马铃薯疮痂病的分离和检测体系构建

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1、马铃薯疮痂病的分离和检测体系构建马铃薯是继水稻、小麦和玉米之后的世界第四大粮食作物,也是我国农民增 收的重要途径和粮食安全的重要保障。马铃薯疮痂病是链霉菌引起的一种表皮性 病害,多发生在北方,近年来,疮痂病在我国一些南方马铃薯产区也频繁发生,严 重影响块茎的外观品质。本研究收集了广东和湖北两省的疮痂病块茎,进行了疮痂病的分离鉴定,在 此基础上建立了疮痂病的相关检测体系,为疮痂病的防控奠定了基础,主要结果 如下:1.收集了广东、湖北两省五个地区的疮痂病块茎102个,观察分析了它们的 症状类型,及在培养基上链霉菌的培养特征,孢子链形态,并从湖北襄阳的疮痂症 状块茎中分离得到XY-12菌株;2.通过

2、表型和显微观察、16S rDNA测序,初步鉴 定襄阳疮痂病分离菌株XY-12为Streptomyces bottropensis,进一步的盆栽接 种鉴定表明,该分离菌株在接种浓度1.68X 103 CFU/mL以上能够导 致马铃薯中薯5号产生疮痂病症状;3.在收集Streptomyces scabies、 S.acidiscabies、S.bottropensis、S.stelliscabiei、S.europeascabiei 五种 致病菌的66条txtA基因序列的基础上,设计了 txtA的特异PCR引物 CS-67s/379a,并对退火温度以及模板、引物浓度进行了优化;通过对田间样品的 检测,表明该方法能特异检测疮痂病,能够灵敏的检测到10-6 ng疮 痂病菌的DNA;4.进一步基于txtA基因设计了 5对RPA引物,经检测效果良好,选 取其中的一对引物CS-RPA126s/395a分别进行PCR和RPA分析,RPA能够检测 10-4ng疮痂病DNA,低于PCR的灵敏度10倍,但RPA技术可以不依赖 复杂的仪器就实现等温扩增,且与PCR引物CS-67s/379a的检测结果有高度的一 致性。

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