农学]2011年生物化学期末复习 - 名词解释

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1、1 蛋白质 (protein) 是以氨基酸为组成单位的经肽键连接而成的结构复杂的生物高分子,。,肽键: 由一个氨基酸的-氨基与另一个氨基酸的-羧基缩合失去1分子水所形成的,所生成的化学键叫做肽键(peptide bond)。,肽平面(peptide plane): 由于肽键不能自由旋转,形成肽键的4个原子和与之相连的两个-碳原子共处在一个平面上,形成酰胺平面也称为肽平面或肽键平面。,4蛋白质的一级结构(primary structure)。 多肽链中氨基酸的排列顺序,包括二硫键的位置称为蛋白质的一级结构(primary structure)。,5 构型(configuration):是指在立体

2、异构体中取代原子或基团在空间的排列关系。构型的改变要有共价键的断裂和重新组成,从而导致光学活性的变化。 6 构象(conformation):是指在分子中由于共价单键旋转所表现出的原子或基团的不同空间排布。构象的改变不涉及共价键的断裂和重新组成,也没有光学活性的变化。,7 结构域 多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域(structural domain)或域(domain)。,8 生物化学的定义 生物化学( Biochemistry 或Biological chemistry )可以认为是生命的化学,是研究微生物、植物、动物及人体

3、等的化学组成和生命过程中的化学变化的一门科学。 具体来说,是一门运用化学、物理学的原理和方法来研究生命体化学组成、物质结构、性质、功能及其变化规律的科学。,当氨基酸溶液在某一pH值时,使某特定氨基酸分子上所带正负电荷相等,成为两性离子,在电场中既不向阳极也不向阴极移动,此时溶液的pH值即为该氨基酸的等电点(isoelectric point)。,9 氨基酸的两性解离性质及等电点(pI),亚基(subunit): 是组成蛋白质四级结构最小的共价单位。四级结构的蛋白质中具有三级结构的球蛋白 称为亚基。它可以由一条多肽链组成,也可以由几条肽链通过二硫键连接在一起组成,亚基之间靠次级键连接。,11 蛋

4、白质的变性与复性, 当天然蛋白质受到某些物理因素和化学因素的影响,使其分子内部原有的高级构象发生变化时,蛋白质的理化性质和生物学功能都随之改变或丧失,但并未导致其一级结构的变化,这种现象称为蛋白质的变性(denaturation)。,12 酶的概念,定义:酶是生物体内进行新陈代谢不可缺少的受多种因素调节控制的具有催化能力的生物催化剂。,辅酶(coenzyme): 与脱辅酶结合比较松弛的小分子有机物质,通过透析方法可以除去。 14 辅基(prosthetic group):以共价键和脱辅酶结合,不能通过透析除去,需要经过一定的化学处理才能与蛋白分开的金属离子或有机分子。,15.锁钥(lock a

5、nd key)学说: 将酶的活性中心比喻作锁孔,底物分子象钥匙,底物能专一性地插入到酶的活性中心。 该学说的局限性是不能解释酶的逆反应。 16 诱导契合假说(induced-fit hypothesis): 酶的活性中心在结构上具柔性,底物接近活性中心时,可诱导酶蛋白构象发生变化,这样就使使酶活性中心有关基团正确排列和定向,使之与底物成互补形状, 有机的结合而催化反应进行。,17 .酶活力的概念 酶活力(enzyme activity):是指酶催化某一化学反应的能力, 酶活力的大小可以用在一定条件下所催化的某一化学反应的反应速率来表示,两者呈线性关系。,18 酶的比活力(specific ac

6、tivity) 酶的比活力代表酶的纯度,EC规定比活力用每mg蛋白质含的酶活力单位数表示,对同一种酶来说,比活力愈大,表示酶的纯度愈高。 比活力=活力U/mg蛋白=总活力U/总蛋白mg,核酸酶(催化核酸) Ribozyme 核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的RNA,能够催化RNA分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应。,19 核酸酶(ribozyme),20 酶活性中心的概念 酶分子中直接与底物结合,并和酶 催化作用 直接有关的区域叫酶的活性中心(active center)或活性部位(active site), 参与构成酶的活性中心和维持酶的特定构象所必需的基团为酶分子的必需基团。,21 酶原

7、,酶原(zymogen):有些酶在细胞内合成或初分泌时的无活性前体。,22米氏常数Km,由米氏方程可知,当反应速度等于最大反应速度一半时,即V = 1/2 Vmax, Km = S 上式表示,米氏常数是反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。 因此,米氏常数的单位为mol/L。,有些酶分子表面除了具有活性中心外,还存在被称为调节位点(或变构位点)的调节物特异结合位点,调节物结合到调节位点上引起酶的构象发生变化,导致酶的活性提高或下降,这种现象称为别构效应(allosteric effect),具有上述特点的酶称别构酶(allosteric enzyme)。,23 酶的别构(变构)效应,24 同

