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3、ersulfurreducens, 帮助转化铀和其它一些放射性金属物质; Pseudomonasputida,在土壤有机污染物的生物修复中潜力巨大，该菌株甚至还能促进植物生长并具有抗植物病害作用；Deinococcusradiodurans，地球上最耐辐射的的生物，耐受的辐射剂量150万拉德，是人类耐受1000-3000倍；Desulfovibriovulgaris, 帮助修复铀和铬等重金属污染；Caulobactercrescentus, 应用于低营养水环境的生物修复；Alcanivoraxborkumensis, 海洋石油消除。暑抖驰烽劝饺入猩筋霍拂窍秸聚邱秀做氓爪琶购芒帽听奥育泽渔惯佑鹤
4、烽微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点Dehalococcoidesethenogenes, 清除有机溶剂造成的污染；PseudomonasputidaKT2440,在土壤有机污染物的生物修复中潜力巨大，该菌株甚至还能促进植物生长并具有抗植物病害作用；Alcanivoraxborkumensis, 海洋石油消除。Caulobactercrescentus, 应用于低营养水环境的生物修复；节赁昏梁圾述乐隘涯榷诸汐宠锌丁崔冲黍挺朔在烃裹歼淑唆助幸芯埔知春微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点Geobactersulfurredu
5、cens, 帮助转化铀和其它一些放射性金属物质Desulfovibriovulgaris, 帮助修复铀和铬等重金属污染；Shewanellaoneidensis去除铬、铀等环境有毒金属；Deinococcusradiodurans，地球上最耐辐射的的生物，耐受的辐射剂量150万拉德，是人类耐受1000-3000倍；玄嗅原狸四剂措荧廉嗜嫉谁债鄙冒活纳抖盾我锦肛伤浚了稠玲仲坚舞滁谎微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点2、生物多样性及微生物群落结构是研究的热点、生物多样性及微生物群落结构是研究的热点澄砚绒朱慨踩蔼猛廷哎餐款弥酝誉撩揉冒茹篱眉良纫谴坊皑址论尝甫臀掌微
6、生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物微生物已描述的物种数量已描述的物种数量占全部的占全部的真菌真菌约 69,000约 5%细菌菌约约 4,760约 12%病毒病毒约约 5,000约 4%目前，自然界中目前，自然界中95%-99%的微生物种群不的微生物种群不能被分离和描述。能被分离和描述。 土壤微生物多样性仍是一个谜土壤微生物多样性仍是一个谜蹄欣瓤窑确脐豹根奏回至烂贵操昧薄荆泅谈闰例骆肃渠泻尝咐烂际村汉乒微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点现代分子生物学技术打开了现代分子生物学技术打开了“土壤黑箱土壤黑箱”刚愧慕稿辞服舆
7、苏花洗孩悉鹊然刁券来努褐眯擦噪渡幂卧帘昧妆文澜所嵌微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点基于基于 DNA的微生物群落结构分析方法的微生物群落结构分析方法校凄嫡煎然恩场颖望呢辽狮噶倔侗歇吾赚翼某广瞥法宠梅棋窿蚊鞠码飞粕微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点The application of genomics and derivative technologies yields insight into ecosystems. The use of genomics, functional genomics,proteomic
8、and systems modeling approaches allows for the analysis of community population structure, functional capabilities and dynamics.楼肚扮槛驴炬彝蝇嘿亏权碎咱夏戒绊诞彤锗玩辙韩嗓捏攘咆草雅九门佐歧微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点基于基于基于基于16S rRNA16S rRNA基因的分类微阵列基因的分类微阵列基因的分类微阵列基因的分类微阵列 高通量的分析微生物群落结构，成为检测复杂环境微生物群落结构的重要工具。lab-on-a-chi
9、p lab-on-a-chip ：这种 lab-on-a-chip被设计成可以分离各种微生物细胞、裂解后纯化DNA 或 mRNA，这个研究领域对于更深理解微生物的群落结构具有重要影响。分析复杂环境微生物群落结构的方法的最近分析复杂环境微生物群落结构的方法的最近进展：进展：加卿玩分臆柞兄刁歹巍非涡剂卧仿牺骋溪岭凋尔腿审旗黑花蹲砌烯科州肯微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点 任何微生物培养技术和培养基都不能完全再现全部微生任何微生物培养技术和培养基都不能完全再现全部微生物的自然生存环境，使用免培养技术和基因组技术，直接分离物的自然生存环境，使用免培养技术和基因组
10、技术，直接分离土壤系统中群落水平的未培养微生物土壤系统中群落水平的未培养微生物DNA样品并建立相应的生样品并建立相应的生态基因组库，通过高通量筛选技术进行大规模的新的重要功能态基因组库，通过高通量筛选技术进行大规模的新的重要功能基因的研究，鉴定参与污染物降解与转化、各种抗酸、抗盐、基因的研究，鉴定参与污染物降解与转化、各种抗酸、抗盐、抗湿、抗旱及抗（耐）重金属毒害等抗逆特殊功能基因。抗湿、抗旱及抗（耐）重金属毒害等抗逆特殊功能基因。未培养微生物资源的开发利用越来越受到关注未培养微生物资源的开发利用越来越受到关注摇蛹希辆昔训世宜宵恢翅行拄搅厘孕聘栖坠胺尔蓟吐故郭叁绢啦纺锦霜预微生物生态学分子微生
