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1、怎样高效便捷地使用PUBMED,上海市浦东新区人民医院 陈蕊华,导言,目的：介绍PUBMED最重要的一些功能且了解和掌握优化文献检索的方法。 PUBMED：一个以medline数据库为主要资料来源的免费搜索引擎。 将近70%的文献可免费获得摘要 每篇文献都有一个通向全文的链接，可能免费，可能收费 通过熟悉和掌握MESH数据库和NCBI账户功能，可以更加准确、方便和快捷地使用PUBMED进行文献检索。,PUBMED简介：普通检索,普通检索的方法是在搜索栏上输入需要查询的关键词，点击search。 输入diabetes搜索，可检索到200,000条文献，安装发表日期的先后顺序，以summary格式
2、（标题+作者+来源+PMID）被罗列出来，默认每页20条文献。,PUBMED简介：筛选（1）,在执行普通检索操作后，浏览器左边会出现筛选菜单，通过筛选功能，可以限定检索范围，优化文献的查询。 筛选条件包括 Tet availablity：对文献的文本类型进行筛选，包括摘要、全文和免费全文。 Publication dates：按文献的发表日期进行检索，最早的发表日期可追溯至1950年。,PUBMED简介：筛选（2）,Article types：对文献的种类进行分类筛选，包括meta分析，系统综述，指南和病例报告等，其中系统综述可以讲检索范围限定在对所研究主题的系统评价上。 Languages：
3、按照文献的发表语言进行筛选，pubmed共搜集了约4800种期刊，其中仅70多种期刊为非英语撰写刊物。,PUBMED简介：筛选（3）,Subjects：对文献研究主题进行筛选，包括AIDS， Bioethics，Cancer和Toicology等，获取与各主题相对应的参考文献。 Journal categories：按期刊类型进行检索，如选择core clinical journals，会把检索范围限定在121种最重要的医学期刊中。 Search fields：对关键词出现的范围进行限定，如选择title或title/abstract，那只有在题目和摘要中包含有关键词的文献会被检索出来。,PU
4、BMED简介：筛选（4）,也可以通过点击筛选菜单最上面的choose additional filters 选项来添加一些附加的筛选条件，包括species， se，ages等。 选择筛选条件+search 每当选择了一个筛选条件，浏览器页面就会自动被刷新，列出满足筛选条件的文献结果，筛选条件将会出现在pubmed页面的上端。,主题词检索,使用主题词数据库进行主题词检索，可获得比普通检索更精确的结果。 在pubmed主页点击搜索栏左边的数据库栏，在下拉菜单中选择MeSH，或在主页右下角直接点击MeSH都可直接进入主题词检索。,主题词检索,在弹出的界面中会出现以上内容和选项 Definition
5、：对主题词的简单介绍和定义。 Subheading：选择与主题词相关的副主题词。 Restrict to MeSH MajorTopicheadingonly：仅检索主题词为主要主题词的文献 Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierachy：不扩展检索，即单一层面检索，不使用主题词树状结构表。 Entry Terms：指与该主题词意思相近的同义词。,主题词检索,MeSH hierarchy:主题词树状结构表，可以显示出该主题词的学科从属关系。 会根据主题词相关学科和词源学的发展而定期自动更新。,主题词检索,
6、检索：主题词+副主题词 1.在上一步主题词diabetes mellitus的搜索结果中选择副主题词，例如，选择therapy 2.点击页面右上角add to search builder选项，将副主题词加入到pubmed search builder框中 3.点击 add to search builder选项下面的search pubmed选项进行检索。 4.这时，pubmed将会按主题词和副主题词进行条件检索，检索条件会显示在pubmed主页的检索栏中。,联合检索,我们可以同时对多个主题词和副主题词进行检索。 例如：同时检索两个主题词：diabetes 和insulin 1.首先在检索栏
7、中输入diabetes 勾选其为主题词，点击右上角的add to search builder 2.接着，在检索栏中输入insulin 同样点击右上角的add to search builder 于是会看到有几百条同时符合这两个主题词的文献被检索出来。,检索记录,点击pubmed主页检索栏下面的Advanced选项，在弹出页面的history文本框中看到之前检索的历史记录，包括检索编号（search）、检索名称（Query）和检索结果输了（Items found）等 点击检索结果数量，可以退回到检索结果页面。 检索历史记录将被自动保存8小时，当注册了NCBI账户后，我们也可以选择Save in
