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1、1第二章 ChemOffice 2004 的使用2.1 ChemDraw 的使用 .12.1.1 化学反应图的画法 .22.1.2 中间体的画法 .52.1.3 利用环构建复杂结构 .62.1.4 费歇尔的投影式 .72.1.5 透视图的画法 .82.1.6 纽曼投影式 .92.2 Chem3D 的使用 .112.2.1 模板的创建、打开和导入 .122.2.2 模板的建立和编辑 .132.2.3 Chem3D 应用实例 .202.3 ChemInfo 的特点与使用技巧 .27第二章 ChemOffice 2004 的使用CS ChemOffice 2004 是由美国剑桥软件公司开发，包括增强
2、版和标准版。CS ChemOffice 包括三个软件：ChemDraw、Chem3D、ChemFinder。其中 Chemdraw 主要用来绘制分子结构式、反应方程式； Chem3D 可以显示分子的三维立体图象；ChemFinder 可以建立自己的数据库。这三部分既可以单独使用，又可以联合起来应用到教学和编辑的工作之中。该软件可以运行于 Microsoft Windows98、2000 以及Windows NT 下，也可以运行在多种操作系统中。由于 Windows 环境下具有的友好用户界面的切换功能，使得其资料可更加方便地共享于各软件之间。2.1 ChemDraw 的使用ChemDraw的特点
3、ChemDraw 的程序界面是标准的 Windows 窗口( 图 1)，在窗口中点击左键以激活快捷工具。用来画分子图形的各种常用操作均用图标形式显示于左边的工具箱中，不必记忆任何操作命令，亦可采用下拉式菜单方式使用。有的工具按钮上有“向右的小三角” 图标，表明有多重选项。如果需要对分子图形进行放大和缩小或者进行任意角度旋转等操作，可以直接用鼠标选中相应的结构，就可进行操作。该软件提供了各种类型的化学键、化学分子轨道、电荷、球(椭球) ；并且自带了 12 类几百个模板，从芳环、多元环、羰基化合物到糖、氨基酸等应有尽有，使用十分方便； ChemDraw 还具有了分子结构的扩展，例如在写分子式时可以
4、用 Me 代替甲基， Ph 代表苯环，在利用展开分子式功能可以将这些缩写展开。2图 1 ChemDraw 的主窗口ChemDraw 的一大特点是具有强大的分子图形编辑功能。对分子图形可以进行组合与分块处理即可以将许多分块的结构组合成为一个结构来进行处理，或者将一个结构分解成若干个小结构进行处理，这就使得使用者可以根据需要用不同的方式对化学结构进行编辑。 ChemDraw 具有对化学分子式的上下标记功能，使得对于图形的各种处理，特别是局部的处理提供了很大的灵活性。 ChemDraw 对于整个分子结构的图形不仅可以进行放大、缩小、旋转等操作，而且也能对局部进行精细的微调，并且能结合 Chem3D
5、对结构进行立体 3D 的旋转，使分子结构呈现出空间的立体形象。此外，该软件还具备了对于所绘制的化学结构进行结构式检查的功能，以确保所绘的结构式的正确性。 ChemDraw 中具有丰富的图形屏幕显示，使得可以对图形的不同部分用不同的颜色进行显示。使用ChemDraw 绘制化学结构式，可以让使用者象小孩子搭积木那样简单和方便。ChemDraw 绘制的化学结构图形可直接存为 19 种文件格式，例如可以存为 skc、wmf 图形格式，使得所保存的图形可以分别与 ISISDraw 及 Word 兼容；例如可以将反应式保存为一系列的 gif 格式，然后利用免费的软件将它转化为 gif 动画的格式，产生动态
6、的反应演示。这一功能对于化学课程的计算机辅助教学无疑是大有稗益的。利用 ChemDraw 在 Word 等系统中插入图形十分方便，只要在 Word 文档中需要的位置上打开“ 插入” 菜单，选择 “图象”，通过路径，找到文件名 xxx.wmf 后确定，即在 Word 文档中插入了所编辑的结构式图形。同样可以把它与 Microsoft Office 系统软件中的 PowerPoint 进行共享便可制作出图文并茂的专业幻灯片，取得很好的效果。此外，ChemDraw 可以用 Windows 的复制和剪贴板来进行操作,从而实现了与 Miscrosoft Word、Excel、Powerpoint 之间的
