《X-tile软件的操作流程》由会员分享，可在线阅读，更多相关《X-tile软件的操作流程（6页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、Xtile 软软件的操作流程件的操作流程由于最近在做某基因表达与预后相关性的分析，对如何选择最佳cutoff 值很疑惑。搜了丁香园的各大帖子，发现对x-tile如何使用并没有人分享过。 经过对照软件中的操作说明，终于搞明白是怎么回事了，现分享给大家！首先，将你excel表格中的“某基因的表达值”“生存期”“删失情况”等等其 他一些数据复制到文本文档中。注意：“删失情况”要写成“censored”, “uncensored”, or “unknown” 形式。然后打开软件（软件下载见附件），如图点击“Analyze“进入下图：点击 “file“-“open“打开刚建的“txt”文本，接着就可以进
2、行设置了。如下图扩大来看！（下图） 将“删失情况” 即图中的 DOD-censor,放入”censor”中， 然后将“inter type” 改 为”DeadOfDiese”； 将“生存期”即图中的”Followup-months”放入“Survival Time”,j 将“inter type” 改为你所用的时间度量，如“天”或“年”； 将“表达量”即图中的”HER2”放入“Marker1”, Mark2 如果没有可以不填。剩 余的也可以不填。然后点左上角的“do”，选择”Kaplan-Meier”“Marker1”.即可。接着会出现下如图所示结果。鼠标左键点击“2Pop X-tile Plot”所指的矩形图， 软件会自动找到最佳的 cutoff 值，得到两条线（两组：高表达低表达）。鼠 标左键点击“3Pop X-tile Plot”所指的三角形，软件会自动找到最佳的 cutoff 值，得到三条线（三组：高表达中度表达低表达）。 条形图下的 X 轴所指的数值即是最佳 cutoff 值。其余可以参照软件里的指南。写的比较业余，希望能够给大家一些帮助。