8、 My NCBI把历史记录保存在账户中。,检索记录,每个检索记录都会在Search栏中被予一个编号，点击该编号，在弹出的菜单中有如下选项：作为检索条件添加到高级检索中（AND, OR, NOT inbuilder），删除记录（Delete from history），显示检索结果（Show search results ），显示检索细节（Show search details），和将检索记录保存到NCBI账户内（Save in My NCBI）,高级检索,检索历史记录的所在页面上方就是pubmed的高级检索功能，具有以下特点： 点击All Fields选项，在下拉菜单中可以针对文献的不同特征进
9、行关键词检索，如在题目或摘要（Title/Abstract）中查找。 选择AND,OR,NOT等关连符，可以同时进行多条件检索。 通过点击Show inde list 选项可以获得与关键词相关的特征信息。,高级检索,Eample 1：查找以Lennon J为第一作者的文献 在All Fields栏中选择 First Author 在检索栏中输入Lennon，点击右边的Show inde list选项 在下拉菜单中，Pubmed会列出所有包含Lennon为第一作者的可能情况，选择Lennon J+search,高级检索,Eample 2：查找以Lennon 为作者，并且在标题或摘要中要包含有关键
10、词diabetes的文献 在all fields栏中选择author 在检索栏中输入lennon，点击show inde list 选择lennon，在第二行的关联词中选择AND，然后点击Add to search bo 在第二行的all fields栏中选择title/abstract，在检索栏中输入diabetes 点击search，进行检索,高级检索,注意：如果我们在all fields栏中选择主题词MeSH Terms，然后在检索栏中输入Diabetes，那么选择show inde list，在下拉菜单中就会出现于主题词相关的文献分类,NCBI账户及功能,储存检索结果,在pubmed主
11、页的检索栏中输入lantus，点击search。在检索出结果后，点击检索栏下面的Save Search选项，在弹出窗口中选择Save，保存成功。 点击pubmed主页右上角的My NCBI进入账户，在界面右面第一个名Saved Searches的文本框中可以看到刚才储存的检索结果，点击该结果的齿轮图标，可以设置是否通过e-mail接受该主题检索结果的更新，以及设置接收的格式和数量。点击右下角的Manage Saved Searches选项，进入储存管理界面，可以对储存结果进行删除操作或查看检索结果是否有更新。,管理筛选条件,在My NCBI界面的右下角是筛选文本框，其中Filters for选
12、项可以选择需要进行筛选管理的数据库，点击manage filters进入筛选管理界面。 在这个界面上，左边的Your Pubmed filter list对话框可添加删减筛选条件。 右边的Browse/Search for PubMed Filters对话框中，可以看到4个筛选类别（Popular，LinkOut，Properties和Links）,管理筛选条件,创建自定义筛选：通过筛选管理界面上的Creat custom filters选项，可以创建一个自定义筛选，如某份期刊，某个作者或研究主题等。 具体操作方法是：点击这个界面上的Creat custom filters选项，在弹出的对话框
13、中设置筛选名称和条件。,管理筛选条件,Eample：将关于心脏病学排名前三的三种杂志期刊设置成自定义筛选条件。 点击creat custom filters，在对话框的save filter as中输入该筛选条件的名称（Top 3 cardiology）。 将三本期刊 NEJM, Lancet和Circulation输入到Query terms文本框中，或者也可以在pubmed主页点击高级检索，将三种杂志作为检索条件，将Pubmed Advanced Search Builder中生成的语句复制/黏贴到Query terms 最后点击 Save filter。,创建收藏夹,NCBI账户可以创建
14、收藏夹以存储文献检索结果。首先在Pubmed主页检索Diabetes，点击检索栏下面的Send to选项，在下拉菜单中选择Collections收藏夹选项，然后点击最下面的Add to Collection选项 Pubmed会弹出一个新窗口，询问是否需要创建一个新的收藏夹或将检索结果放置于一个已存在的收藏夹。,创建收藏夹,选择一个收藏夹，点击Save，接着点击Pubmed主页右上角的My NCBI选项进入到NCBI账户内，我们可以看到在右边的一个名为collections的文本框内收入了刚才添加的检索结果 点击该结果选项，可以查看到所保存的检索结果。点击右下角的manage collections，可以对收藏夹进行操作，包括删除与合并收藏夹，最好点击界面中的settings/Shearing选项，设置是否共享该收藏夹。,小结,为了更加精确、方便和快捷地使用Pubmed检索，我们可以： 使用MeSH检索 使用Advanced检索 使用联合检索 使用筛选功能限定检索范围 使用Advanced检索中的Search Builder和Show Inde功能，对作者，期刊和主题词等进行筛选和限定,小结,创建一个NCBI账号，我们可以： 存储检索结果 管理筛选条件 创建收藏夹,谢谢,