8、工酶,催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构、理化性质、免疫学性质不同的一组酶。,25 诱导酶,诱导酶(induced enzyme) 是指当细胞中加入特定诱导物后诱导产生的酶,它的含量在诱导物存在下显著增高,这种诱导物往往是该酶底物的类似物或底物本身。,26 增色效应(hyperchromic effect) 核酸变性时, (P)值升高,此现象称为增色效应。 27 减色效应(hyperchromic effect) 变性的核酸复性时, (P)值又降低,这一现象称为减色效应。 摩尔磷吸光系数(P)的计算 (P)=A/cL A为吸光值,c为每升溶液中磷的摩尔数,L为比色杯内径,28 变性(den

9、aturation) 稳定核酸双螺旋次级键断裂,空间结构破坏,变成单链结构的过程。 核酸的的一级结构(碱基顺序)保持不变。,29 Tm:熔解温度(melting temperature) DNA的熔解温度: 通常把加热变性使DNA的双螺旋结构失去 一半时的温度称为DNA的熔点或熔解温度,,31 核酸的分子杂交(hybridization),不同来源的DNA单链间 或单链DNA与RNA之间只要有碱基配对的区域,在复性时可形成局部双螺旋区,称核酸分子杂交(hybridization)。DNA与互补的RNA之间也可以发生杂交。,32 氧化磷酸化作用,。氧化磷酸化作用指与生物氧化作用相伴而生的磷酸化作

10、用,是将生物氧化过程中释放的自由能,用以使ADP和无机磷酸生成高能ATP的作用。,33 糖酵解,糖酵解(glycolysis)是酶将葡萄糖降解成 丙酮酸并伴随着生成ATP的过程。它是动物、植物、微生物细胞中葡萄糖分解 产生能量的共同代谢途径。 酵解是氧化磷酸化和三羧酸循环的前奏。,34 三羧酸循环 三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle)(TCA,柠檬酸循环或Krebs循环) 是指在线粒体中,乙酰CoA首先与草酰乙酸缩合生成柠檬酸,然后经过一系列的代谢反应,乙酰基被氧化分解,而草酰乙酸再生的循环反应过程,由于柠檬酸有三个羧基,因此称为三羧酸循环。,一、糖的异生,由非糖物质

11、转变为葡萄糖或糖原的过程称为糖异生(gluconeogenesis)。,糖异生代谢途径主要存在于肝及肾中。,35 糖异生,36 -氧化 脂肪酸氧化每次降解下一个2碳单元 的片段,氧化是从 羧基端 的 -位碳原子 开始的,此种氧化方式称为脂肪酸的-氧化。,37 联合脱氨基作用,转氨基作用和氧化脱氨基作用联合进行的脱氨基作用方式被称为联合脱氨基作用。,38 生物氧化 糖类、脂肪、蛋白质等有机物质在细胞中进行氧化分解生成CO2和H2O并释放出能量的过程称为生物氧化(biological oxidation), 实质是需氧细胞在呼吸代谢过程中所进行的一系列氧化还原反应过程。,39 复制(replica

12、tion):指以原来DNA分子为模板合成出相同分子的过程。 40 转录(transcription):是在DNA分子上合成出与其核苷酸顺序相对应的RNA的过程。 41 翻译(translation):是在RNA的控制下,根据核酸链上每三个核苷酸决定一个氨基酸的三联体密码规则,合成出具有特定氨基酸顺序的蛋白质肽链过程。,DNA在复制时,以亲代DNA的每一条链作模板,合成完全相同的两个 双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一条亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制(semi-conservative replication)。,42半保留复制,43 半不连续复制 以35方向的亲代DNA链作

13、模板的子代链在复制时基本上是连续进行的,其子代链的聚合方向为53,这一条链被称为领头链(leading strand)。 以53方向的亲代DNA链为模板的子代链在复制时则是不连续的,其链的聚合方向也是53,这条链被称为随从链(lagging strand)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。,44 冈崎片段 由于亲代DNA双链在复制时是逐步解开的,因此,随从链的合成也是一段一段的。DNA在复制时,由随从链所形成的一些子代DNA短链称为冈崎片段(Okazaki fragment)。,45 顺式作用元件 DNA分子中参与转录调控的序列统称为顺式作用元件(cis-acting element)。,46 RNA的逆转录,以病毒RNA 为模版,dNTP为原料,有逆转录酶催化,按碱基配对规律,合成DNA 的过程。,47 遗传密码: DNA(或mRNA)中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码。,48 . 简并性(degeneracy),同一氨基酸存在多个不同的遗传密码的现象称为遗传密码的简并性。,49 分子伴侣,分子伴侣 是细胞内一类保守蛋白质,可识别 多肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠。,各种新生分泌蛋白的N端有保守的氨基酸序列,引导 分泌蛋白进入内质网, 称为信号肽(signal peptide)。,50 信号肽,

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