生物统计学计划2012

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1、主讲教师：何淼 副教授 2012.9.17,生物统计学教学计划与绪论,简论人生,2,人生的足迹生理变化与统计,3,人生的足迹生理变化与统计,4,人生的足迹行为统计,英国人平均寿命：78.5 女人每天说的单词个数：6400-8000 男人每天说的单词个数：2000-4000 交友个数：1700 做梦的次数：104390 读书的本数：533 ，7.8本/年 眨眼的次数：4.15亿 ，14850次/天 流泪的升数：57.25，60毫升/月 抽掉的香烟根数：77000 ， 3.48根/天 步行的公里数：15464,5,人生的足迹行为统计,吃掉的苹果个数：5272 吃掉的牛只数：4.5 吃掉的鸡只数：

2、1201 吃掉的羊只数：21 吃掉的猪只数：15 喝茶的杯数：74802，3.38杯/天 放屁的升数：35815 ，1.28升/天 在不剪断情况下头发的总长度(米)：9.42 在不剪断情况下胡子的总长度(米)：9.14,6,问题、思考与第一次作业,人生是什么？你的人生目标是什么？ 什么样的人生是成功的人生？ 人生的意义和价值在哪里？ 如何兼顾个人、家庭和社会责任？ 如何让你的生命多姿多彩，更具有意义？ 500字散文。 用一个图表的形式规划自己未来的人生。,7,嗨，大家好！ 祝同学们 新学期学习愉快！,让我们成为朋友！,8,承担过课程列表,承担过多门课程的教学工作，主要包括： “食用动物资源学”

3、 “动物学实验” “动物学野外实习” “动物生态学” “计算机操作与应用” “网页设计” “生物统计学” “生物信息学” “生物数学”,9,主要科研项目,生命系统的生物信息学研究和功能模拟, 1999，国家自然科学基金重点项目 以非编码序列研究基因组水平上的分子进化,2001，国家自然科学基金面上项目 动物学专业资源库，2003，广东省“151工程”重点项目 肺癌相关新基因发现以及早期诊断标记研究,2003, 广东省科技计划项目重大专题 蛋白分子活性中心探测技术与评价方法及其在海洋药物开发中的应用，2005， 广州市科技计划重点项目 工程基因调控网的设计、构造、建模与分析，2007，国家自然科

4、学基金重点项目 植物分子设计中高维数据的低维稀疏逼近方法，2012，国家自然科学基金重大研究培育项目,10,代表论文,华南稻田农田害鼠复合防治指标的理论研究。生态学报,2003,23（1）:211-217 Cloning and characterization of a functional promoter of the human SOCS-3 gene. Biochemistry and Biophysics Res. Comm., 2003,301: 386-391 中国广西彝族人群15个STR基因座的遗传多态性调查。中国法医学杂志，2004，19（增刊）：23-24 Cluster

5、ing for microarray data analysis of tumor. Journal of Tumor Marker Oncology（Supp）, 2004, 19(4):144 基于隐马尔可夫模型的多重序列分析。中山大学学报（自然科学版），2005，44（2）：9-13 A statistical model for estimation of lung tumor doubling time. Lung Cancer, 2005,49(Supplement 2):S126-S127 虎杖提取液对非酒精性脂肪肝大鼠肿瘤坏死因子基因表达的影响。中药材，2005，28（10）：

6、917-919 Statistical characteristics of eukaryotic intron database. Frontiers of Biology in China, 2006,1(4):362-366 癌症相关促凋亡蛋白Par-4的信号转导途径预测研究。2010，中山大学学报（自然科学版），49（6）：83-88 基于共进化理论发现甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点。2011，中山大学学报（自然科学版），50（2）：81-86 Trends in the incidence of 15 common cancers in Hong Kong, 1983-2008

7、. 2012, Asian Pacific Journal of Cancer Prevention, 13,11,主要著作,昆虫病原微生物寄主相互作用的数学模型及分析（自“昆虫病理学，蒲蛰龙主编” ）。广东科技出版社，广州，1994 板齿鼠的生态及防治。“自农田鼠害生态学及防治，张知彬主编”，海洋出版社，北京，1998 行为学、群落生态学、系统生态学、生物多样性。“自现代生物学（参编）”高等教育出版社，北京，1999 普通生物学多媒体系列教学软件生物类群（副主编），高等教育出版社，北京，1999 食用动物资源学（主编）。中山大学教材，1992 捕食者-猎物系统的模拟模型。“自群落重建与水稻害

8、虫生物防治，张文庆等著”，山西科学技术出版社，太原，2001,12,获得奖励,1997年广东省科技进步三等奖 1998年广东省优秀教学软件二等奖多项。 1999年中山大学优秀教师奖励基金“安泰奖”。 2000年中山大学教学成果二等奖。 2001年国家级教学成果一等奖。 2002年度中山大学教育技术应用先进个人。 2001-03年度中山大学优秀工会工作者。 2003-04年中山大学优秀教学软件二等奖。 2005年度广东省优秀工会积极分子。 2005年度中山大学教育技术应用先进个人。 2006广东省高校现代教育技术优秀论文二等奖。 2006年中山大学第五届高等教育教学成果二等奖。 2006年第十届

