制品的最大应用是它是分子事件的信号放大器。”他指的是将催化结构域和配体结合结构域（适体，aptamer）结合起来，产生“适酶（apatazyme）”，这样扩增就成为配体依赖型。在配体存在时，适体序列是有序的，“适酶”的催化结构域也是，从而实现了指数级的扩增。但是当缺乏适当的配体时，整个分子就变得不稳定，连接酶活性也丧失。RNA 的指数增长率取决于配体的浓度，这就能确定样品中配体的浓度。这个过程与定量 PCR 是相似的，但是适用性更广。多种目标都受用， 包括与诊断和环境监测相关的蛋白和小分子。 随着适体开发成为一种常规的方法， 该系统能用于检测从蛋

4、白到代谢物的所有分子。同时，研究人员也在对适酶系统进行改进，Joyce 认为一年内倍增时间将缩短至 10 分钟。根据这种分子的动力学特性，他认为 1 分钟也是完全可行的。 （生物通 薄荷） 原文检索： Lam, B.J. 电话：+44 (0)29 2052 6445;传真：+44 (0)29 2052 6230;e-mail: eanette George, Albie Santos, Angela Williams, Rhian Martin, Val Millar*, Liz R摘要摘要 药物开发的高内涵分析的本质在于： 活性化合物在和定量那些相对于对照样品所发生的强度或者形态上的变化。I

5、N Cell Analyzer 平台提供了一整套从自动化图像Analyzer 2000 是一种全新的高性能成像系统，灵活地设计足以应对多种需求从全自动显微镜到自动化的高内涵筛选。IN Cell Analyzer 2000 提供了强大性能，如预览扫描、快速的载玻片成像、大芯片 CCD 照相机配件、3 种透射光模式和高级图像背景噪音去除（去卷积）配件的选择，来确保提供在横向和纵向上定量最准确的图像。 我们展示了 IN Cell Analyzer 2000 在多个生物应用中的性能评测结果， 说明了这个多功能系统产生了高质量的图像，适合于定量分析及提取准确、信息量丰富的数据。 细胞、组织和整个生物体中

6、作用，能够通过高通量荧光成像再加上自动化分析， 来检测获取到数据的定量和深度分析以及可视化的强大工具，来协助整个高内涵分析过程。IN Cell 点击索取点击索取IN Cell Analyzer 2000 系统的详细资料系统的详细资料介绍介绍 是一个模块化的系统，8 对激发和发射滤IN Cell Analyzer 2000包含了 200W 宽视野照明源、光片、一个 4 方位的自动化物镜转盘、10 种可供选择的物镜及自动的校正环调整、3 个自动的四波项选择。仪器的光路如图 1 所示。 10全面评测包括多个表型各异的样品和检测的成战。 我们展示了来自四个分析的性能评估的精选数据：受体内化 2，(c)

7、 微核形成，(d) AKT1-EGFP 和肌动蛋白成丝的多重分析 4。分析性能是通过一些指标来评段多色分光器和标准或大的 CCD 照相机等多图 1. IN Cell Analyzer 2000 的光路 就此次评估而言， 仪器的配置包括所有 8 个激发和发射滤光片； 分光器 QUAD1 和 QUAD2； 4、20和 40尼康物镜；及标准芯片 CCD 照相机。 实验方法实验方法 像与分析， 每一个代表了其本身的成像和分析挑(a) 神经生长 1，(b) GPCR32009年8月6日第六十五期第 17 页，共 26 页下一页 返回估的，包括 EC50 或 IC50，以及分析质量的指示剂如 Z 和严格标

8、准化平均差异（SSMD，5）。所得计算值都尽可能和已发表的结果来比对。 神经生长分析 预览扫描特征神经生长分析 预览扫描特征 SSM350_50x Content GenoTox Screening using IN Cell Analyzer 1000, presBS 12th Annual Conference 89(4):552-66. Physiological relevance of GPCR oligomerization and its impact on drug Drug Discovery Today (2008) 13:1056-1066. 7. Product bro

9、chure; GE He1-1114-03AA. 8. Wallace, W, Schaefer, L, Swedlow, J. R, A Workingpersons Guide to Deconvolution in oTechniques 31:1076-1097 (November 2001). 2009年8月6日第六十五期第 21 页，共 26 页下一页 返回揭秘揭秘 Illumina 的个人基因组测序服务的个人基因组测序服务 美元。该服务将利用 Illumina 的 Genome Analyzer II 测序仪，在最近认可的 CLIA 实验室中开展。它将会为客户列出基因组中的 SN

10、P 和结构变异，如插入、缺失和重排。 但 Illumina 不提供数据阐释的服务， 比如疾病风险客户服务，价格暂未透露，内外个命名的基因组，或者Illumina 会从客户提供的血液或唾液样品中提类参考基因组进行配对。 它还会利用芯片技Illumina 公司 6 月 10 日宣布将向客户提供高质量的个人基因组测序服务，价格为 48000评估、谱系分析或遗传性状的信息。因此，它与直接面向客户的基因组学公司 23andMe、Navigenics、Decode Genetics 和 Knome 合作。取 DNA，并利用 Genome Analyzer II 的配对末端技术，来进行测序，覆盖度大约是 3