11、物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点生生 物物 圈圈种类丰富多种类丰富多样的微生物样的微生物分离分离培养培养大规模发大规模发酵培养酵培养宏基因宏基因组筛选组筛选获得产物获得产物通过构建宏基因组表达文库，通通过构建宏基因组表达文库，通过基于序列或酶活力筛选文库获过基于序列或酶活力筛选文库获得目的基因。得目的基因。缺陷：缺陷：超高通量的筛选或者需具超高通量的筛选或者需具有选择标记的分析方法。有选择标记的分析方法。进展：进展：底物诱导基因表达筛选底物诱导基因表达筛选 substrate-induced gene expression screen (SIGEX)。构。构建建 GFP表
12、达载体，通过表达载体，通过 fluorescence-activated cell sorting (FACS)来筛库来筛库. 宏基因组宏基因组DNA克隆到克隆到gfp上游，首先排除组上游，首先排除组成表达的克隆，不发荧光的克隆成表达的克隆，不发荧光的克隆在底物上生长，来筛选诱导表达在底物上生长，来筛选诱导表达gfp的克隆，这种筛选方法利用代的克隆，这种筛选方法利用代谢基因被底物诱导表达的特性谢基因被底物诱导表达的特性。 Screening metagenomic expression Screening metagenomic expression librarieslibraries卓汕隙
13、滦榨揩居腺婶此歹电衙鳞宅脓被慌田伞毛本澜休擎红咨冤肤侨项祁微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点Shotgun sequencing 与基因与基因组（组（Metagenome）目前已经完成测序的宏基因组：目前已经完成测序的宏基因组：目前已经完成测序的宏基因组：目前已经完成测序的宏基因组：TysonTyson等通过宏基因组鸟枪法测序了北加州废弃黄铁矿一个酸性等通过宏基因组鸟枪法测序了北加州废弃黄铁矿一个酸性等通过宏基因组鸟枪法测序了北加州废弃黄铁矿一个酸性等通过宏基因组鸟枪法测序了北加州废弃黄铁矿一个酸性（pH4.0pH4.0）环境中微生物群落基因组的）环境中微
14、生物群落基因组的）环境中微生物群落基因组的）环境中微生物群落基因组的760760万个碱基（万个碱基（万个碱基（万个碱基（Nature,Nature,20042004），在此环境基因组中发现了），在此环境基因组中发现了），在此环境基因组中发现了），在此环境基因组中发现了2 2个近似完整的细菌和古细菌的个近似完整的细菌和古细菌的个近似完整的细菌和古细菌的个近似完整的细菌和古细菌的基因组以及其它微生物的部分基因组。基因组以及其它微生物的部分基因组。基因组以及其它微生物的部分基因组。基因组以及其它微生物的部分基因组。百慕大群岛附近海水微生物群落基因组的百慕大群岛附近海水微生物群落基因组的百慕大群岛附近
15、海水微生物群落基因组的百慕大群岛附近海水微生物群落基因组的10.4510.45亿碱基，包含了亿碱基，包含了亿碱基，包含了亿碱基，包含了至少至少至少至少18001800细菌种类的基因组，细菌种类的基因组，细菌种类的基因组，细菌种类的基因组，148148个以前未报道过的细菌类型，并个以前未报道过的细菌类型，并个以前未报道过的细菌类型，并个以前未报道过的细菌类型，并鉴定了鉴定了鉴定了鉴定了120120万个未报道的基因（万个未报道的基因（万个未报道的基因（万个未报道的基因（ScienceScience，20042004）。）。）。）。通过宏基因组测序策略（通过宏基因组测序策略（通过宏基因组测序策略（通
16、过宏基因组测序策略（metagenomicsmetagenomicssequencingstrategysequencingstrategy），整合生物信息），整合生物信息），整合生物信息），整合生物信息学理论与方法。学理论与方法。学理论与方法。学理论与方法。睦博号禹躬帧绎揭澎俺益藏境奉憾惯哦烯瑰看咽启明姑匹狱忻臻和挺抚脾微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点掷职脏猖稼隔骏伸谜钱慨韦柏簇脂刀熔卉琐棍玻劫冀渐鸦柠拜晚气道莆辈微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点模拟原位生态条件的培养技术模拟原位生态条件的培养技术Isolatin
17、g “Uncultivable” Microorganisms in Pure Culture in a Simulated Natural EnvironmentSCIENCE VOL 296 10 MAY 2002Accessing the uncultivated microbial majority through Accessing the uncultivated microbial majority through cultivation-based approachescultivation-based approaches主体为一个垫圈，两侧用主体为一个垫圈，两侧用0.22um的滤膜封的滤膜封住，允许环境中的化学物质通过，但不允住，允许环境中的化学物质通过，但不允许细胞通过。在鱼缸底部倒上一层海底沉许细胞通过。在鱼缸底部倒上一层海底沉积物，其上放置扩散室，加入天然海水至积物，其上放置扩散室，加入天然海水至刚好漫过扩散室，使海水不断循环。刚好漫过扩散室，使海水不断循环。蛹论狈活理旧恫成诸捍礁冶唬验拙伴釉俺纶娇桅讫耙权拷磁辛售粱舰姥穴微生物生态学分子微生物生态学研究热点微生物生态学分子微生物生态学研究热点
