《SARS-MERS及其溯源》由会员分享，可在线阅读，更多相关《SARS-MERS及其溯源（41页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、SARS和和SARS溯源溯源 Severe Acute Respiratory Syndrome 急性呼吸系统综合征急性呼吸系统综合征 非典型性肺炎非典型性肺炎 SARS的传播的传播 传播至传播至32 32 国家和地区国家和地区 全球全球80968096病例 死亡病例 死亡774 774 中国中国74297429病例 死亡病例 死亡685685 超级传播链超级传播链 超级传播事件超级传播事件 超级传播事件超级传播事件 超级传播事件超级传播事件 SARS的病原的病原 20032003年年2 2月月 衣原体 衣原体 20032003年年3 3月月 副副粘粘病毒病毒 20032003年年3 3月月2
2、424 一一种新的冠状种新的冠状病毒病毒 20032003年年4 4月月1212日日 全基因组分析确定为冠状病毒全基因组分析确定为冠状病毒 20032003年年4 4月月1616日日 宣布宣布冠冠状状病毒为病毒为SARSSARS的致病病原的致病病原 20032003年年5 5月月1515 Koch Koch 法则确认法则确认 SARS 冠状冠状病毒病毒 SARS CoV SARS CoV的分类的分类 SARS病原 病原 冠状病毒冠状病毒 Snijder et al JMB 2003 Coronaviridae Torovirinae Coronavirinae Torovirus Bafinv
3、irus Alpha Coronavirus Beta Coronavirus Gamma Coronavirus Delta Coronavirus SARS CoV来源来源 Guan et el 2003 Science SARS CoV的来源的来源 HPC Himalayan palm civet HB Hog badger RD raccoon dog B Beaver CM Chinese muntjac DC Domestic cat CH Chinese Hare CFB Chinese Ferret Badger positive by RT PCR or virus isol
4、ation the PCR product or virus isolates sequenced in the study ND not done 人与动物来源的人与动物来源的SARSSARS病毒基因组比较病毒基因组比较 ORF7 ORF7 ORF8a ORF8b ORF8 SARS CoV流行病学调查流行病学调查 market farm wild location Province Sample DateMethodsPrevalenceMethodPrevalence marketShenzheng Guangdong May 2003VNT3 4 75 RT PCR isolation
5、6 6 100 Guan et al 2003 marketXinyuan Guangdong May 2003NDNDRT PCR2 7 29 Tu et al 2004 marketXinyuan Guangdong Jan 2004NDNDRT PCR91 91 100 Kan et al 2005 marketXinyuan Guangdong Jan 2004VNT IFA WB14 18 78 RT PCR0 18Tu et al 2004 marketGuangzhou Guangdong Nov 2004NDNDreal time RT PCR0 12Wang et al 20
6、05 marketShenzheng Guangdong Dec 2004NDNDreal time RT PCR0 12Wang et al 2005 farmLuoning Henan June 2003VNT IFA0 17NDNDTu et al 2004 farmChangsha Hunan June 2003VNT IFA0 30NDNDTu et al 2004 farmQianguan Guangdong Jan 2004VNT IFA0 9RT PCR0 9Tu et al 2004 farmShanguan Guangdong Jan 2004VNT IFA0 10RT P
7、CR0 10Tu et al 2004 farmShanwei Guangdong Jan 2004VNT IFA WB4 10 40 RT PCR0 10Tu et al 2004 farmZhuhai Guangdong Jan 2004VNT IFA0 10RT PCR0 10Tu et al 2004 farmGuangzhou Guangdong May 2003NDNDRT PCR2 9 22 Tu et al 2004 farm Jiangxi May 2003NDNDRT PCR0 15Tu et al 2004 25 farms 12 provinces Jan Sep 20
8、04 NDNDRT PCR0 1107Kan et al 2005 farm Hubei April 2004NDNDreal time RT PCR7 7 100 Hu et al 2005 wildHong Kong2003 2004VNT0 21RT PCR0 21Poon et al 2005 Refence AnitibodyNucleic Acid VirusSamples Summary of investigations of SARS CoV in masked palm civets from markets farms and wild SARS病毒病毒的动物的动物来源来
