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1、 先给大家一段查询语言：(myocardialTitle/Abstract AND infarctionTitle/Abstract) AND (loattrfull textsb AND 2008/09/26PDat : 2009/09/25PDat AND Englishlang AND Reviewptyp)。能看懂吗，是不太复杂了？其实就是查询近一年的关于心肌梗死的英文综述。所幸的是，我们不需要记这样的查询语言，有了 PubMed，我们完全可以简单的操作就可查到想要的目标文献。呵呵，有点像做广告哈。先介绍一下 pubmedPubMed 包括 MEDLINE 和 PREMEDLINE 的
2、完整内容。它还包括一些被MEDLINE 认为超出范围的文章和杂志，（这些文章或杂志）由于内容或在某一时期不在索引范围内。因此 PubMed 是比 MEDLINE 的更大的集合。看一下它所收录的数据库：PubMed 现已有 19 million 文章信息（文章的名称，发布日期杂志，摘要，全文链接以及与要查询内容相关的文章），最早的文章可追塑到 1948 年。另外，PubMed Central 还能提供大概 300000 篇免费全文。因此，PubMed 是科研过程中文献查找的一个最重要的工具，就我个人而言，一般是先在 PubMed中找到全文链接，然后再上相应的数据库查找。下面我们就一步步的教大家如
3、何有效应用该资源。首先，进入 PubMed 的首页面，网址是http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/, 如果从 NCBI 首页进入，Search 的地方选择 PubMed 就可进入了。页面介绍：最上面一行为查询框，在首页的文字部分给出了三种查询方式：1、topic 主题检索。很简单，在查询框输入主题词（如：心肌梗死myocardial infarction），点右边的“go”就 OK 了；2、authors 著者检索。注意：这里人名用的是中国人的习惯，即姓名字的首字母。如中国作者张海洋为 Zhang HY，外国作者 Fishman EK，都是姓在前，名在后。3、jo
4、urnals 期刊检索。可以用期刊的全称或缩写。从最简单的开始，比如说我们想要查询一篇心肌梗死的文章，在查询框中输入myocardial infarction，出现以下页面，注意，在查询由两个以上的单词组成的主题词的时候，我们可以将其加上括号或者双引号，如（myocardial infarction），“myocardial infarction”，这样 PubMed 在查找的时候会将其做为一个整体来查询，而不会将两者分开分别进行查询。从上图中我们可以看到，默认情况下，文章信息包括题目，作者，杂志及其发表年月卷期页，PMID 号，以及相关文章等列出来，每页 20 篇文献，以发表日期为排序依据。
5、文章的显示信息的方式是可以更改的，其中，Display 可选择 Summary, Brief(简要信息，包括杂志和 PMID), Abstract（仅摘要）o 等其他方式。 Show 表示每页显示的文章数，可选择20、50、100 篇等。Sort By 指的是文章的排序，可按作者，发表日期，杂志名等排序。Send to 指的是将该页面发送到想要存放的地方，其选择有Text(文本格式) ，File （文本文件即 txt 文件，该格式是很多文献引用软件导入文献时所用的格式，如 Endnote 等），E-mail 等；但需注意的是，保存或发送的仅仅是该页面的文章，也就是默认情况下的 20 篇，如果想
6、将较多的文献一起保存的话，可以在 Show 中选择每页展示多一些的文章数后再保存。 表示本次查询到共 158208 篇文章，其中综述19646 篇，我们点击它后便只显示综述类文章了。在综述文章后面还有一个小工具的图标 ，它允许用户在 PubMed 上注册用户，然后可将这些搜索结果保留下来，还可以将该查询相关的新的文章发到个人 E-mail 中，是一项很有用的工具。在检索结果页面的右侧还有该次检索结果中 PubMed 中心拥有的免费文章，可以免费得到全文下载。上面介绍的是最基本的查询，但我们发现，这样查找出来的文章如以心肌梗死myocardial infarction 为主题词查找共查出来 15
7、8208 篇，如此大数量的文章是没法阅读的，也没有重点，因此我们需要将查询细化，这时我们便用到了下图圈出的工具了。Limit 可以限制检索的主题词在印刷物题目，摘要还是全文，可限制文献的语言是英文，中文或者其他，可限制文献性质是研究文章还是综述，还可限制文章的发表日期。值的注意的是，使用“Limit”会排除还未标引好的文献。如果你要查找最新文献，建议不要使用 Limit。下面给一个具体的例子，比如说我们要查找一篇最近 1 年发表的题目或摘要中有心肌梗塞主题词的英文综述文章,要求找到的文献有全文, 我们在 limit 中便如做如下选择了 :此为限制文章有全文可查到(另外两个分别为免费全文和摘要,
