突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究

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1、突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究与溯源技术的研究 卢亦愚卢亦愚突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究近近2020年来一些新的传染病却不断地出现,同年来一些新的传染病却不断地出现,同时一些已控制地传染病死灰复燃,人类与传染病的斗时一些已控制地传染病死灰复燃,人类与传染病的斗争形势依然十分严峻。争形势依然十分严峻。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究年代年代年代年代 病病病病 毒毒毒毒 名名名名 称称称称 所所所所 致致致致 疾疾疾疾 病病病病 1973 197

2、3 轮状病毒(轮状病毒(RotaviusRotavius) 婴儿腹泻婴儿腹泻1975 1975 甲肝病毒(甲肝病毒(HAVHAV) 甲型肝炎甲型肝炎1975 1975 细小病毒细小病毒B B1919(ParvoirusParvoirus) 慢性溶血性贫血,特发性再障慢性溶血性贫血,特发性再障1977 1977 埃博拉病毒(埃博拉病毒(Ebola VirusEbola Virus) 埃博拉出血热埃博拉出血热1977 1977 汉坦病毒汉坦病毒(Hantaan Virus) (Hantaan Virus) 肾综合征出血热肾综合征出血热1978 1978 丁肝病毒(丁肝病毒(HDVHDV)因子(类病

3、毒)因子(类病毒) 丁型肝炎丁型肝炎1980 1980 人人T T细胞嗜淋巴病毒细胞嗜淋巴病毒型(型(HTLV-HTLV-) T T细胞白血病细胞白血病1982 1982 人人T T细胞嗜淋巴病毒细胞嗜淋巴病毒型(型(HTLV-HTLV-) 毛细胞白血病毛细胞白血病 1983 1983 人免疫缺陷病毒(人免疫缺陷病毒(HIVHIV) 艾滋病艾滋病 1986 1986 人疱疹病毒人疱疹病毒-6-6(HHV-6HHV-6) 猝发玫瑰疹猝发玫瑰疹1988 1988 戊肝病毒(戊肝病毒(HEVHEV) 戊型肝炎戊型肝炎新新确确认认的的新新确确认认的的 2 20 02 20 0种种病病毒毒及及其其所所致

4、致疾疾病病种种病病毒毒及及其其所所致致疾疾病病突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究年代年代 病病 毒毒 名名 称称 所所 致致 疾疾 病病 1989 1989 丙肝病毒(丙肝病毒(HCVHCV) 丙型肝炎丙型肝炎1990 1990 人疱疹病毒人疱疹病毒-7-7(HHV-7HHV-7) 发热皮疹及中枢神经感染发热皮疹及中枢神经感染1991 1991 瓜纳里托病毒(瓜纳里托病毒(Guanarito VirusGuanarito Virus) 委内瑞拉出血热委内瑞拉出血热1993 1993 辛农布雷病毒(辛农布雷病毒(SNVSNV) 成人呼吸窘迫综合征成人呼吸窘迫综合征1994 19

5、94 马麻疹病毒(马麻疹病毒(EMREMR) 无菌性脑膜炎,间质性肺炎无菌性脑膜炎,间质性肺炎1994 1994 萨比亚病毒(萨比亚病毒(Sabia VirusSabia Virus) 巴西出血热巴西出血热1995 1995 人疱疹病毒人疱疹病毒-8-8(HHV-8HHV-8) 与卡波济肉瘤有关与卡波济肉瘤有关1995 1995 庚肝病毒(庚肝病毒(HGVHGV) 庚型肝炎庚型肝炎1996 1996 变异型克雅氏病(变异型克雅氏病(nvCJDnvCJD)的感染性蛋白)的感染性蛋白 海绵状脑病海绵状脑病新确认的 20种病毒及其所致疾病突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究新确认的1

6、1种细菌等微生物及其所致疾病年代年代 微微 生生 物物 名名 称称 所所 致致 疾疾 病病1977 1977 嗜肺军团菌(嗜肺军团菌(L.pneumophilaL.pneumophila) 军团菌病军团菌病1977 1977 空肠弯曲杆菌(空肠弯曲杆菌(C.jejuniC.jejuni) 肠炎肠炎1981 1981 金葡球菌产毒素金葡球菌产毒素 中毒性休克综合征(中毒性休克综合征(TSSTSS)1982 1982 大肠埃希氏菌大肠埃希氏菌O O157157:H H7 7株株 出血性结肠炎出血性结肠炎1982 1982 布氏疏螺旋体(布氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferiBorr

