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1、中国测序论坛 miRNAmiRNAmiRNAmiRNA 测序概述及实验分析流程测序概述及实验分析流程测序概述及实验分析流程测序概述及实验分析流程 一、一、 microRNAmicroRNAmicroRNAmicroRNA 测序概述测序概述 MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码 RNA,其大小长约 2025 个核苷酸。成 熟的 miRNAs 是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,随后组装进 RNA 诱导的沉默复合体,通过碱基 互补配对的方式识别靶 mRNA,并根据互补程度的不同指导沉默复合体降解靶 mRNA 或者阻遏靶 mRN
2、A 的翻译。最近的研究 表 miRNA 参与各种各样的调节途径,包括发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细胞增殖和凋亡、脂肪代谢等等。 microRNA(miRNA)是一种大小约 2123 个碱基的单链小分子 RNA, 是由具有发夹结构的约 7090 个碱基大小的单链 RNA 前体经过 Dicer 酶加工后生成,不同于 siRNA(双链)但是和 siRNA 密切相关。microRNA 通过和靶基因 mRNA 碱基配对引 导沉默复合体(RISC)降解 mRNA 或抑制 mRNA 的翻译,从而在转录后水平调控蛋白表达(最新发现 microRNA 也能在转 录水平调控基因表达)。microRNA 在
3、物种进化中相当保守,在动物、植物和真菌等中发现的 microRNA 表达均有严格的组织 特异性和时序性。microRNA 在细胞生长和发育过程中起多种作用,包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。 目前研究 microRNA 的方法主要是 realtime-PCR、生物芯片技术以及第二代测序技术。基于第二代测序技术的 microRNA 测 序, 可以一次获得数百万条 microRNA 序列, 能够快速鉴定出不同组织、 不同发育阶段、 不同疾病状态下已知和未知的 micoRNA 及其表达差异,为研究 microRNA 对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。 中国测序论坛 二、二、 micro
4、RNAmicroRNA 测序技术特点测序技术特点 1.高灵敏度:理论上可以检测单个细胞中一个拷贝的 microRNA; 2.高精度:可以检测 microRNA 单个碱基的差异; 3.不受先验信息的干扰,既能鉴定已知 microRNA,又有能力发现新的 microRNA; 4.保留定向信息,用于链特异的表达分析; 5.利用 Barcode 在单次运行中经济地分析多个样品。 三、三、 miRNAmiRNA 测序实验技术路线测序实验技术路线 中国测序论坛 四、四、 microRNAmicroRNA 测序数据分析技术路线测序数据分析技术路线 中国测序论坛 五、五、 microRNAmicroRNA 测序数据可研究的方面测序数据可研究的方面 1.差异表达的 microRNA 基因, 2.可做分型的 microRNA 基因,用于诊断疾病 3.新的 microRNA 发现 4.(欢迎补充。) 来源于:http:/