11、0 倍，并将读数与人可从这些合作伙伴中选择，来分析他们的数据，但需要支付额外的费用。 Illumina 并不是第一家向个人提供全基因组测序的公司。 Knome 在 2008 年初就已经提供了这项服务，包括数据阐释，目前收费 99500 美元。Medomics 也提供“诊断基因组”但目前生意仍未开张。不过，Illumina 是第一家向客户提供此项服务的专业测序技术供应商。 Illumina的总裁Jay Flatley也承认目前的市场很小，但公司的主要目标是为以后铺路，将未来所需的设备投入到位，这样当测序费用下降时，市场自然会增长。 “我们相信现在是时候去开发 Illumina的设备，使它能很好地

12、起作用。”这包括构建一个医生的网络、数据分析的“生态系统”、以及解决监管和临床验证的问题。 48000 美元的价格并不便宜。Flatley 也知道这一点，目前只有一小部分人能承受，但他认为价格会持续下跌。Flatley 表示：“我们认为有相当一部分人会希望成为世界上前 10前 100 个、前 1000 个，所以这也是个市场。” 术对 DNA 进行基因分型， 作为一致性匹配的验证。 索 取索 取 Illumina 最 新 一 代 测 序 系 统最 新 一 代 测 序 系 统 Genome Analyzer的详细资料，请点击！的详细资料，请点击！一旦分析结束，Illumina 会将结果发给客户指定

13、 的 医 生 ， 客 户 可 通 过 苹 果 电 脑 上 的GenomeStudio 基因组浏览器软件来查看 SNP 和结构变异，但是这个软件更像是一个研究工具，它没， 就可以从 4 个合作身的基因组测序服务所采用的由北京基因组研究所完成的。 有用户友好的界面。 客户一旦收到他们的序列数据伙伴中选择 1 个来解释这些 ATGC 的含义。当然，你还需要再支付一笔费用，才能了解到疾病风险、 谱系及其他性状。 不过， 具体的费用是多少，几家公司都还未最后确定。 Knome 将采用它自KnomeXplorer 基因组浏览器软件来进行分析。而且，还会根据客户的要求提供定制的报告。客户还可以选择每年的更新

14、服务。Knome 本身也提供 99500 的基因组测序和 24500 的外显子测序和分析服务， 其中测序工作是（生物通 余亮） 第 22 页，共 26 页下一页 返回罗氏宣布罗氏宣布 454 10GB助计划的获奖者助计划的获奖者资资 他北美的奖项是授予埃默里大学、 威斯康星大学和华盛顿大学的研究人员， 他们计划对南美切叶蚁基因组以及相关的真菌和细菌基因组进行测序。 学的 Nicole Gerardo 和华盛顿大学的 George Wei大学的共生关系很感兴趣。 通过基因组同时，欧洲的 10 GB 资助是奖励给瑞士热带研究院和英国格拉斯哥大学的研究小组， 他们正在研究布氏锥虫 （Trypanos

15、oma brucei） 的一个亚种，于撒哈拉沙漠以南的非洲大陆，如果未能得到治疗，将会是致命的，而且已经出现了抗药性菌株，罗氏的资助计划将支持从事或转录组测序研究的研究人员、研究机构或公司。每个获胜点击索取点击索取 454 新一代测序仪的详细资料！新一代测序仪的详细资料！生物通报道，罗氏应用科学部近日宣布了 454 生命科学的 10 GB 基因组测序资助计划的获奖者，们分别是北美和欧洲的两个研究小组。 威斯康星大学的 Cameron Currie、埃默里大而布氏锥虫是引起非洲睡眠病的元凶。 此疾病存在nstock 是这个研究小组的领导者，该研究小组还包括美国能源部五大湖生物能源研究中心、 华盛

16、顿大学基因测序中心以及威斯康星大学和埃默里的研究人员。 大约五百万年以来， 切叶蚁一直靠养殖真菌来获取食物。就像人类的耕作一样，这个古老的系统很复杂，包含着切叶蚁、真菌、益生菌和有害的病原体之间的共生关系。 研究人员一直都对切叶蚁及相关真菌和细菌之间测序， 他们希望能理清共生和共同进化背后的遗传作用， 并了解协助切叶蚁将纤维素转化成燃料的微生物酶。 Nicole Gerardo 表示：“根据以往的生态学和进化研究，我们将利用基于 Genome Sequencer FLX 系统宏基因组学、 转录组学和基因组学来探索这种关系下蕴藏的分子进程。” 让情况更加恶化。 他们的测序计划旨在鉴定布氏锥虫中与疾病和药物抗性相关的突变和遗传变异。 瑞士热带研究院的研究人员 Pascal Maser 表示：“10 GB 资助计划所产生的数据将让我们有可能开发出 DNA 检测，来诊断睡眠病的药物抗性。” 10GBDNA的小组将获得罗氏 454 Genome Sequencer FLX