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1、浅谈分子定向进化技术浅谈分子定向进化技术 浅谈分子定向进化技术前言前言n n分子定向进化又称实验室进化或进化生物技术,它在体外模拟自然进化机制,使进化朝着人们需要的方向发展。近年来,分子定向进化技术研究和应用的领域逐渐扩大,涉及基因治疗、医学诊断、食品和化学工业等各方面。随着各种新型突变技术和新型检测系统的出现,分子定向进化技术研究将向纵深发展。浅谈分子定向进化技术一一.分子定向进化技术分子定向进化技术n n1.分子定向进化技术的定义n n分子定向进化(molecular directed evolution)是在分子水平研究所需生物的特定基因或蛋白质,可以在试管里进行无性繁殖或有性繁殖,其实
2、质是达尔文进化论在分子水平上的延伸和应用,是在体外模拟突变、重组和选择的自然进化机制,使进化朝着人们需要的方向发展。浅谈分子定向进化技术n n2.原理n n在待进化酶基因的PCR扩增反应中,利用TaqDNA多聚酶不具有3 一5 校对功能的性质,配合适当条件,以很低的比率向目的基因随机引入突变,构建突变库,凭借定向的选择方法,选出所需性质的优化酶(或蛋白质),从而排除其他突变体 。分子定向进化其实是突变加筛选选择的重复循环,且整个进化过程完全是在人为控制下进行的。 浅谈分子定向进化技术二二.分子定向进化的选择策略分子定向进化的选择策略n n1.致错PCR(errorprone PCR,epPCR
3、)技术是指在利用Taq酶进行PCR扩增目的基因的同时引入碱基错配,导致目的基因随机突变。 n n2. .盒式突变(cassette mutagenesis)技术 即寡核苷酸介导的诱变技术,是用一段人工合成具有突变序列的DNA片段,取代野生型基因中的相应序列。 浅谈分子定向进化技术n n3. DNA改组(DNA shuffling)技术,又称有性PCR(sexualPCR)或分子育种(molecular breeding),即DNA分子的体外重组。通过DNA shufling技术,既可对单基因或DNA片段进行改组,也可对基因组或染色体等进行改组 。浅谈分子定向进化技术n n4.高通量筛选技术(H
4、igh-Throughput Screening,HTS) 表面展示技术是筛选蛋白质突变体库的高通量筛选方法,特别在抗体的研究当中应用非常普遍,具有高效、高灵敏度等特点。目前,表面展示技术有:噬菌体表面展示技术,细菌表面展示技术,酵母表面展示技术,酵母双杂交系统,核糖体展示技术蛋白质片断互补试验. 浅谈分子定向进化技术n n(1 1). .噬菌体展示技术噬菌体展示技术(Phage Display)(Phage Display)n n 噬菌体展示技术是第一个真正用于体外高通量筛选噬菌体展示技术是第一个真正用于体外高通量筛选的方法。人们利用这一技术可以将各种自然界或人的方法。人们利用这一技术可以将
5、各种自然界或人工合成的工合成的DNADNA整合到丝状噬菌体基因中,以融合蛋整合到丝状噬菌体基因中,以融合蛋白的形式表达在噬菌体表面,利用噬菌体展示库所白的形式表达在噬菌体表面,利用噬菌体展示库所固有的基因型和表现型之间的直接关联进行检测。固有的基因型和表现型之间的直接关联进行检测。如抗原抗体反应,生物素结合反应等,根据反应的如抗原抗体反应,生物素结合反应等,根据反应的性质进行分离,从中筛选出人们所需的突变蛋白质。性质进行分离,从中筛选出人们所需的突变蛋白质。 浅谈分子定向进化技术n n(2).细菌细胞表面展示技术(Bacterial CellSurface Display) n n结合荧光激活
6、细胞筛选仪(Fluorescence Activated Cell Sorting,FACS)或流式细胞筛选仪(flow cytometry)是非常有效的高通量筛选方法 . 该技术是目前惟一能够定量检测单细胞水平和大量突变体酶催化活性的方法。它能够决定突变体库中每个克隆的功能特性 。浅谈分子定向进化技术三三 .分子定向进化技术的应用分子定向进化技术的应用n n1.在治理环境生物污染方面的应用 n n有机磷的降解,Cho等通过两轮的DNA改组和筛选,分离得到可提高降解甲基对硫磷的突变体,其中典型的突变体为22A11,水解甲基对硫磷的能力较野生型提高了25倍。n n诸如此类还有对三氯丙烷、 三氯乙
7、烯、五氯苯酚的降解.浅谈分子定向进化技术n n2.分子定向技术在农业中的应用 n n农业饲料酶制剂中的应用:通过易错PCR和DNA改组技术,获得高比活和低pH淀粉酶;碱耐受性和在碱性条件下高活性的纤维素酶 ;耐高温的纤维素酶;水解二糖的能力较野生型高31葡聚糖内切酶;温度耐受性超过90,最适pH为酸性的木聚糖酶。 浅谈分子定向进化技术n n3. 在蛋白质药物上的应用 n n对酶类药物的定向进化,主要体现在提高活性和增强稳定性上。n n使用DNA改组技术对人DNA拓扑异构酶的碳末端进行定向进化。筛选到的突变体,对喜树碱的敏感性比野生型的提高了2228倍。n n对血纤维蛋白溶酶原催化抑制1(plasminogen activator inhibitor type 1PAI一1)进行改组,筛选到的突变体的半衰期比野生型的提高了245倍,突变位点在50,56,61,70,94,150,222,223,264和331。浅谈分子定向进化技术四四.展望展望n n伴随着分子生物学新理论和新技术的发展,分子定向进化的新方法和新技术必将会不断涌现,层出不穷,必将会出现更多更好的新方法,解决更具体的问题,取得更大的进步。浅谈分子定向进化技术浅谈分子定向进化技术