7、elia burgdorferi) 莱姆病(莱姆病(LymeLyme)1983 1983 幽门螺杆菌(幽门螺杆菌(Helicobacter PyloriHelicobacter Pylori) 与胃溃疡病、癌有关与胃溃疡病、癌有关1992 O1992 O139139霍乱弧菌霍乱弧菌 新型霍乱新型霍乱1992 1992 汉式巴尔通体(汉式巴尔通体(Bartonella HenslaeBartonella Henslae) 猫抓病猫抓病1993 1993 创伤弧菌(创伤弧菌(HHV-6HHV-6) 食源性败血症食源性败血症1993 1993 大肠杆菌大肠杆菌O O1212:K K1 1:H H7

8、7株株 泌尿道感染,败血症,泌尿道感染,败血症, 1997 1997 立克次体(立克次体(R.mongolotimonaeR.mongolotimonae) 蝉传淋巴结病蝉传淋巴结病突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究年代年代 寄寄 生生 虫虫 名名 称称 所致疾病所致疾病1976 1976 微小隐孢子虫微小隐孢子虫 急性和慢性腹泻急性和慢性腹泻 (Cryptosporidam ParvumCryptosporidam Parvum) 1983 1983 比氏肠细胞内原虫比氏肠细胞内原虫 顽固性腹泻顽固性腹泻 (Enterocytozoon BieneusiEnterocyto

9、zoon Bieneusi)1986 1986 卡宴环孢子虫卡宴环孢子虫 持续性腹泻持续性腹泻 (Cyclospora CayatanensisCyclospora Cayatanensis) 1991 Hellen1991 Hellen脑胞内原虫脑胞内原虫 结膜炎、弥漫性疾病结膜炎、弥漫性疾病 (Encephalitozoon Helleni)Encephalitozoon Helleni)1991 1991 巴贝西虫新体巴贝西虫新体 非典型巴贝西虫病非典型巴贝西虫病 (Babesian.SPBabesian.SP)1993 1993 家兔脑胞内原虫家兔脑胞内原虫 弥漫性疾病弥漫性疾病 (E

10、ncephalitozoon CuniculiEncephalitozoon Cuniculi)新确认的7种寄生虫及其所致疾病突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究重大人类疾病病毒大多来自动物vSARS病毒可能来自果子狸等v禽流感病毒来自禽、鸟类v艾滋病毒可能来自灵长类动物v埃博拉病毒也可能来自灵长类动物v亨德拉病毒来自狐蝠v狂犬病毒来自犬突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究鼠疫耶尔森氏菌鼠疫耶尔森氏菌 猪溶血性链球菌猪溶血性链球菌2型型突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究Source: WHO/

11、EIP 875,000例例麻疹麻疹死亡死亡 麻疹在儿童死亡中所占的比例麻疹在儿童死亡中所占的比例西太区有西太区有17,000人人死于麻疹死于麻疹突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究霍乱霍乱霍乱霍乱 世界范围内的第八次大流行世界范围内的第八次大流行世界范围内的第八次大流行世界范围内的第八次大流行 从从从从19611961年开始一直延续至今,涉及到年开始一直延续至今,涉及到年开始一直延续至今,涉及到年开始一直延续至今,涉及到110110多个国家,多个国家,多个国家,多个国家,19881988年在新疆暴发流年在新疆暴发流年在新疆暴发流年在新疆暴发流行,发病人数行,发病人数行,发病人数

12、行,发病人数39613961人;人;人;人;军团病军团病军团病军团病 是嗜肺性军团菌引起的是嗜肺性军团菌引起的是嗜肺性军团菌引起的是嗜肺性军团菌引起的 呼吸系统疾病呼吸系统疾病呼吸系统疾病呼吸系统疾病艾滋病艾滋病艾滋病艾滋病 从从从从19811981年美年美年美年美国发现后迅速国发现后迅速国发现后迅速国发现后迅速在在在在138138个国家个国家个国家个国家蔓延,我国是蔓延,我国是蔓延,我国是蔓延,我国是19861986年报道。年报道。年报道。年报道。20022002年底全年底全年底全年底全球球球球42004200万万万万HIV/AIDSHIV/AIDS,其中其中其中其中1515岁以下岁以下岁以

