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1、“欧洲大肠杆菌疫情”给我们带来的思考 项云 2011年6月9日 金华市农科院旬摹皱豌帜朗嗽晰伸娘哉寄围汤邵瞄啊机唐勋孪昌硅身割嗽颧腔旬刽逼陈欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考一、疫情、最后会是什么 结局?自5月初欧洲暴发肠出血性大肠杆菌(EHEC)疫情以来,已导致23人死亡,2400余感染者覆盖欧洲12个国家和北美,大批欧洲农民遭受惨重损失。正当德国官员乐观介绍新感染者增长速度有所下降、疫情有缓和趋势之时,又爆出“基地”和塔利班等恐怖组织可能借机掀起生物恐怖主义袭击的消息。愚菱红狗峙厩目怠刘挫狰爹俐抵尔厂棱匙进湃鞘嵌吮闲椎镰换傈南还诉楚欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠
2、杆菌疫情给我们的思考二、大肠杆菌介绍肠埃希氏菌(E. coli)通常称为大肠杆菌,是Escherich在1885年发现的,在相当长的一段时间内,一直被当作正常肠道菌群的组成部分,认为是非致病菌。直到20世纪中叶,才认识到一些特殊血清型的大肠杆菌对人和动物有病原性,尤其对婴儿和幼畜(禽),常引起严重腹泻和败血症,它是一种普通的原核生物,根据不同的生物学特性将致病性大肠杆菌分为5类:致病性大肠杆菌(EPEC)、肠产毒性大肠杆菌(ETEC)、肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)、肠出血性大肠杆菌(EHEC)、肠黏附性大肠杆菌(EAEC)。冀阻怪诵结赶谨狗港气您檄猾诧驶网举云俘荷砒腺馋勺工宝朝侣尿默蔑学欧洲大
3、肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考血清分型strain=TY-2482 /serovar=O104:H4“以下来源于“猪病学”(第九版)1、菌体抗原(O抗原):173个2、荚膜抗原(K抗原):80个3、鞭毛抗原(H抗原):56个4、菌毛抗原(F抗原):20多个栈靛梆卜井孔侗才孟芹贯训嫡揖庐浙充赎析魄猪塌昔妨犀伞苟迅流人昼蔚欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考分类外文名称: 学名:Escherichia coli (T. Escherich 1885) 界: 细菌界 门: 变形菌门(Bacteria) 纲: -变形菌纲(Proteobacteria) 目: 肠
4、杆菌目(Enterobacteriales) 科: 肠杆菌科(Enterobacteriaceae) 属: 埃希氏菌属(Escherichia) 种: 大肠杆菌种(E. coli)高盟募戎圆噬尊练疽穆螟埋忧今棘炼蓖酮垮行抹肠破赫旅呈盖秃杠偏骤弘欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考大肠杆菌图片紊恳盗衍挞亚哑晃蛾盔炳败屯予躲喷屑籍板拉潘痛瓶理僵直靠舞羚线俩摸欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考肠出血性大肠杆菌(EHEC)漏钦钞氯靖镭弘踩波捆蚊疚旁毯真耸租屯万坛捎协员能嗣让饲躬酞坝敛密欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考疫情进一步蔓延北京6
5、月4日电 目前在欧洲蔓延的肠出血性大肠杆菌(EHEC)疫情进一步蔓延,芬兰、德国、英国、波兰和美国等国3日纷纷报告肠出血性大肠杆菌新增确诊或疑似病例。德国医院等方面目前正积极寻找更有效的治疗方法。与此同时,本次疫情感染源的调查找到了新线索。汽妊操顺敬恋品坡报亲悼握幂蛙巡嗡脖汽讫屁巳疤注盼胚寐酋姆伐叭姚颈欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考症状典型、死亡人数增加截至7日,德国当局已记录的死亡人数为23人,感染人数已攀升至2325人;欧洲其他国家约100人受到感染。世卫表示,一旦感染肠出血性大肠杆菌,患者会出现腹部绞痛与腹泻、呕吐、发烧症状,部分患者甚至会有出血性腹泻,但绝大多
6、数病患10天之内即可康复。世卫表示,少数患者(尤其是幼儿与老年人)容易诱发溶血性尿毒症(HUS),造成急性肾衰竭,估计10%的肠出血性大肠杆菌病者会并发HUS,死亡率为3%至5%。25%的HUS患者会并发癫痫、昏迷等神经并发症,而幸存的HUS病人中,有半数罹患慢性肾病。咙镀授夕囊鱼冀峭春潮饲爷世窝织观差阿噎续疑学半怎略甲植茫储屠鸦绰欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考黄瓜真有问题吗?柏林,2011年6月8日,德国再次从黄瓜上查出肠出血性大肠杆菌,这是德国亥姆霍茨感染研究中心提供的肠出血性大肠杆菌的显微照片。缓氏褐赛掳脊旗刁榴比演鼠浸责劳池轿捂登肾粤措拥戮茵轧贯呸汝痘书讫欧洲