8、也就是说我们查到的文章必须分别为有免费全文的和摘要的)点击”go”之后,我们得到如下结果,经过以上条件限制，我们检索出了 472 篇文献相关文献.上图中 Limit 圈出来的地方可以看到具体的限定条件，同时， “Limit”前出现一小勾，值得注意的是，在下一次检索时记得将小勾去掉，否则下次检索也会自动加上这些检索条件。切记!同时,我们在页面的右侧还可以发现两个小块, 分别是与我们查找的主题词相匹配的,文章题目中含有该主题词的文章, 以及在 PubMed Central 中含有的免费文章。这些都是 PubMed Central 新增加的功能。到这步为止，我们已经基本知道怎样通过限制条件来查找感兴
9、趣的文献了。但为了更精确的查找，我们进行下一步的高阶学习。我们接下来主讲 preview/index,见下图：具体来讲，Preview 是指输入关键词后仅仅看搜索到了多少结果。如上图所示，pubmed 将每次查询命名为“#数字”，上面两次查询分别为#1 和#2（左红框所示），右侧 Result 显示所查询得到文章数。（细心观察的话，大家看到限制条件搜索的结果是 481 篇，可刚才我们查到 472 篇啊，怎么回事？是因为我又重新进行了一次查询，pubmed 又新增了一些文章，由此可以看到其更新速率之快了吧）。呵呵，回到正题上来，Preview 就是我们想预先看一下该关键词有多少篇文章。其中的查询
10、可以进行组合，常见的组合词有 and, or ,not 等，意思分别如下：And：和，返回结果为同时满足该组合词的前后关键词所要求的条件Or： 或，满足该组合词的前后任一关键词即可Not：不含，满足该组合词的前一条件，但不包括后一关键词。以我们查询的心肌梗死为例，proBNP 是心肌梗死中研究较多的一个蛋白，我们想了解一下刚才我们查到的所有心肌梗死文献中其内容含有 proBNP 的有多少篇，我们便可以这样做:首先, 我们看目前的页面是最近一次搜索, 即关键词为 (myocardial infarction),而且有限制条件, 此次查询中我们不需要限制条件, 因此可以将 limit 前面的小沟去
11、掉. 至于上面查询框 ,我们可以保持不变,或者输入#1,二者都可以同时,在其下方的下拉列表中选择 Text Word, 并在后面框中输入 proBNP, 点击 AND 按钮，如下图：点击 Preview 便一切搞定了，出现以下窗口，我们可以看到找到了约 195 篇文献.点击数字 195，便可进入这 195 文献的列表页面。其实以上都不算什么，完成在限制条件里就可完成了。但我们接下来的查询时，preview/index 便有用了. 此处关键在于 index, 我暂且翻译为指数或指标, 还不明白的话没关系, 举个例子，我们在查询心肌梗死中与 probnp 研究相关时，条件为文章内容中有该关键词就可
12、以。我由于经常做 ELISA，就想查看文章中有 probnp 含量（注意是含量，不光有 probnp）的文章，这时就可以用到 index 了，我们输入相关词后先点击 index（先不点 Review），出现如下选框，我们选择 probnp concentration 后，再点击 preview, 结果便出来了。该次结果我们看到了仅有 9 篇文献中含有 probnp concentration。通过以上的例子，我们不难发现，其实 index 的作用就是把你要查找的关键词再给细化了。到此为止，preview/index 讲完了，大家有不懂的地方多体验几次就明白了。接下来再看 History顾名思义
13、，本标签主要是指你文献检索的历史，即进行了哪几次的检索。如果要查看某次结果，直接点后面的数字就可以了。另外，在此处也可以对其进行组合检索。在上面 search for 框中输入每次检索的编号（如上图红框内所示）另加运算词 and/or/not 等就可以了。另外大家也可以发现，点击红框内的检索编号时，本身会出算运算符，这和你直接输入是一样的道理。History 本身不难，在此就不多讲了。再看一下 Clip Board，也很简单，就是剪贴板的意思，怎么用我们来说一下，我们在查找完相应的文章后，出现如下界面：每篇文章前面都有一个小方框，那是用来选择文章的。我们将感兴趣的文章在前面的小框内点选，然后点
14、击上方的 Send To，并选择 Clip Board,便将选择的文章放到剪贴板里了，方便了我们查找与阅读。还有一个 Detail，就是每次检索的具体细节，相当于是网站对数据库如何查询的细节，这里都是用专业的检索语言来描述的。如下图： 至此为止，文献检索，基本讲完了。细心的读者在操作的时候，一定会注意到 pubmed 总有一些新的工具，比如我们上面讲了一大堆，其实有个新工具完全把它们包括了。大家每次检索的时候都会看到这样一个小框框里面的内容一看就明白了，它集成了上述所有的功能。大家以后不妨也用它来检索，用法和前面所讲一样，只不过是在一个页面里显示罢了。另外还有一个不得不提到，而且应用非常广泛的就是 Single Citation Matcher，也就是单篇文献匹配器。在 pubmed 的每个页面都有，在左侧边栏。图中黄框中圈起的地方。什么功能呢，主要用于如下情况，我们在阅读文献时，对后面的某篇参考文献感兴趣，这时该篇参考文献的题目，作者，杂志名，卷，期，页数都能看到，我们便不需要经历上述那么复杂的检索了。点开来看一下：一看就明白了吧，我们可以将文献上提供的资料输入，就可以查找了。注意的是，条件不需要全部输入。几个条件便可以了。 到此为止，文献检索基本就讲完了。如果大家遇到什么问题，可查看Easylabs 网站 ，加其联系 QQ 为好友，便可进行在线咨询了。