13、下岁以下儿童儿童儿童儿童320320万;万;万;万;20022002年死亡年死亡年死亡年死亡310310万万万万。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 二十世纪三次世界性流感大流行二十世纪三次世界性流感大流行突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 死亡(9) 救治中(2) 出院(2) 公布动物疫情(3) 确诊 病例(12) 临床诊断病例(1)11.30,刘某某,刘某某,女,女,31,农民,农民,黑山县黑山县11.2,周某某,女,周某某,女,24,农民,枞阳县,农民,枞阳县11.11,许某某,女,许某某,女,35,

14、农民,休宁县,农民,休宁县10.10,贺某某,男,贺某某,男,9,学生,湘潭县,学生,湘潭县11.23,唐某某,女,唐某某,女,10,学生,资源县,学生,资源县我国人禽流感病例分布情况我国人禽流感病例分布情况截止2006年02月21日12.4,郭某某,男,郭某某,男,35,个体商贩,遂川县,个体商贩,遂川县12.6,周某某,女,周某某,女,41,工人,三明市,工人,三明市12.17,欧阳某某,男,欧阳某某,男,6,学生,桂阳县,学生,桂阳县1.3,魏某某,女,魏某某,女,35,农民,资阳县,农民,资阳县1.13,曹某,女,曹某,女,29,农民,成都武侯区农民,成都武侯区1.27,龙某某,女,龙

15、某某,女,20,农民,邵阳市,农民,邵阳市1.6,林某某,女,林某某,女,26,农民,农民,漳浦漳浦县县10.8,贺某,女,贺某,女,12,学生,湘潭县,学生,湘潭县2.21有某,女,有某,女,9岁岁,学生学生,安吉县安吉县突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 肠道病毒引起的感染肠道病毒引起的感染突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究急性出血性结膜炎急性出血性结膜炎突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 腺病毒引起的一些疾病腺病毒引起的一些疾病突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究炭疽皮肤表现炭疽皮肤表现突发重大传染性疾病快速诊断体系的

16、建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究埃博拉病毒感染者埃博拉病毒感染者突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究2005 West Nile virus activity data, reported as of July 5th, 2005美国美国20052005年西尼罗河病毒感染地区分布年西尼罗河病毒感染地区分布突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究形态和染色性有明显特征的病原菌形态和染色性有明显特征的病原菌Northern Blot核酸杂交核酸杂交免疫荧光免疫荧光突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究PCR PCR

17、检测检测病毒分离病毒分离荧光定量荧光定量PCRPCR快速检测快速检测基因溯源基因溯源突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究基因芯片基因芯片突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究吕祖善省长视察本实验室吕祖善省长视察本实验室突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究吕祖善省长视察本实验室吕祖善省长视察本实验室突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究提高对病原体检测能力v加强对各种病原体及其特性的研究加强对各种病原体及其特性的研究v开展各种早期诊断试剂、特异性诊断方法的研开展各种早期诊断试剂、特异性

18、诊断方法的研究究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 人类疾病中很大一部分是由传染性疾病所引起,人类疾病中很大一部分是由传染性疾病所引起,随着世界人口的增长,人口的聚集与流动的频繁,加随着世界人口的增长,人口的聚集与流动的频繁,加之人口老龄化、城市化进程的加快,生态环境与气候之人口老龄化、城市化进程的加快,生态环境与气候的改变;同时由于病原基因在自然选择与人群免疫压的改变;同时由于病原基因在自然选择与人群免疫压力下产生的变异,使人类面临传染性疾病的严重威胁。力下产生的变异,使人类面临传染性疾病的严重威胁。 尤其是通过呼吸道与肠道传染的病原体更为猖獗,尤其是通过呼吸道与肠道传染的

19、病原体更为猖獗,呼吸道病原通过飞沫与气溶胶传染呼吸道病原通过飞沫与气溶胶传染, ,传播面广、传播迅传播面广、传播迅速。同时,随着国际间交流的频繁,烈性传染病随时速。同时,随着国际间交流的频繁,烈性传染病随时可能传入我国;加上由于生态环境与人类行为的改变,可能传入我国;加上由于生态环境与人类行为的改变,使新发传染病发生的危险加大,全世界使新发传染病发生的危险加大,全世界6060亿人口中,亿人口中,有一半受到新老传染病的威胁。这种现状已经并进一有一半受到新老传染病的威胁。这种现状已经并进一步对我省人民的健康构成了巨大的威胁。步对我省人民的健康构成了巨大的威胁。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与