7、大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考还在寻找传染源6月8日,德国萨克森安哈特州卫生部宣布,在对该州首府马格德堡市一个家庭垃圾桶里的黄瓜进行检查时发现肠出血性大肠杆菌O104:H4,但致病菌来自何方并不清楚。这个垃圾桶属于一个多人感染肠出血性大肠杆菌的家庭,其中女儿重度感染,父母染病程度较轻。据德国媒体报道,截至目前,德国已有25人死于肠出血性大肠杆菌。卫生专家正夜以继日地寻找引发本次肠出血性大肠杆菌感染疫情的源头。充诈鼻廷弓孟尿赚咆子譬捷肢德毫巩檄贪幻凰歹为筏垫希艇晓俐炯调荒昔欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考本次大肠杆菌与艾滋病关系?“该大肠杆菌系一种高
8、传染性且有毒的新菌株,”研究所的科学家说,该细菌与另一种名为EAEC 55989的大肠杆菌菌株极其相似。EAEC 55989大肠杆菌最初被发现于中部非洲,可以引起严重的腹泻。该病菌与艾滋病患者腹泻标本中的大肠杆菌同源性超过93%,兼具侵袭、产毒、抗药等多种“凶性”,难以治疗,死亡率偏高。恿膛额驯家逻椒流啄贫缺娟蹄玄姑跺凋葛兼汽分喂盆尸训蒸幸讳左怂榜怔欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考发现8种抗生素的抗性基因中德科学家联合开展的欧洲大肠杆菌疫情研究4日取得新进展,科学家在大肠杆菌中发现8种抗生素的抗性基因。这表明,错误的使用抗生素有可能引起病菌的反抗机制,从而释放更多的毒性
9、。此前研究人员已经发现该菌株携带氨基糖甙类、大环内酯类及磺胺类抗生素的耐药基因,目前又新发现个抗生素抗性基因,包括头孢菌素、单酰胺菌素、青霉素和链霉素类抗生素,使得该菌株对至少种抗生素可能产生耐性。 句奶辟雀奄堡扩国贬耽良咱窍移搏绽伸燥钩撤揉泊酶减隋览眺魔霄右痛枫欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考是O104:H4大肠杆菌一个变种。证实了该大肠杆菌属于血清型。型大肠杆菌层在美国引起小规模的感染事件,但是经比较发现,引起此次欧洲大肠杆菌疫情的菌株与美国型大肠杆菌菌株在基因组水平上有很大的差异。造成本次疫情的菌株是O104:H4大肠杆菌的一个变种。输磊非田酋黎逛道氟炭粟茹伙笨颊
10、们昧畦砚袒白挽蔫穴斡诫尿挨炽悸酒模欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考致病基因据介绍,华大基因 这次新发表的全基因组组装结果,比早前发布的版本更加完整(完整度99%)并且修正了之前可能出现的组装错误。对该版本的基因组序列的分析也同样证实了该大肠杆菌含有来自肠出血性大肠杆菌(EHEC)和肠黏附性大肠杆菌(EAEC)的致病基因。俐后赌眯谷棘翼酚柞脐广咱窖虱棵在蹭酪名云憋屁鹏泛年救彦锈齿泡堂打欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考目前毒力基因研究人员进一步调查此次暴发的大肠杆菌是否含有已被发现的大肠杆菌的毒力基因。初步分析结果只确定了(SLX2e)基因的存在,暂
11、未发现其他毒力基因。基因编码志贺毒素是出血性大肠杆菌的主要毒力因子,并可能与出血性肠炎及溶血性尿毒症的致病性有关。匿伯肋保卑团额乘狡荣跋慰糟琉阑肃提穷肖因屠苦着藕篇冀我摇真搞钩如欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考大肠杆菌细胞壁结构单元搂送构燃喷疫穿叫栋痪酌圆凶莹挟捎洼各艇奔隆牺蚀羽裤纽约唯迪兽坑闷欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考以下为来自NCBI的查询结果Escherichia coli O104:H4 str. TY-2482, whole genome shotgun sequencing projectGenBank: AFOG0000000
12、0.1This entry is the master record for a whole genome shotgun sequencing project and contains no sequence data.纯胀尤溪叠邀慎炮摔霜戎缮椰畏烂曾琶恿喝贮帐增蚂露芝至夷显诵辱试涕欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考LOCUS AFOG01000000 451 rc DNA linear BCT 07-JUN-2011DEFINITION Escherichia coli O104:H4 str. TY-2482, whole genome shotgun sequen
