Trizol法提取RNA实验步骤

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1、Trizol 法使用步骤一、分离纯化的基本原理 研究基因的表达和调控时常常要从组织和细胞中分离和纯化RNA。RN质量的高低常常影响cDNA库,RT-PC和Northern Blot等分子生物学 实验的成败。Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物 质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。1.5ml Eppendorf 管二、用户需自备的试剂和材料无水乙醇、氯仿、 Glycogen (可能需要)、(RNase-free )、 Tips (RNase-free ) 三、准备工作RNase非常稳定,是导致RNA降解最主要的物质。它在一些极端的 条件可以暂时失活,但限制因素去除后

2、有迅速复性。用常规的高温高压 蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂都不能是 RNase全失活。它广泛存在于人 的皮肤上,因此,在与RNA制备有关的分子生物学实验时,必须戴手套。 RNas的又一污染源是取液器,根据取液器制造商的要求对取液器进行 处理。一般情况下采用用DEP配制的70临醇擦洗取液器的内部和外部, 基本达到要求。取RNase-free的物品时必须戴手套。1、料制品的处理尽可能使用无菌, 一次性塑料制品, 已标明 RNase-Free 的塑料制品, 如没有开封使用过通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品,原则上 都必须处理方可使用。处理步骤如下:1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入 DEP使 DE

3、P的终浓度为0.1%。注 意:DEP为剧毒物,活性很强,小心在通风柜中使用。2)处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入 DEP水溶液, 使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。3)在通风柜中室温处理过夜。4)将DEP水溶液小心倒到废液瓶中,用铝箔封住含已 DEP水处理过的 塑料制品的烧杯,高温高压蒸气灭菌至少 30分钟。5)烘箱用合适的温度烘拷至干燥。置于干净处备用。2、璃玻和金属物品250 C烘烤3小时以上四、从组织中提取总 RNA1) 液氮研磨:组织块直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg组织/ml Trizol 加入

4、Trizol ,转入离心管进行第 2步操作。2)匀浆:组织样品按50-100mg/mlTrizol 加入Trizol。另外,组织体积不能超过 Trizol 体积的10%,否则匀浆效果会不好,用电动匀浆器充 分匀浆约需 1-2分钟。五、从细胞中提取总 RNA1) 培养贴壁细胞: 不须消化, 可直接用 Trizol 进行消化、 裂解, Trizol 体积按 10cm/ml 比例加入。62) 悬浮细胞可直接收集、裂解,每1ml Trizol可裂解5X 10动物、植物 或酵母细胞,或107细菌细胞。六、操作步骤1、细胞或组织加Trizol后,室温放置5min,使其充分裂解。注:此时 可放入-70 C长

5、期保持。2、12,000rpm 离心 5mi n,弃沉淀。3、 按200ul氯仿/ml Trizol加入氯仿,振荡混匀后室温放置15min。注: 禁用漩涡振荡器,以免基因组DN断裂。4、4C 12,000g 离心 15min。5、吸取上层水相,至另一离心管中。注:千万不要吸取中间界面;若同时提取DN彌蛋白质,则保留下层酚相存于4C冰箱,若只提RNA则弃 下层酚相。6、 按0.5ml异丙醇/ml Trizol加入异丙醇混匀,室温放置5-10min。7、4C 12,000g离心10min,弃上清,RN航于管底。8按1ml 75%乙醇/ml Trizol加入75%乙醇,温和振荡离心管,悬浮沉 淀。9

6、、 4 C 8,000g离心5min,尽量弃上清。10、室温晾干或真空干燥5-10min。注:RNA样品不要过于干燥,否则 很难溶解。11、可用 50ul H2Q TEbuffer 或0.5%SD溶解 RN样品,55-60 C ,5-10min。 注:H2O TE或0.5%SD均须用DEP处理并高压。12、测0.D值定量RNA农度。注:此方法提取 RNAA6c/A280值在1.6-1.8之间;产率估计:组织标本:(ug RNA/mg组织)1-10ug,培养细胞(ug 6RNA/106 Cell ): 5-15ug。注:组织或细胞量过少,可酌情减少 Trizol 用量;组织或细胞用量过 多,会引

7、起DNA寸RNA的污染; 高蛋白、脂肪或多糖类组织,肌肉组织或块状植物组织等,组织匀浆或 液氮研磨后须4C 12,000g离心10min去掉不溶物,再进行下面操作, 若顶层有脂肪物,则也须去掉;热天提RNA带手套是必须的,手是 RNase的主要来源;组织块用液氮研磨,效果最好,若没有液氮或电动匀浆器,可用手动匀 浆器代替,此时组织块不宜过大,且需先用眼科剪刀将组织碱碱剪碎, 然后再充分研磨。6.1.2.1 肝脏、肠道、肌肉总 RNA 提取方法 使用已高温蒸汽灭菌的手术刀和镊子从鱼的腹部解剖开,从中取出完整的肝脏、 肠、肌肉等组织,置于离心管后立即放入液氮中; 组织在液氮下研磨成粉,取少量至加有

8、 ImLTrizol的1.5ml离心管中,充分混合 后于 4C, 12,000rpm离心 15min; 取上清移至新1.5ml离心管中,加入200ul氯仿,剧烈震荡直至呈乳白色,于4C,12,000rpm 离心 15min; 取上清移至新1.5ml离心管中,加入500ul异丙醇,轻轻颠倒10次,冰上放置 20mins,于 4C,12,000rpm离心 15min; 弃上清,加入1ml75%乙醇(用DEPC水现配现用),于4C,12000rpm离心5min, 重复此步骤一次; 弃上清后,室温干燥5-7mi ns; 加入适量(20-30UI)的DEPC水溶解沉淀65C溶解,-20C(最好-80C)

9、保存,检测 RNA 农度,并电泳检测。6.1.2.2 RNA 农度测定和电泳检测取 2ul 提取好的 RNA 溶液,于 Na nodrop 2000 Spectrophptpmeter测定 RNA 浓度及 A260/A280 的相寸吸光度,纯净 RNA 的 A260/A280 应在 1.8-2.2之间。电泳检测:1%琼脂糖,1X ATE缓冲液,90V电泳30min,凝胶成像系统观察,分析结果。6.1.2.3肝脏、肌肉、肠道样品cDNA的合成反应按照 TaKaRa 公司的 PrimeScript? RT reage nt Kit With gDNA Eraser ( PerfectReal Ti

10、me)反转录试剂盒说明书进行,合成 cDNA模板。基因组DNA的除去反应,在PCR管中配置如下缓冲液。试剂用量5gDNA Eraser Buffer2.0 卩1gDNA Eraser1.0 卩1Total RNAX* ulRNase Free dHOup to 10 卩1X* :根据检测到的RNA浓度来配置;混合均匀后,室温放置20-30mi n反转录反应,在PCR管中配置如下缓冲液(20ul system),反应液配制在冰上进行。为了保证反应液配制的准确性,进行各项反应时,先按反应数+1的量配制Master Mix,然后再分装到每个反应管中。试剂使用量5 PrimeScript? Buffer 2 (for Real4.0 ulTime)PrimeScript? RT En zyme Mix I1.0 卩1RT Primer Mix1.0 卩1的反应液10.0 ulRNase Free dHOup to 20 卩1混合均匀后,在PCR仪上进行逆转录反应,反应条件为:37 C15 min85 C 5 sec然后将得到的cDNA存放于-20C冰箱保存待用

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