abi 3500操作手册 基因测序【最新】

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1、ABI 3500操作手册3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_E5”作为我公司Dye Set名称,从Chemistry下拉菜单中选择“Matrix Standard”,从Dye Set Template下拉菜单中选择“E5 Template”,设置完成后点击Save保存设置。1.2 空间定位 进入3500 Data Collection Software主界面,选择Maintenance菜单,在Maintenance界面中点击Calib

2、rate下拉菜单中的Spatial按钮,选择合适的空间定位参数即可开始空间定位。3500系列遗传分析仪空间定位与3100、3130系列类似。1.2 光谱校正 a、光谱校正前先更换水和阴阳极Buffer,按10ul甲酰胺:0.5ul 5 Dye Matrix Standard的比例配制甲酰胺和光谱校正标准品混合物,轻轻震荡混匀后短暂离心。准备一块新的96孔反应板,将配制好的混合物均匀的分装在前三列各孔中。3500/3500xL进行光谱校正时仪器默认第一个Run,即前三列中加入了光谱校正混合物。95加热3 min ,立即冰浴 3 min,变性完成后装载96孔板并置于仪器托盘中。b、点击Calibr

3、ate下拉菜单中的Spectral按钮,按照图示选择各种参数点击Start Run即可进行光谱校正。注意在Dye Set中应选则在1.1中设置好的与AGCU试剂盒相匹配的Dye Ste。如果光谱校正未达到仪器默认质量要求,仪器会自动重复跑样三次,并自动选择各次跑样中质量最好的通道作为此次光谱校正的最后结果。光谱校正时应观察实时原始数据,以便及时做出相应调整,确保最终结果。C、3500系列遗传分析仪与3100、3130系列遗传分析仪最大的区别之一就是光谱校正。它不需要编写protocol、run module等软件栏目及其相应参数设置,直接按照仪器默认的参数进行即可,因此操作更为简单、快捷。2.

4、 软件参数设置2.1 创建Instrument Protocol 进入library界面,选择Instrument Protocols菜单,点击Create。按下图所示选择或设置各个参数,设置完成后点击Save保存。注意将Protocol Name命名为“AGCU_E5_STR”,进样电压设置为3kv,进样时间可设置为610 sec,Dye Set选择1.1步骤中已设置好的“AGCU_E5”,其他参数设置请参照下图。2.2 创建Size Standard 进入library界面,选择Size Standards菜单,点击Create。在Size Standard中输入“AGCU_SIZ500”

5、,Dye Color下拉菜单中选择“Orange”,在左侧对话框中依次输入75、100、139、150、160、200、300、340、350、400、450、490、500,每次输入结束后点击中间“Add Size”菜单即可将所输数字加入右侧对话框中。待全部输入结束后点击Save保存。2.3 创建QC Protocol 进入library界面,选择QC Protocols菜单,点击Create。在Protocol Name中输入“AGCU_QC”,Size Standard下拉菜单中选择在2.2中已创建的“AGCU_SIZ500”,将Use Baselining改为38。其他参数均按下图所示

6、进行设置,设置完成后点击Save保存。2.4 创建Assay 进入library界面,选择Assays菜单,点击Create。在Assay Name中输入“AGCU_STR”,Application Type下拉菜单中选择“HID”,Instrument Protocol下拉菜单中选择2.1中创建的“AGCU_E5_STR”,QC Protocol下拉菜单中选择2.3中创建的“AGCU_QC”。待所有选项选择完成后点击Save保存。若第一步是从创建Assay开始,也可在该界面下点击“Create New”菜单,按照上文所述要求逐一创建新的Instrument Protocol、QC Proto

7、col并将其保存至Library中,其效果与前面创建现在调用一样。2.5 创建File Name Convention 进入library界面,选择File Name Conventions菜单,点击Create。在Name中输入“AGCU_Samplename”,其他参数按下图进行设置,也可根据个人喜好进行更改。注意在Select File Location中选择Custom File Location,可以先在硬盘新建文件夹,此处点击Browse进行选择。待所有设置完成后点击Save保存。2.6 创建Result Group 进入library界面,选择Result Groups菜单,点击

8、Create。在Name中输入“AGCU_Resultgroup” ,其他参数按下图进行设置,也可根据个人喜好进行更改。注意在Select File Location应与2.5中选择Custom File Location位置相同。待所有设置完成后点击Save保存。2.7 创建Plate Template a、进入library界面,选择Assign Plate Contents菜单,在New Plate下拉菜单中选择Create Plate from Template,在该界面中选择软件自带的ABI样品表模板“5dye_36_POP4”双击打开。b、将ABI样品表模板“5dye_36_POP

9、4”中Assays、File Name Conventions和Results Groups栏目下的各可选项逐一删去。c、在Assays、File Name Conventions和Results Groups各栏目下点击Add from library,分别向各栏目中加入AGCU_STR、AGCU_Samplename和AGCU_Resultgroup。d、各栏目选项加入完成后点击Save Plate菜单,选择Save as后输入“AGCU_Platetemplate”,点击ok保存即可。3产物检测3.1 打开软件进入主界面,见下图3.2 点击主界面左上方导航键(蓝色箭头),打开Define