20、溯源技术的研究 当不明原因的传染病暴发流行时,对传染原及时发现、当不明原因的传染病暴发流行时,对传染原及时发现、有效鉴别、快速诊断和提出预警,是现代传染病防治体系有效鉴别、快速诊断和提出预警,是现代传染病防治体系的必要保证,也是公共卫生应急诊断的前沿技术。的必要保证,也是公共卫生应急诊断的前沿技术。 研究研究快速诊断方法,不仅要敏感、特异,还要全面,为此建立快速诊断方法,不仅要敏感、特异,还要全面,为此建立各种传染病病原体的菌种、毒种库、血清库,同时建立起各种传染病病原体的菌种、毒种库、血清库,同时建立起相应的基因信息库,开展相关传染病的分子流行病学研究,相应的基因信息库,开展相关传染病的分子

21、流行病学研究,这对诊断与鉴别新发、输入、变异以及未知病原体有着十这对诊断与鉴别新发、输入、变异以及未知病原体有着十分重要的意义。这样才能快速正确地对不明原因的病原作分重要的意义。这样才能快速正确地对不明原因的病原作出正确诊断,并根据变异与基因毒力进行风险评估与预警,出正确诊断,并根据变异与基因毒力进行风险评估与预警,为政府部门提供决策依据,及时采取有效的预防与控制措为政府部门提供决策依据,及时采取有效的预防与控制措施。施。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 面对传染病的严峻形势,我省乃至我国的技面对传染病的严峻形势,我省乃至我国的技术储备显得远远不足,存在很大的隐患,目前迫术

22、储备显得远远不足,存在很大的隐患,目前迫切需要解决以下关键问题:切需要解决以下关键问题:突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 对于传染性疾病,尤其是暴发疫情的快速诊断,是公对于传染性疾病,尤其是暴发疫情的快速诊断,是公共卫生应急检测与传染病突发事件处理的关键,只有对共卫生应急检测与传染病突发事件处理的关键,只有对传染病作出了正确诊断,才能提供政府部门进行决策,传染病作出了正确诊断,才能提供政府部门进行决策,及时采取有效的应对措施。因此,从微量、快速、敏感及时采取有效的应对措施。因此,从微量、快速、敏感和淮确出发,建立常见传染性疾病的基因诊断体系是很和淮确出发,建立常见传染性疾病

23、的基因诊断体系是很有必要的。而目前在我省乃至我国,尚未建立起系统的有必要的。而目前在我省乃至我国,尚未建立起系统的针对常见病毒性疾病与细菌性疾病的应急检测体系,从针对常见病毒性疾病与细菌性疾病的应急检测体系,从而难以应对各种各样复杂的暴发疫情。而难以应对各种各样复杂的暴发疫情。1 1、建立与完善常见传染病疫情的快速应急诊断体系、建立与完善常见传染病疫情的快速应急诊断体系突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究随着公共卫生应急体系建设的不断深入,我们必须随着公共卫生应急体系建设的不断深入,我们必须对在国外局部暴发,危害严重,但尚未传入我国的一对在国外局部暴发,危害严重,但尚未传入我国

24、的一些重大传染病给事予高度的关注和警惕,如埃博拉些重大传染病给事予高度的关注和警惕,如埃博拉 、尼巴尼巴 、西尼罗河病毒病等等。目前,尽管这些传染性、西尼罗河病毒病等等。目前,尽管这些传染性疾病尚局限于世界部分地区,未形成全球性的流行,疾病尚局限于世界部分地区,未形成全球性的流行,我国也尚未见到报道,但由于频繁的国际交往、发达我国也尚未见到报道,但由于频繁的国际交往、发达的现代化交通和时有发生的生物恐怖事件,此类传染的现代化交通和时有发生的生物恐怖事件,此类传染病输入我国的危险随时存在,病输入我国的危险随时存在,2 2、对国外输入性传染病快速检测与溯源方法的技术储备、对国外输入性传染病快速检测

25、与溯源方法的技术储备突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究 当不明原因的传染病暴发流行时,我们必须尽快当不明原因的传染病暴发流行时,我们必须尽快作出判断与确认,才能为政府部门提供决策依据,并作出判断与确认,才能为政府部门提供决策依据,并及时采取有效的预防与控制措施。及时采取有效的预防与控制措施。20032003年,新的传染年,新的传染病病SARSSARS在我国流行与肆虐近半年之久,许多部门都查在我国流行与肆虐近半年之久,许多部门都查明不了病因,这一切都给我们带来了深刻的教训。近明不了病因,这一切都给我们带来了深刻的教训。近二、三十年来,新发传染病真正由我国发现确认的除二、三十年来