7、合用，并且可以利用 Windows 自带具有 OLE(对象链接与嵌入 )的界面支持，可以确保所绘制的图形在其它文件中自动更新。2.1.1 化学反应图的画法本节将画出如下的反应图：启动 ChemDraw，从文件莱单中，选定保存，并在对话框底部的文本框中，键人“tutl.cdx” 。选一目录来保存此文件。单击 OK 按钮。打开工具某单，确保 Fixed Lengths 和 3FixedAngles 被选定。注意： Fixed Lengths 和 Fixed Angles 在画图过程中保持键长和键角的一致性。（1）单击 Solid Bond tool 图标； （2）确定鼠标指针位置（当某一键工具被选
8、定后，指针变成十） ，按住鼠标对角地拖动鼠标至右边；（3）沿 300 角拖到键长的固定长度时（窗口的左下角表明了键长及角度） ，释放鼠标；注意：当利用键工具画图时，必须通过以上方法画键。不能通过单击某一键工具来开始某一结构的绘制。若利用一个环工具，则可以通过单击来开始绘制。接下来，增加一键。（4）将鼠标指针指向键右边的原子；（5）单击此原子可增加一键，增加的键与开始所画的键成 120 的角；注意：增加键的键角是由设置在文件菜单中的 Drawing Settings 对话框中的 Chain Angle setting 所控制。若这个键角不合理，则会使用较小的、符合逻辑的键角。接下来，再增加一键。
9、（6）将鼠标指针指向 C2 原子；（7）单击此原子增加一键；把单键变成双键：（8）指向 C2 原子，并按下鼠标；（9）在已存在的单键上，从 C2 原子拖向 C4，释放鼠标按钮；增加符号到结构中，原子符号可通过几种方式被增加。这些在下面的几步中被介绍。（10）指向所示的原子；（11）双击此原子；（12）在文本框中键入 O，在窗口中的空白处单击或单击另一工具关闭此框；在下面的几步中，将学如何复制结构，并在复制结构的基础上构造另一结构。首先，选定要复制的结构。（13）通过单击 Lasso tool 图标来选定。最后画的结构将被自动选定。接下来，将复制此模板；（14）指向要复制的部分；（15）按下鼠标
10、及 Ctrl 键；指针变成带有“”的手状，此表示正在复制一被选定的模板。（16）把长方形选定框拖向右边；当拖动时，结构被复制，原来的结构仍保持在原来的位置上。注意：以此方式复制的图片，能在窗口任何方向拖动。也可限制复制的图片的位置，以便它们与原始图片在同一水平线上。具体操作是：拖动时同时按下鼠标 CtrlAlt 键。接着调整复制的结构：（17）选定 Solid Bond tool；（18）指向如下所示的原子;（19）单击此原子增加一键；增加几个键到一个原子:（20）指向如下所示原子;（21）单击此键三次，允许在每次单击后有一暂停；注意：若击键的速度太快，将被认为是双击而打开一文本框，或被认为是
11、三击，将复制最后一次键人的原子符号。重新定位键的方向：（22）按下 Shift 键，并指向一向下的垂直键；（23）拖动此键，以便其对角地指向右，释放 Shift 键按钮；接着，利用最容易的方法建立原子符号，键盘上的大多数键已被设置成热键，并与特殊的原子符号有关。（24）指向如下所示的原子；4（25）按下小写的“O”.当利用代表一元素的热键，例如按下“O”时，该原子变为 O，H 原子会自动加到 O 原子上。接着几步将介绍利用一选定工具移动一结构至另一地方来为增加箭头提供位置，下面介绍一种新的选定方法。至此，已有构成反应图的两个结构：注意：由于所有的结构用于建立反应图，故可利用 Check Structure Command 检验所画的结构是否正确。选用选定工具，最后画的结构自动选定。为选定不同的结构，双击其中一个键，从 Structure 莱单中选定 Check structure，将有一信息框出现来表明有无错误，为检验其它结构，重复此操作。若发现有错误，单击信息框中的停止按钮。结构中有错误的部分以亮色显示。（26）选定 Marquee tool；注意：另一种方法是，选定 Lasso tool 情况下，按下 Ctrl 键来使用 Marquee 模式 1。（27）Ctrl（or option） point；（28）对角地拖动方框，一旦方框已完全包围目标，释放鼠标和键按钮。接着，