9、全国多媒体教育软件大奖赛三等奖。 2007年广东省计算机教育软件二等奖。 2009年中山大学优秀工会工作者。 2011年中山大学教育工会突出贡献奖。,13,专业兴趣,学术兴趣： 生物数学模型和生物统计学应用 生物信息学 人类流行病序列变异特征分析 癌症相关蛋白质相互作用网络 基因组与生物模式建成,14,业余爱好,业余爱好： 旅行周游列国 羽毛球中大羽协会长，多项省市团体赛前三名。 扑克中大南校区双升赛冠军 集邮拥有清朝最早的大龙票,15,生物统计学主要教学内容,统计数据的收集与整理 样本统计量的抽样分布 统计假设检验、参数估计 离散型随机变量的 2 检验 单因素方差分析、多因素方差分析 一元和

10、多元回归及其分析 聚类分析 研究示例剖析,16,生物统计学教学目标,掌握一系列生物统计学的基本概念 掌握单变量或单因子的统计分析、一元回归、多元回归分析和系统分析的原理 初步掌握聚类分析的原理和方法 掌握统计学一般原理和方法在生物学研究中的应用,17,教材,杜荣骞，2009 生物统计学 高等教育出版社 北京 杜荣骞，2003 生物统计学题解和练习 高等教育出版社 北京,18,参考书目,余金明、凌莉，医学统计学基础。复旦大学出版社，上海， 2009 李春喜、邵云、姜丽娜，生物统计学（第4版）。科学出版社，北京， 2008 顾志峰、叶乃好、石耀华，实用生物统计学。科学出版社，北京，2012 Tho

11、mas Glover, Kevin Mitchell, An Introduction to Biostatistics. Waveland Press, Incorporated, 2006 王天夫、李博柏，STATA实用教程。中国人民大学出版社，北京，2008,19,教学方式,传统教学模式+E-lab。 计算机辅助多媒体教学方式。 利用计算机网络作为辅助教学途径。 指导学生阅读相关研究文献。,20,重点推介网络电子资源,http:/home.ubalt.edu/ntsbarsh/,21,考核方式,课程论文1篇，占总成绩的20% 平时考勤、作业和小测验，占总成绩的30% 期末闭卷考试，占总成

12、绩的50%,22,教学进程安排,授课14周。 期中测验1周。 复习1周。 考试1周。,23,助教及联系方式,李明 电话：159 2033 3234 邮箱：physiology_ 专业：动物学，2011 级博士研究生,24,论文形式：研究或综述小论文。 论文选题范围如下： 食品添加剂中西应用标准比较。 区域癌症、艾滋病、结核病、地中海贫血症统计分析。 设计特定人群幸福感调查问卷，构建统计指标。 模式生物基因组数据的统计分析。 综述生命科学和医学研究中的各种统计指标。 中国生物、环境、医学类网络数据源开放度和可用度调查与评估。 转基因与食品安全调查、分析。,课程论文形式和选题,25,协作研究和评分

13、准则,课程论文鼓励协作完成。 论文写作小组可以由2-3个同学组成。 论文题目可以结合自身理解具体化。 评分标准：研究思路、方案；数据获取、整理方式，分析和计算方法的新颖性。,26,重要的生物统计类国际期刊,Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology The International Journal of Biostatistics Biostatistics Journal of Computational Biology Statistical Methods in Medical Research Biometri

14、ka Journal of Agricultural, Biological, and Environmental Statistics,27,课 堂 纪 律,不得无故旷课，学期累计旷课达三次者，将会受到期末成绩扣分处罚。 尊重老师、尊重同学、注意保持良好的课堂纪律。 关于教学问题，可以随时举手提问。,28,生物统计学,第一章 绪论,29,了 解 统 计 学,30,三星首尔医院研究小组对34.4519万名40岁至64岁的女性进行了一项身高与死亡率的相关统计调查。 对在调查期去世的10216名女性进行统计调查的结果显示，女性的身高每高出5厘米，死亡率下降7%。 研究论文刊登在2008年美国医学杂

15、志。 主要结论，身高每高出5厘米，患呼吸道疾病和中风死亡的危险性就下降16%，患糖尿病和循环系统疾病的几率下降13%。,31,32,据英国媒体报道，最新研究发现，个子相对较高的人生活更为幸福，而个子较矮的人更容易对生活感到不满意。 那些最不快乐的人的身高要比所有人的总平均身高矮2.54厘米。,33,英国教授收集了全球140个允许一夫多妻制国家男子寿命的数据，和49个实行一夫一妻制国家男子平均寿命进行统计比较，结果发现一夫多妻制国家男子平均寿命要比一夫一妻制国家男子平均寿命高出12%。 如果一个男子有多个配偶，他的后代多。为养活这么多人，他就会一直小心的照顾好自己的身体，到60岁或者70岁还得工

16、作。 就遗传而言，允许一夫多妻制存在的国家，肯定实施这个制度上千年了，遗传下来的基因对延长男性的寿命有益。,34,科学家收集了35种动物的数据，统计分析发现，19种“一夫多妻制”的动物中，雄性在生命各个阶段中的死亡率都比雌性高。 但在“一夫一妻制”的动物中，雌性和雄性的死亡率却没有明显的差异。 科学家发现，在人类社会中，那些拥有多个性伴侣的男性，其寿命要比其他男性短。 研究者指出，在人类进化史上，曾经占有统治地位的一夫多妻制，是造成男性短命的重要原因。 所以，男人要想活得长一点，还是不要“妻妾成群,35,什么是统计?,统计工作 收集数据的活动 统计数据 对现象计量的结果 统计学 分析数据的方法与技术,36,什么是统计学?,数据搜集：例如，调查与试验 数据整理：例如，分组 数据展示：例如，图和表 数据分析：例如，回归分析, 统计学是一门收集、整理和分析数据方法的科学，其目的是探索数据的内在数量规律性，以达