RNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和步骤

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1、RNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和步骤关键词:RNA琼脂糖电泳20120309 00 00来源:互联网点击次数38148一、实验目的 掌握植物总RNA非变性胶电泳的原理和方法。二、实验原理RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%-1.4% 的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的 条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量 时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的 1%琼脂糖凝胶即可.25S* rRNA (占80-85%) . 1SS5S植物RNA ItRNA及小分子RNA (占1

2、0-15%)I inRNA (占15%).bbiQQ.Gom寡聚脱氧胸晋(Oli妙dT层析柱三、实验材料、器具及药品蘑菇的总RNA溶液。电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫 外透射检测仪等。琼脂糖,1XTAE电泳缓冲液,0。5pg/ml溴化乙锭(EB )10X 载样缓冲液.实验步骤(1)用IxTAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加IxTAE电泳缓冲液至液面覆 盖凝胶.(2 )在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4训于封口膜上。在实验台上再加入5皿IxTAE电泳缓冲液及1皿的10X载样缓冲液,混匀后;小%心加入 点样孔。(3 )打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极

3、电泳,约30min后将凝胶放入EB 染液中染色 5min,用清水稍微漂洗。在紫外透射检测仪上观3Krft?fA% DcnistUTiin! Afiamst Gel AfTtfalRItAdMl -|uKl RALhIhvviHl VZ KhARNA的变性琼脂糖凝胶检测试剂:(1)MOPS 缓冲液(10*):0。4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS )( Ph7。0),0。1mol/L NaAc, 10mol/L EDTA.(2 )上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚蓝,0。4%二甲苯蓝。(3 )甲醛.(4)去离子甲酰胺。v电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)一水

4、冲洗-乙醇干燥一-3%H2O2灌满室温放置10分钟0。1%DEPC水冲洗。操作:1) 将制胶用具用70%乙醇冲冼一遍,晾干备用。(2)配制琼脂糖凝胶。 称取0。5g琼脂糖,置干净的100ml锥形瓶中,加入40ml蒸馏水,微波炉 内加热使琼脂糖彻底溶化均匀。 待胶凉至6070 C,依次向其中加入9ml甲醛、5ml 10X MOPS缓冲液 和0。5ul溴化乙锭,混合均匀。 灌制琼脂糖凝胶。(3)样品准备: 取DEPC处理过的500ul小离心管,依次加入如下试剂:10x MOPS缓冲 液2ul,甲醛3.5ul,甲酰胺(去离子)10ul , RNA样品4。5ul,混匀。 将离心管置于60C水浴中保10分钟,再置冰上2分钟. 向管中加入3ul上样染料,混匀。(4)上样。(5 )电泳:电泳槽内加入1XMOPS缓冲液,于7。5V/ml的电压下电泳。6)电泳结束后,在紫外灯下检查结果.

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