耐亚胺培南铜绿假单胞菌CARB-3基因的发现

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1、1耐亚胺培南铜绿假单胞菌 CARB-3 基因的发现铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,Pa)是临床常见的条件致病菌,由于其固有和获得性耐药,使临床治疗成为一大难题。CARB 基因编码产生羧苄西林酶,为 -内酰胺酶 Bush 分类中的2c,在我国 CARB 基因、流行基因亚型的研究未见报道。我们研究分析了 2005 年 112 月临床分离的 34 株耐亚胺培南铜绿假单胞菌(IMPRPa) ,发现了我院 IMPRPa 携带 CARB-3 基因,现总结报告如下。1 材料与方法1.1 菌株来源与质控菌株 34 株耐亚胺培南铜绿假单胞菌来自于 2005 年 112 月我院住院病人

2、的临床分离标本(包括:痰液、尿液、伤口分泌物、脓液、血液等) ,质控菌株包括:铜绿假单胞菌ATCC27853,大肠埃希菌 ATCC25922。1.2 菌株鉴定及亚胺培南耐药菌株筛选 试验菌株经 BD Phoenix100 全自动微生物分析仪鉴定到种,采用该仪器配套药敏试验复合板筛选亚胺培南耐药的 Pa。21.3 主要仪器设备与试剂 Eppendorf centrifuge 5417R 低温离心机,恒温金属浴(杭州大和) ,MJ Peltier Thermal Cycler(MJ Research) ,Bio-RAD 电泳仪,Bio-RAD 凝胶成像系统, 琼脂糖(OXOID ) ,100bp

3、DNA Ladder Marker(大连宝森),6Loading buffer(北京天为时代) 。 1.4 模板 DNA 提取 采用蛋白酶 K 消化法。1.5 基因扩增 引物序列为:P1:5-AAA GCA GAT CTT GTG ACC TATTC -3,P2: 5-TCA GCG CGA CTG TGA TGT ATA AAC -3,扩增产物为 588bp。热循环参数为:93 预变性3min,93 60s,55 60s,72 60s,最后一个 72 延伸5min,共循环 35 周期。纯水为阴性对照。耐药基因检测试剂盒由无锡市克隆遗传技术研究所提供。1.6 结果判断 取 10l 扩增产物与

4、2l 6上样缓冲液混匀,点样于 1.5%琼脂糖凝胶,在 100V 电压电泳 30min,出现 588bp3的条带即为 CARB 基因阳性。用凝胶成像系统观察并照相。1.7 序列分析 PCR 产物经纯化后送上海生工生物工程公司进行 DNA 序列分析,测得序列在 www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST 中的 BLASTn 程序进行同源性和基因亚型分析。2 结果2.1 CARB 基因 PCR 检测结果 34 株耐亚胺培南铜绿假单胞菌共检出 11 株 CARB 基因阳性株,检出率为 32.4%,PCR 扩增结果见图 1。2.2 序列分析结果 任意抽取 5 株 CARB 基因阳性的 PCR

5、 扩增产物进行单向测序,测得序列与 GenBank 中注册号为DQ309773 的 CARB-3 基因完全同源(Identities=100%) 。因此我院流行的 CARB 基因亚型为 CARB-3 型。图 1 部分 Pa 菌株 CARB 基因 PCR 产物电泳图(略)43 讨论CARB 基因最早于 1981 年在 Pa 中发现1 ,近年又从不动杆菌、弧菌属、奇异变形杆菌中检出,已发现 CARB1-9 型 9 个亚型24 。我院 IMPRPa 的 CARB 基因携带率为 32.4%,提示医务工作者应重视和加强 Pa 的防治和耐药监测。对 CARB 基因阳性菌株进行 DNA 序列分析,经同源性比

6、较,结果显示:我院流行的CARB 基因亚型为 CARB-3 型。IMPRPa 中 CARB 基因检出、CARB-3 基因亚型发现为国内首次报道。铜绿假单胞菌是临床常见的条件致病菌,正常情况下不感染人体任何组织,但当人体免疫力下降或严重创伤或医疗操作后,Pa几乎可以感染人体的任何组织,临床可表现为局部化脓性炎症和全身性感染,常常危及患者生命。碳青霉烯类抗生素(如亚胺培南)因其独特的抗菌优势,被临床广泛用于 Pa 引起的重症感染,导致临床分离株对亚胺培南耐药性增加。5Pa 对亚胺培南耐药的机制主要有膜孔蛋白缺失、外排泵和产酶等三种机制5 。我们对 IMPRPa 的耐药机制的相关研究正在进行中。【参

7、考文献】1 Paul G,Joly G ML,Bergogne BE,et al.Novel carbenicillin-lydrolyzing -lactamases(CARB-5)from Acinetobacter calcoaceticus var.anitratus.FEMS Microbiol Lett, 1989,50(1-2):45.2 Alejandro P,Roberto G M,Hector AS,et al.CARB-9 a carbenicillinase encoded in the VCR region of Vibrio cholerae Non-O1,Non-

8、O139belongs to a family of cassette-encoded -lactamases.Antimicrob Agents Chemother,2004,48(10):4042.3 Nucleotide sequence of the blaRTG-29CARB-5) gene and phylogeny of a new group of carbenicillinases.Antimicrob 6Agents Chemother,2000,44(4):1070.4 Bert F,Branger C,Lambert-zechovsky N.Comparative ac

9、tivity of beta-lactam agents (carbapenem excepted)against Pseudomonas aeruginosastrains with CARB or OXA beta-lactamASES.Chemotherapy,2004,50(1):31.5 Okamoto K,Gotoh N,Nishino T.Pseudomonas aeruginosa reveals high intrinsic resistance to penem antibiotics:penem resistance mechanisms and their interplay.Antimicrob Agents Chemother,2001,45(7):1964.

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