10、 Plate Properties界面,在New Plate按钮中选择Create Plate from Template, 或者直接点击快捷键Create Plate from Template。3.3 从已有的样品表模板中选择“AGCU_Platetemplate”打开。输入本次检测样品表名称,如“20110328_AGCUTEST”,输入完成后点击Assign Plate Contents进入下一界面。3.4 在Assign Plate Contents界面点击Import在板号列表中选中相应的板号可导入列表,如果不需导入加样板可直接在Plate View中编写待检测的样品名。3.5选中

11、相应的待检测区域后(点击加样板左上角白色空格即可选中整版),在下方的Barcode框中单击即可分别选中Assays,File Name Conventions及Result Groups。全部选择完毕后点击“Link Plate for Run”进入下一界面后点击“Start Run”即可开始电泳。4数据分析数据分析待续。 x/x附加工作总结一篇,不需要的朋友下载后可以编辑删除,谢谢安全生产监管执法工作方案5篇第一篇一、指导思想2014年,全区安全生产监管执法工作要以科学发展观为指导,全面贯彻落实国务院关于进一步加强企业安全生产工作的通知和省政府关于进一步加强企业安全生产工作的意见文件精神,进

12、一步规范安全生产监管执法行为,落实行政执法责任制,提高依法行政水平,严厉打击安全生产领域的非法违法行为,及时消除事故隐患,促进全区安全生产形势进一步稳定好转。二、工作目标通过安全生产监管执法计划的实施,生产经营单位安全生产主体责任进一步落实,全区安全生产杜绝重特大事故,遏制较大生产安全事故,减少一般生产安全事故,各类生产安全事故指标控制在市政府下达的考核指标内。全区安全生产高危领域和重点监管单位的监管面达到100。三、主要任务(一)执法检查工作日安排我局现有在册行政执法人员14人。按照国家安全监管总局关于印发安全生产监管年度执法工作计划编制办法的通知要求,2014年我局总法定工作日为3500个

13、工作日,其中:综合执法工作日为2000个工作日;专项执法检查工作日为800个工作日;非执法工作日为700个工作日。在综合执法工作日中,实施行政许可为550个执法工作日;开展生产安全事故调查和处理为850个执法工作日;开展安全生产举报查处为200个执法工作日;重大安全生产隐患排查报告的受理、登记建档、跟踪监控、督促整改等为200个执法工作日;开展机动执法为200个执法工作日等。(二)监管执法计划任务分解按照分级负责、属地监管的原则,对危险化学品、冶金、烟花爆竹等行业生产经营单位的生产现场安全监督检查,根据生产经营单位上年度安全等级确定现场检查的频次;对其他生产经营单位的生产现场安全监督检查,原则

14、上组织1次安全执法检查。根据专项检查工作日确定全年开展执法检查的生产经营单位数量是160家。其中:安全监督管理科28家;危险化学品安全监督管理科46家;职业安全健康监督管理科27家;监察大队59家。开展执法检查的生产经营单位名单见附件。四、工作要求(一)加强领导,明确执法检查内容。局成立行政执法工作领导小组,局长全面负责。各业务科室(大队)负责人负责具体执法工作,要明确本科室(大队)执法检查的主办和协办人员。全局执法人员要认真学习国家安全管监总局暂行规定的具体要求,对生产经营单位是否符合安全生产条件和暂行规定第八条提出的19项内容认真实施检查,落实具体工作措施,并制定现场检查工作方案,确保年度

15、监管执法工作计划的顺利实施。(二)精心组织,认真执行计划任务。各业务科室(大队)要严格按照月度计划细化分解执法任务,根据月度计划制定每周计划。检查人员在实施生产经营单位生产现场安全监督检查前,应当明确检查的项目、内容、方法和标准,准备必要的检查测试工具、仪器及法律文书等执法检查准备工作,必要时,会同有关部门联合组织生产经营单位生产现场安全监督检查。涉及专业性内容的,也可以邀请相关专家参与生产经营单位生产现场安全监督检查,并听取专家的意见和建议。检查中,应当作出书面现场检查记录,由检查人员和被检查单位负责人分别签字,存档备查,并及时把执法检查记录录入全市安全生产监督管理暨重大危险源预警信息系统。要统筹兼顾,上下沟通,要优先安排每月到期必须进行复查的生产经营单位。确需对计划作重大调整的,应当按照有关规定审批和备案。(三)严格执法,健全执法检查考核制度。要依法严肃查处安全生产领域的非法违法行为,督促生产经营单位全面落实安全生产主体责任。在执法检查中发现事故隐患应当及时督促生产经营单位整改,发现违章行为及时纠正,涉及其他部门职权范围的案件,应主动联系有关部门并及时移交。建立执法检查季度督查制度和半年执法

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