26、,新发传染病真正由我国发现确认的除B B型轮状病毒极个别的以外,均为由欧美与日本等国家型轮状病毒极个别的以外,均为由欧美与日本等国家首先发现,这一局面亟待变。首先发现,这一局面亟待变。3 3、未知及新发传染病的病原检测与确认技术储备、未知及新发传染病的病原检测与确认技术储备突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究这近十多年以来,尤其近年来传染病疾病谱的变这近十多年以来,尤其近年来传染病疾病谱的变化如何,这些暴发或流行的毒株或菌株的变异对病原化如何,这些暴发或流行的毒株或菌株的变异对病原体的毒力影响如何,以及病原变异对引起我省我国疾体的毒力影响如何,以及病原变异对引起我省我国疾病的暴

27、发流行之间的关系如何,如何根据菌毒株的基病的暴发流行之间的关系如何,如何根据菌毒株的基因变异与特异性,进行传染性疾病流行的预警,省内因变异与特异性,进行传染性疾病流行的预警,省内与国内至今还是一个空白。与国内至今还是一个空白。4 4、传染病病原的菌毒种资源库、基因信息库、传染病病原的菌毒种资源库、基因信息库与预警体系的建立与预警体系的建立 突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v研究内容与技术关键研究内容与技术关键v主要研究内容主要研究内容突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v(1 1)对常见呼吸道传染病病原,包括甲)对常见呼吸道传染病病原,包括甲1 1、甲、甲3

28、 3、乙型流、乙型流感、风疹、麻疹、腮腺炎、感、风疹、麻疹、腮腺炎、I IIVIV型副流感、呼吸道合胞型副流感、呼吸道合胞病毒、腺病毒以及猪链球菌、军团菌等;常见肠道传染病病毒、腺病毒以及猪链球菌、军团菌等;常见肠道传染病病原,包括霍乱、病原,包括霍乱、O157O157出血性大肠杆菌、引起无菌性脑膜出血性大肠杆菌、引起无菌性脑膜脑炎及出血性结膜炎的肠道病毒等;常见虫媒传染病病原,脑炎及出血性结膜炎的肠道病毒等;常见虫媒传染病病原,包括包括I I型登革热病毒、乙型脑炎病毒等建立荧光定量型登革热病毒、乙型脑炎病毒等建立荧光定量RT-PCRRT-PCR快速检测方法,并进行检测体系的优化与完善,开快速

29、检测方法,并进行检测体系的优化与完善,开展方法的灵敏度、特异性比较以及在临床标本检测中的评展方法的灵敏度、特异性比较以及在临床标本检测中的评价,形成全面的应对突发公共卫生事件的应急快速检测体价,形成全面的应对突发公共卫生事件的应急快速检测体系。系。v1、建立与完善常见传染性疾病的快速诊断体系、建立与完善常见传染性疾病的快速诊断体系突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v(2(2)建立、优化与完善针对我省已出现的重大传染)建立、优化与完善针对我省已出现的重大传染病,包括病,包括SARSSARS、禽流感、禽流感H5N1H5N1等病原体的常规等病原体的常规RT-PCRRT-PCR和荧光

30、定量和荧光定量RT-PCRRT-PCR快速检测方法。快速检测方法。v(3 3)以荧光定量)以荧光定量PCRPCR、胶体金以及、胶体金以及ELISAELISA等技术为基等技术为基础,研发适合我省各市县础,研发适合我省各市县CDCCDC进行常个见传染病检测进行常个见传染病检测的快速诊断方法,并进行效果评价与初步临床应用。的快速诊断方法,并进行效果评价与初步临床应用。 突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v 2 2、建立与完善输入性传染病快速检测体系以及、建立与完善输入性传染病快速检测体系以及病原溯源技术。病原溯源技术。v 针对国内外已有但我省情况不明的传染病病原针对国内外已有但我省

31、情况不明的传染病病原体,如西尼罗河病毒、埃博拉病毒、尼巴病毒等建体,如西尼罗河病毒、埃博拉病毒、尼巴病毒等建立包括立包括RT-PCRRT-PCR、荧光定量、荧光定量RT-PCRRT-PCR、基因测序和、基因测序和RFLPRFLP等在内的快速检测技术;同时,针对上述输入性传等在内的快速检测技术;同时,针对上述输入性传染病做好鉴别诊断技术和病原学检测的技术储备;染病做好鉴别诊断技术和病原学检测的技术储备;建立病原溯源技术储备。建立病原溯源技术储备。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v3 3、未知及新发传染病的病原检测与确认、未知及新发传染病的病原检测与确认v(1 1)为了应对可能