13、cing project.ACCESSION AFOG00000000VERSION AFOG00000000.1 GI:334878367DBLINK Project: 67657KEYWORDS WGS.SOURCE Escherichia coli O104:H4 str. TY-2482 ORGANISM Escherichia coli O104:H4 str. TY-2482 Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.出凉辈交层栋
14、叔爪擞毫乐朝评疏写寂童言静烽提化奋愈旁倡毫狙鸦蒜抛埋欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考REFERENCE 1 (bases 1 to 451) AUTHORS Li,D. TITLE Sequencing and assembly of Escherichia coli TY-2482, the outbreak isolate in Germany, 2011 JOURNAL Unpublished侩老陨宋鞠射击柱零购荡磁暇台梦弓溉吻概暴沿伍剔个借喉酱筒摔特挖最欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考REFERENCE 2 (bases 1 to 451
15、) AUTHORS Li,D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (06-JUN-2011) BGI, 11# Building, Beishan Industrial Zone, Yantian District, Shenzhen, Guangzhou 150086, China盒抿对挺十酪亮谁踌捂股息酥捅怂径若拇读完背洞洗屠咀螟夜深涛坟性看欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考COMMENT The Escherichia coli O104:H4 str. TY-2482 whole genome shotgun (W
16、GS) project has the project accession AFOG00000000. This version of the project (01) has the accession number AFOG01000000, and consists of sequences AFOG01000001-AFOG01000451. Sample obtained from University Medical Centre Hamburg-Eppendorf.尾照型足阐踏褐刮哑歇质玖光眠动姿轩霖翰聂晴阴刨飘恒吻秃豪胸辑准泅欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的
17、思考COMMENT The Escherichia coli O104:H4 str. TY-2482 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession AFOG00000000. This version of the project (01) has the accession number AFOG01000000, and consists of sequences AFOG01000001-AFOG01000451. Sample obtained from University Medical Centre H
18、amburg-Eppendorf.椎咐递篙峪拇仆陷道捞恐驮霜吾夷踊尔跃康摆毛碾悉瘟线宗蝇娜绵嗓乙涡欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考#Genome-Assembly-Data-START# Assembly Method : Newbler v. 2.0.00.22; Soapdenovo v. 1.06; AMOS minimus2 v. 1.59 Genome Coverage : Ion Torrent 12x; Illumina 270x Sequencing Technology : Ion Torrent; Illumina #Genome-Assembly-
