Immunome蛋白芯片在药物研发上的应用

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1、Immunome 蛋白芯片在药物研发上的应用上期 ImmunomeTM 蛋白芯片的文章小优主要给您介绍了产品在筛选自身抗体方面的应 用。作为目前全世界唯一的全长、正确折叠以及功能均验证的蛋白质芯片,lmmunomeTM标 准蛋白芯片上的所有1631个人类全长蛋白质均为折叠以及翻译后修饰正确的,最大限度的 模拟蛋白在生物体内的构像与活性,保证了在自身抗体筛选应用中,可以精确的筛选出识别 线性与构像抗原表位的自身抗体,为筛选疾病标志物以及保护性自身抗体等疾病诊断治疗方 面提供巨大助力。除了是筛选自身抗体方面的“恢恢天网”,ImmunomeTM蛋白芯片还有哪些亮眼应用呢? 不要着急,容小优慢慢道来。

2、这次小优就给您详细的讲讲ImmunomeTM蛋白芯片在小分子药 物研究领域的具体应用。还记得ImmunomeTM标准蛋白芯片的1631种蛋白分类么?小优先带您复习一下,如图 1所示,芯片上的蛋白包括癌症抗原、转录因子、激酶以及信号通路分子等。Cancer Antigens Transcription Factors Kinases Signalling others图1. ImmunomeTM蛋白芯片蛋白质类别其中, 490种激酶蛋白分子是辅助小分子药物研发的关键。目前,很多小分子药物,尤 其是抗肿瘤小分子药物,都是以特定的激酶为靶点研发的。ImmunomeTM蛋白芯片上的490 种激酶分子,

3、都是全长、正确折叠并且具有生物学功能的,即固定在芯片上的激酶,是可以 在加入ATP的情况下,发挥磷酸化作用的。这就为激酶抑制剂类药物的有效性以及靶点特异 性检测提供了良好的平台。如图2所示,芯片首先与相应浓度的待测小分子激酶抑制剂孵育,之后加入ATP孵育后 清洗,大部分激酶在ATP存在情况下,会将ATP转变为ADP并自体磷酸化,再用带有荧光 标签的特异性识别磷酸基团的抗体进行孵育,清洗之后用微芯片扫描仪扫描分析,并将不同 浓度的抑制剂抑制效率数据汇总绘制抑制率曲线,得到结果。住用抑制剂馬蔥MP经-定童性自库璘酸比4!:;:,:和宀 I2-如入三磷毁晾昔AIP) 鹽育井淸洗图 2. Immuno

4、meTM 蛋白芯片激酶抑制剂研究的原理示意图当然,并不是全部的490种激酶在加入ATP的情况下都会发生自体磷酸化,那么,对于 芯片上不能自体磷酸化的激酶要如何检测抑制剂对其活性的影响呢?小优这就为您带来答 案,那就是使用通用的激酶探测进行竞争置换研究实验,如图3 所示。曽丿,|1:恤邱一:1厂代比供恤.甬:一普一一0-一一匹戏 I b r b S 比釧IA耳生物醸化的&胡d o-ATP似物 41海汕它屈y母庇校CDK2-L .;;仔代底弱图 3. 竞争性置换实验示意图通过这些方式,ImmunomeTM蛋白质芯片可以很好的检测小分子抑制剂对激酶活性的抑 制率。闲话不多说,我们来看一看科研工作者利

5、用ImmunomeTM蛋白质芯片对激酶抑制剂的 研究吧,用数据说话。易瑞沙(Iressa)是一种临床上的肺癌治疗药物,主要成分为激酶EGFR 的抑制剂,但是,对欧美国家的患者却有较大的副作用。在ImmunomeTM蛋白芯片中检测, 发现其除了对其靶蛋白EGFR有较好的抑制作用外,还有较明显的脱靶效应,如图4所示, 尤其是对激酶 RIPK2 也有较强的抑制作用,而 RIPK2 则被认为在保护肺细胞存活方面发挥较 大的作用。相信如果在药物研发阶段,就能发现这些脱靶效应,并针对这些脱靶效应对药物 分子进行优化,就可以尽可能的减少药物临床上的副作用,更好的治疗疾病。h3coEuIIIrt,1w w-易

6、瑞沙(lra)应是一种EGFRI制剂使用immunome显示它也抑制很务其他的激蒔很多脱靶(off-target)的情况易瑞:激势抑制测试2阳蝴怕酹卫RIPK2IFtESilACM =4JnM图 4. ImmunomeTM 蛋白芯片检测肺癌药物易瑞沙的特异性同时,科研工作者也用ImmunomeTM蛋白芯片检测了其他几种激酶抑制剂类的抗肿瘤药DMSO星画菌素易瑞沙特罗凯格列卫GcflrEfih (IftStt)GleovecErlotinibStaurosparineKirase$ inhibiteda310110图5. ImmunomeTM蛋白芯片检测不同激酶抑制剂类药物的特异性这些数据很好的表明了 ImmunomeTM 蛋白芯片在小分子药物研发领域中的药物毒理学 预测方面可以为研发人员提供巨大的帮助与支持。当然,ImmunomeTM蛋白质芯片不止能做 激酶抑制剂作用效果的检测,芯片上面还包括甲基转移酶、组蛋白去乙酰化酶等一系列具有 生物活性的酶及其他蛋白质,方便药物研发工作中药物毒理学以及特异性的预测,称之为药 物研发的助推器一点也不为过。

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