32、出现的原因不明性传染病的暴发,建立未)为了应对可能出现的原因不明性传染病的暴发,建立未知病毒、细菌等病原体的快速基因鉴定技术。以已知病原体知病毒、细菌等病原体的快速基因鉴定技术。以已知病原体及临床样本为对象,通过对其随机扩增、产物的分子克隆、及临床样本为对象,通过对其随机扩增、产物的分子克隆、筛选、测序及生物信息学比对等,验证未知病毒快速基因鉴筛选、测序及生物信息学比对等,验证未知病毒快速基因鉴定体系的可行性和准确性;其次,并将该体系用于临床样本定体系的可行性和准确性;其次,并将该体系用于临床样本的检测,评价其敏感性、特异性和可行性。的检测,评价其敏感性、特异性和可行性。v(2 2)建立相关哨

33、点医院,对不明原因的传染性疾病样本,尤)建立相关哨点医院,对不明原因的传染性疾病样本,尤其是人兽共患疾病的样本,进行病原体的实验室检测与确认。其是人兽共患疾病的样本,进行病原体的实验室检测与确认。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v(1 1)针对在我省暴发的各种常见及新发病毒和细菌性传染病,)针对在我省暴发的各种常见及新发病毒和细菌性传染病,采集标本进行病原分离和鉴定;采集标本进行病原分离和鉴定;(2 2)对病原分离和鉴定方法进行优化,提高其敏感性和特异)对病原分离和鉴定方法进行优化,提高其敏感性和特异性;性;(3 3)菌(毒)种冻干保存技术的研究;)菌(毒)种冻干保存技术的

34、研究;(4 4)对历年浙江省流行的重要菌(毒)种分离株的主要抗原)对历年浙江省流行的重要菌(毒)种分离株的主要抗原基因进行序列测定,并分析其抗原和基因变异特性;基因进行序列测定,并分析其抗原和基因变异特性;(5 5)建立重要菌(毒)种的分子流行病学数据库;)建立重要菌(毒)种的分子流行病学数据库;(6 6)开展重要传染病的人群血清流行病学调查,建立血清样)开展重要传染病的人群血清流行病学调查,建立血清样本库;本库;(7 7)血清流行病学资料的统计分析与数据库的建立。)血清流行病学资料的统计分析与数据库的建立。4 4、传染病病原的菌种、毒种资源库与基因信息库建立、传染病病原的菌种、毒种资源库与基

35、因信息库建立突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v(1 1)O139O139、O157O157出血性大肠杆菌毒力基因毒力评估;流感出血性大肠杆菌毒力基因毒力评估;流感病毒基因变异与流感暴发的关系;麻疹病毒基因变异与病毒病毒基因变异与流感暴发的关系;麻疹病毒基因变异与病毒抗原性变异研究。抗原性变异研究。v(2 2)开展重大传染病病原体的动物毒力试验,掌握其致病)开展重大传染病病原体的动物毒力试验,掌握其致病力和致病特性。力和致病特性。v(3 3)整合传染病监测、病原体基因抗原变异、菌群耐药监)整合传染病监测、病原体基因抗原变异、菌群耐药监测、人群免疫水平监测等信息,开展重大传染病

36、流行的风险测、人群免疫水平监测等信息,开展重大传染病流行的风险评估,建立预警体系;评估,建立预警体系;v(4 4)制定控制重大传染病流行的应急措施与应急预案。)制定控制重大传染病流行的应急措施与应急预案。5 5、传染病病原体相关基因风险评估与预警体系的建立、传染病病原体相关基因风险评估与预警体系的建立突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v预期目标v1 1、建立与完善我省常见和重大传染病的快速检测方法,、建立与完善我省常见和重大传染病的快速检测方法,形成突发公共卫生事件应急检测体系;根据我省传染形成突发公共卫生事件应急检测体系;根据我省传染性疾病谱,针对常见传染病建立一适合于不同

37、层次、性疾病谱,针对常见传染病建立一适合于不同层次、不同类型的快速诊断方法,为我省传染病暴发疫情的不同类型的快速诊断方法,为我省传染病暴发疫情的病原和免疫学针对提供快速检测的技术手段,并为开病原和免疫学针对提供快速检测的技术手段,并为开发相应试剂盒做好技术支撑。发相应试剂盒做好技术支撑。v2 2、对国外局部流行与暴发,但目前尚未传人我国的重、对国外局部流行与暴发,但目前尚未传人我国的重大传染病,建立快速诊断与鉴别诊断体系,开展病原大传染病,建立快速诊断与鉴别诊断体系,开展病原溯源技术研究。溯源技术研究。v3 3、探索和建立未知病原体的基因确认与鉴定体系,用、探索和建立未知病原体的基因确认与鉴定