9、源 一个新的冠状一个新的冠状病毒病毒 流行的疾病中没有此类病毒感染的流行的疾病中没有此类病毒感染的证据证据 SARSSARS早期病人均有与动物接触的早期病人均有与动物接触的经历经历 血清学调查显示与动物交易有关的人员血清血清学调查显示与动物交易有关的人员血清 中有中有SARSSARS病毒的病毒的抗体抗体 在市场上交易的两种野生动物 果子狸和浣在市场上交易的两种野生动物 果子狸和浣 熊 中分离到熊 中分离到SARSSARS病毒病毒 疾病进程中疾病进程中SARSSARS病毒的遗传特征病毒的遗传特征 血管紧张素转换血管紧张素转换酶酶II ACE2 是是SARS CoV的受体的受体 Receptor
10、binding motif RBM ACE2 Receptor binding domain RBD ACE2 RBM Li et al Sciences 2005 SARS CoV跨种感染机理跨种感染机理 Two residues 479 and 487 in SARS CoV Spike protein play a key role for virus interspecies transmission SARS病毒的自然宿主病毒的自然宿主 养殖场和野生的果子狸不携带养殖场和野生的果子狸不携带SARSSARS病毒病毒 果子狸被果子狸被SARSSARS病毒感染后出现病毒感染后出现SARSS
11、ARS症状症状 蝙蝙 蝠蝠 全世界有蝙蝠全世界有蝙蝠12401240种 占哺乳动物种类种 占哺乳动物种类 数的数的20 20 仅次于鼠类 仅次于鼠类 是唯一能飞行的哺乳动物 是唯一能飞行的哺乳动物 具有具有50005000多多 万年的进化历史 个体生存可达万年的进化历史 个体生存可达1010 1515年 年 群居 栖息地多样 群居 栖息地多样 蝙蝠携带多种病毒蝙蝠携带多种病毒 包括多种烈性病毒 包括多种烈性病毒 如埃博拉病毒 马尔堡病毒如埃博拉病毒 马尔堡病毒 尼帕病毒 尼帕病毒 亨德拉等 亨德拉等 蝙蝠是目前发现携带病毒数目最多的哺乳动物蝙蝠是目前发现携带病毒数目最多的哺乳动物 蝙蝠种类蝙蝠
12、种类 抗体检测抗体检测 阳性阳性 总数总数 PCR PCR 检测检测 阳性阳性 总数总数 肛拭子肛拭子 咽拭子咽拭子 棕果蝠棕果蝠 Rousettus leschenaulti 2 184 0 210 0 55 短耳犬蝠短耳犬蝠 Cynopterus sphinx 0 17 0 27 ND 大足鼠耳蝠大足鼠耳蝠 Myotis Myotis rickettiricketti ND 0 21 0 23 小菊头蝠小菊头蝠 Rhinolophus pusillus 2 6 33 3 0 21 ND 马铁马铁菊头蝠菊头蝠 Rhinolophus ferrumequinum 0 4 1 8 12 5 ND
13、 大耳大耳菊头蝠菊头蝠 Rhinolophus macrotis 5 7 71 1 8 12 5 0 3 绒山蝠绒山蝠 Nyctalus plancyi 0 1 0 1 ND 普通长翼蝠普通长翼蝠 Miniopterus schreibersi 0 1 0 1 ND 西南鼠耳蝠西南鼠耳蝠 Myotis altarium 0 1 0 1 ND 皮氏菊头蝠皮氏菊头蝠 Rhinolophus Rhinolophus pearsoni pearsoni 13 46 28 3 3 30 10 0 11 在蝙蝠体内检测到在蝙蝠体内检测到SARS病毒的病毒的 抗体和相似的基因序列抗体和相似的基因序列 蝙蝠是
14、蝙蝠是SARS样冠状病毒的自然宿主样冠状病毒的自然宿主 Li et al Science 2005 Lau et al PNAS 2005 SARS CoV 和蝙蝠和蝙蝠SL CoV基因组比较基因组比较 Human Civet SARS CoV Bat SL CoV Europe YunNan CN 24 Evolution gap missing 蝙蝠蝙蝠SL CoV地理分布地理分布 Lau et al PNAS 2005 Li et al Science 2005 Tong et al EID 2009 Drexler et al J Virol 2010 Yuan et al JGV 2
15、010 He et al JVI 2014 Wu et al JID 2016 Yang et al JVI 2015 Wang et al Emerg Micro Infect 2017 Worldwide China SARS CoV和和蝙蝠蝙蝠SL CoV受体结合序列比较受体结合序列比较 分离到分离到2株蝙蝠株蝙蝠SARS样冠状病毒样冠状病毒 SL CoV WIV1 WHO 2017 Middle East respiratory syndrome coronavirus MERS CoV update June 2017 Emerged in Arabian Peninsula 26
16、countries involved 2027 reported cases 704 death 36 mortality MERSMERS冠状病毒 冠状病毒 MERSMERS CoVCoV MERS CoV的的溯源溯源 Azhar et al N Engl J Med 2014 Briese et al mBio 2014 蝙蝠体内蝙蝠体内 MERS CoV 相关病毒相关病毒 RdRp tree 440 bp Luo et al unpublished result MERS CoV受体研究受体研究 蝙蝠蝙蝠HKU4可以利用人可以利用人DPP4 MERS CoV受体是受体是CD26 DPP4 Lu et al Nature 2013 Wang et al cell Host and Microbe MERS CoV的传播链的传播链