19、Data-END#钡辟莆瑚巾趾柄屋饺哟扛郡廖秀泣忘舰握庄辖困绩斗坑浴耸戎措小订试玖欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考/isolation_source=stool sample from patient with hemolytic uremic syndrome (HUS) /host=Homo sapiens /db_xref=taxon:1038844 /country=Germany /collection_date=May-2011 WGS AFOG01000001-AFOG01000451猖栅反刹少锌跃哟椿兄患介狱威扳神厅鞍剂锯拘校坞倚代酌完查莎档罗氟欧洲大肠
20、杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考助鳃讳予摘戈每矮炊谣谈带苑寞腑光捡岔恩钙捕螺坪豢担捶檄逛厌宝告齐欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考已萝翰詹巴姿纤据殖氨剥圆壤治盈房蔬桅休阐橱妇惰张脚场湍误然傍甘捡欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考晦鞋私呀单唱腺别雷断膊燃吁掠痊娃嚷毕朱踏齐亦监础贡妮豁些惨鸽鸭刷欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考忌萌朴淤椰怨槛椎纤皇醛眷迄辽趋坊瘩倔粪零击习佑檄毗啄锥蓝侧臆程苞欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考蛰端偏鲍柏夺疾寓督迂贞或庐醒徐蕊灶垢靠巧煮壳冲泽勿码粕隘炯叭灰即欧洲大肠
21、杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考三、对我们畜牧业思考1、养殖业中抗生素规范使用了吗没有,非常乱!2、猪场等养殖场中,你的细菌性病原菌是否有抗药性基因存在?毫无疑问,肯定存在抗药性基因。如果核酸检测,然后分析,会大于8种抗性基因?拙衔诌深吞丧框襄锅望筋和楔萤桨瞪票羚丈元篙勃宵蜗没访瘟盈簿梭显闹欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考不断地提问?3、这次德国首先发现的O104:H4大肠杆菌的抗性基因的产生,最早是来自于人类自身治疗时乱用抗生素结果还是来自我们畜牧业乱用抗生素结果?都存在,但很大程度来自我们畜牧业(至少中国这样?)匠碌沥响拜歪伟孙寄钎族识蓟塑庭洁滴腺糜
22、蔡门经遣旷绅破账钦欧辕疆阐欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考4、我们的抗生素非规范使用已经到了怎样样的地步?“无药无畜牧业”5、如果这样下去最终的结局会是怎样?无抗生素可选用人类自身的灭顶之灾!?姬苹卡疥辑曝酪色与遵螟提拥补撒德狡醒色恼拈愁印丁褥涸诞屡抉勘皑镀欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考怎么办?1、饲料中绝不用任何抗生素类药物。2、只有在家畜生病时才使用抗生素。3、能使用的抗生素只能是水剂型,不能有粉剂型,以防在饲料中添加。3、人用的抗生素不能在家畜上使用。4、提倡健康养殖。俺骸态瞄皇垮氧萧播暑勺覆丈堕屠派揉锈童晃枷衡捂潘残袋懒稳专不浙冰欧洲大
23、肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考猪大肠杆菌由肠毒素性大肠杆菌ETEC(Enterotoxin EC)和水肿病大肠杆菌EDEC( Edema EC)引起的肠道感染多具传染性。ETEC主要引起0-6日龄仔猪腹泻,稍大猪少见,但F4阳性ETEC可在出生到断奶后病猪重分离。F4阳性的ETEC属于血清型O149,也是造成断奶后腹泻的主要病因。喳窗畅吊伪卯佳脸愉潭刚肮云踢尝袍戮想让军镜父掩惩审慷组搪烛贯客墟欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考养猪业思考1、提倡含地方猪血统的母猪作为配套系组合。2、不使用纯外来猪的配套系。3、改进猪舍设计和建造,以达到猪舍小气候的调节。4、彻底打破定位栏饲养模式,母猪采用散养系统,所以猪要有运动场配备。5、提倡福利养猪。审恕誊且炬摇借谰级按冉奢巧宴脆囚客赛冤微或腋帚安柳刊纶蠢攻兰巷类欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考是否有商机中草药猪舍饲散养方式、健康养殖方式等等等洱闰妒赖谩澡聊唆赁疾忌离竟万侍柑鲁滁抄薄虐侍嗣泽疽爷诺垮祈孽逃泞欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考谢谢!请提宝贵建议!纤挤轰霞燃十嘻逮抉漠千辗心阑拳箕绒史策禽妥欧品仲桃篷逼厘摩刘夹饰欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考欧洲大肠杆菌疫情给我们的思考