38、体系,用于不明原因传染病的病原诊断;建立不明原因传染病于不明原因传染病的病原诊断;建立不明原因传染病病原体的溯源技术。病原体的溯源技术。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v4 4、建立浙江省常见与新发传染病的菌毒种库、血清库和、建立浙江省常见与新发传染病的菌毒种库、血清库和血清流行病学数据库,为重要传染病的基础与应用型研血清流行病学数据库,为重要传染病的基础与应用型研究提供有力的支撑平台,为重大传染病免疫预防研究提究提供有力的支撑平台,为重大传染病免疫预防研究提供重要的本底信息资料;掌握重要菌毒种的抗原变异、供重要的本底信息资料;掌握重要菌毒种的抗原变异、基因变异趋势,建立重

39、要毒种的分子流行病学数据库,基因变异趋势,建立重要毒种的分子流行病学数据库,为重大传染病预警系统的建立提供及时、科学、可靠的为重大传染病预警系统的建立提供及时、科学、可靠的依据。依据。v5 5、建立重大传染病病原的毒力和致病特性研究;重大传、建立重大传染病病原的毒力和致病特性研究;重大传染病的预警体系和应急控制体系。染病的预警体系和应急控制体系。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v1 1、对、对2525种我国常见的传染病建立快速诊断体系,即种我国常见的传染病建立快速诊断体系,即建立常见传染病的荧光定量建立常见传染病的荧光定量PCRPCR检测方法,并形成程检测方法,并形成程序性

40、文件;序性文件;v2 2、检测时间从收到样本到得出检测结果在、检测时间从收到样本到得出检测结果在3 3小时之内,小时之内,检测灵敏度大于目前所采用的经典与常规方法,并具检测灵敏度大于目前所采用的经典与常规方法,并具有良好的特异性;有良好的特异性;v3 3、建立国内尚未建立的输入性传染病埃博拉、西尼、建立国内尚未建立的输入性传染病埃博拉、西尼罗河和尼巴病毒等建立快速诊断与鉴别诊断方法;罗河和尼巴病毒等建立快速诊断与鉴别诊断方法;v4 4、对上述输入性传染病病原的重要基因建立测序和、对上述输入性传染病病原的重要基因建立测序和溯源技术;溯源技术;v(二)技术指标(二)技术指标突发重大传染性疾病快速诊

41、断体系的建立与溯源技术的研究v5 5、已知病原体盲样检测或考核正确率达、已知病原体盲样检测或考核正确率达100100;v6 6、建立浙江省常见与新发重要传染病菌种与毒种、建立浙江省常见与新发重要传染病菌种与毒种(10(10种种以上以上) )的数据库资料与档案;的数据库资料与档案;v7 7、建立浙江省流感、麻疹、病毒性肝炎、艾滋病等重大、建立浙江省流感、麻疹、病毒性肝炎、艾滋病等重大传染病的人群血清流行病学调查资料;传染病的人群血清流行病学调查资料;v8 8、建立、建立5 58 8种重要菌(毒)种主要基因的序列分析与抗种重要菌(毒)种主要基因的序列分析与抗原变异的分子进化数据库;原变异的分子进化

42、数据库;v9 9、建立重大传染病预警体系的组成结构及运行体制,并、建立重大传染病预警体系的组成结构及运行体制,并对其敏感性、及时性、高效性、可操作性和可拓展性进对其敏感性、及时性、高效性、可操作性和可拓展性进行评估的标准;行评估的标准;突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v 该项目由浙江省疾病预防控制中心、浙江大学病原微生物该项目由浙江省疾病预防控制中心、浙江大学病原微生物所、浙江大学相关医院、宁波市疾病预防控制中心共同合作,所、浙江大学相关医院、宁波市疾病预防控制中心共同合作,全省其他全省其他1111各市级疾病预防控制中心协助完成。各市级疾病预防控制中心协助完成。v 本项目针

