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1、三、全基因组序列分析-基因组学的新内容1. 数据存放。2. 碱基百分含量分析。无论是GC富含区还是AT富含区，都可 能是一些特殊功能的区域。肺炎支原体GC百分含量高和GC百分含量低的区域对应于重组值 较低的区域，包括着丝粒和端粒，而尿殖道支原体GC百分含量最 低的区域对应于rRNA和tRNA。流感嗜血杆菌GC百分含量高的 区域也对应于6个rRNA基因。3.ORF分析。首先要用多个不同的软件来要找到并估测基因组中 的每一个ORF。通过比较确知其功能的；在数据库中有相匹配的蛋白质序列，但不知其能的；在数据库中找不到任何相匹配蛋白质序列的新基因。1995 年，J.C. Venter 所领导的 TIG
2、R (The Institute of GenomicReseach)完成了第一个单细胞自由生物基因组，流感嗜血杆菌 (Haemopophilus influenzae Rd)全序列测定。1996年他们又完成了拥有最小基因组的单细胞生物尿殖道支原体 (Mycoplasma genitalium)和一种不同于原核、真核生物的单细胞 生物-产甲烷古细菌(Methanococcus jannaschi)的全序列测定。德国人则测定了肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae)基因组全序列。与此同时，历时七年(1989-1996年)的第一个真核生物酿酒酵母(Saccharomyces cev
3、evisiae)基因组计划在欧共体及美、日、加、英等各国实验室共同努力下得以完成。1997年大肠杆菌(Escherichia. Coli S)的基因组计划完成，美丽隐 杆线虫(caenothabditis elegans)的基因组计划也于1998年完成。 最受瞩目的人类基因组计划(HGP, Human GenomeProject)也将 于2000年底前完成。(1) 通过流感嗜血杆菌能量代谢类群的ORF分析，了解到在这种生物中缺乏三羧 酸循环(TCA)中必需的三个酶，即柠檬酸合成酶基因、异柠檬酸脱氢酶基因和顺 乌头酸酶基因。由此推断流感嗜血杆菌TCA缺失，不能合成谷氨酸，因为谷氨 酸的供体是TCA的中间产生物a-酮戊二酸。(2) 在尿殖道支原体基因组中有一个称为MgPa的ORF。考察全基因组，共发现 有9个与MgPa同源的重复序列，这些重复序列之间发生重组可能诱导尿殖道 支原体群体中抗原性改变，帮助细菌逃避宿主免疫攻击。
