质粒提取试剂盒中各溶液配方及作用

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1、质粒提取试剂盒中各溶液配方及作用溶液I(P1)组分浓度 25 mM Tris-HCl (pH8.0), 10 mM EDTA, 50 mM 葡萄糖(Glucose)溶液I组分主要作用是将菌体沉淀悬浮起来组分类型组分作用25 mM Tris-HCl (pH8.0)缓冲液保证反应体系的pH恒定10 mM EDTA金属离子螯合剂与微生物体内的金属离子相互结合,抑制 DNase的活性50 mM葡萄糖/增加溶液的粘度,保证菌体悬浮,延缓菌体 沉降的时间RNA 酶(RNase A)酶降解掉溶液中的RNA备注:溶液I在使用前通常要加入RNA酶(RNase A),由于RNA酶属于蛋白质,蛋 白质稳定性很差,所

2、以加了 RNase A的溶液I需要低温4C保存。二溶液II(P2)组分浓度250 mM NaOH, 1%(W/V) SDS (十二烷基硫酸钠)。溶液II组分主要作用是细胞裂解组分类型组分作用250 mMNaOH/氢氧化钠会破坏细胞膜的结构,使之发生bilayer (双层膜) 结构向micelle (微囊)结构的相变化,从而导致细胞的裂 解。1%(W/V)SDS (十二烷 基硫酸钠)/十二烷基硫酸钠(SDS)很容易与蛋白质结合,平均两个氨基 酸就会结合一个SDS分子,二者结合会形成SDS2多肽复合 体,这样变性蛋白质将溶解在溶液中,从而使得多肽链更好 地与基因组DNA缠绕。备注:(1)时间一定不

3、能过长;(2)不可以剧烈震动离心管。时间过长以及剧烈震动都将导致氢氧化钠破坏基因组DNA,断裂的基因组DNA碎片将会与相似大小质粒一同被抽提,污染样品。三溶液m(N3)组分浓度3M 醋酸钾(potassium acetate), 5M 醋酸。溶液III组分主要作用:(1)中和第二步加入的强碱;(2)清除掉蛋白质等细胞内的杂质。组分类型组分作用5M醋酸/中和氢氧化钠3M醋酸钾/十二烷基硫酸盐与变性蛋白质结合成复合体,十二烷基硫酸钾 的沉淀就将变性的蛋白质一起沉淀,同时变性的蛋白质与基因 组DNA缠绕,结果也大部分被共沉淀了。而咼离子浓度的溶 液又加速了这一沉淀过程。此外,溶液被中和后变性蛋白质表

4、 面电荷减少,也可以促进变性蛋白质沉淀。备注:(1)强碱溶液氢氧化钠长时间与DNA接触会破坏其结构,因此需要进行中和。四 溶液 PE (wash buffer)组分浓度 10 mM Tris-HCl (pH 7.5),80 % 乙醇(Ethanol)wash buffer主要作用:清洗掉多余的盐离子备注:试剂盒中都是利用硅胶柱进行DNA提取的。在DNA与硅胶柱吸附后,需要利 用Wash buffer清洗掉多余的盐离子。Wash buffer中含有高浓度的乙醇,由于乙醇会影响后 续的酶切或测序反应,在洗脱DNA前必须要在离心机内”空甩”柱子,完全清除掉乙醇。 五 溶液 EB(Elution buffer)组分浓度 10 mM Tris-HCl (pH 7.5)Elution buffer洗脱硅胶柱上的DNA样品备注:(1) Elution buffer中不能含有过高浓度的盐离子,因为在高盐环境中,盐阳离 子会打破硅胶负氧根和水之间的氢键,使得整体的硅胶携带正电,会吸引携带负电的DNA 分子。(2)加热过的洗脱液(50 C)可以加速DNA从硅胶膜上脱离下来(3)离心前保持EB缓冲液在膜上停留时间长一些,将更有利于DNA的洗脱。 不同公司的质粒提取试剂盒中溶液成分可能有所差异。

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