43、对本省本项目针对本省2525种常见和重大传染病建立快速检测方法,种常见和重大传染病建立快速检测方法,形成完整的应对突发公共卫生事件的应急检测体系;针对国内形成完整的应对突发公共卫生事件的应急检测体系;针对国内外现有但我省情况不明的各种病原体,包括埃博拉、西尼罗河外现有但我省情况不明的各种病原体,包括埃博拉、西尼罗河和尼巴病毒等引起的新发及输入性传染病建立核酸快速诊断及和尼巴病毒等引起的新发及输入性传染病建立核酸快速诊断及鉴别诊断方法,以及传染病病原体的溯源技术的建立;未知病鉴别诊断方法,以及传染病病原体的溯源技术的建立;未知病原基因鉴定与溯源技术的建立;通过对传染病病原体相关基因原基因鉴定与溯

44、源技术的建立;通过对传染病病原体相关基因,掌握我省重要菌(毒)种重要基因的序列分析与抗原变异等,掌握我省重要菌(毒)种重要基因的序列分析与抗原变异等分子流行病学数据、重大传染病的人群血清流行病学资料,进分子流行病学数据、重大传染病的人群血清流行病学资料,进行风险评估以及预警体系的建立。行风险评估以及预警体系的建立。项目实施方案与技术路线项目实施方案与技术路线(一)实施方案(一)实施方案突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究v1 1、本中心在病毒性疾病快速诊断方面积累了丰富经验,建立了、本中心在病毒性疾病快速诊断方面积累了丰富经验

45、,建立了流感甲流感甲1 1、甲、甲3 3、乙型、乙型、H5H5型、麻疹、风疹、腮腺炎、呼吸道合胞型、麻疹、风疹、腮腺炎、呼吸道合胞病毒等呼吸道病毒及肠道病毒等一整套完整的病毒等呼吸道病毒及肠道病毒等一整套完整的RT-PCRRT-PCR快速检测方快速检测方法,并应用于暴发疫情的应急诊断;本研究小组已建立较为成熟法,并应用于暴发疫情的应急诊断;本研究小组已建立较为成熟的病毒荧光定量的病毒荧光定量PCRPCR检测平台,已建立了检测平台,已建立了SARSSARS、麻疹、登革热等、麻疹、登革热等多种病原的荧光定量多种病原的荧光定量RT-PCRRT-PCR检测方法;本研究组分离到检测方法;本研究组分离到S

46、ARSSARS冠状冠状病毒病毒2 2株,并对株,并对1 1株毒株进行了全序列测定,登录株毒株进行了全序列测定,登录GenBankGenBank;在细;在细菌方面,建立了霍乱弧菌、出血性大肠杆菌、猪链球菌、军团菌、菌方面,建立了霍乱弧菌、出血性大肠杆菌、猪链球菌、军团菌、沙门氏菌等的沙门氏菌等的RT-PCRRT-PCR与荧光定量与荧光定量PCRPCR等快速检测方片。此外,本等快速检测方片。此外,本研究组近几年分离并保存了多种病毒与细菌的分离株或标准株。研究组近几年分离并保存了多种病毒与细菌的分离株或标准株。v六、现有工作基础和条件六、现有工作基础和条件突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技

47、术的研究v2 2、本实验室是浙江省重点实验室,拥有、本实验室是浙江省重点实验室,拥有DNADNA测序仪、目标蛋测序仪、目标蛋白分析仪、荧光定量白分析仪、荧光定量PCRPCR仪、超速冷冻离心机、高速冷冻离仪、超速冷冻离心机、高速冷冻离心机、心机、PCRPCR分析仪等从事分子生物学研究的先进仪器用于研分析仪等从事分子生物学研究的先进仪器用于研究;拥有流速细胞仪、生物安全柜、全自动干烤箱、纯水装究;拥有流速细胞仪、生物安全柜、全自动干烤箱、纯水装置、置、CO2CO2生化培养箱等用于细胞培养和免疫学试验的仪器,生化培养箱等用于细胞培养和免疫学试验的仪器,为本项目的开展提供了坚实的基础。总之,具有开展本项目为本项目的开展提供了坚实的基础。总之,具有开展本项目所需的专门实验室,包括开展细胞培养、免疫学分析、分子所需的专门实验室,包括开展细胞培养、免疫学分析、分子生物学研究的专门实验室与相应的仪器设备、研究材料等,生物学研究的专门实验室与相应的仪器设备、研究材料等,即具备开展该项研究的各种工作条件。即具备开展该项研究的各种工作条件。突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究谢谢大家突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究突发重大传染性疾病快速诊断体系的建立与溯源技术的研究

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