细胞核的分离与纯化及RNA、DNA的定量测定-20121201

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1、喻娟娟生物化学与分子生物学教研室联系电话: 15836197257Email: 细胞核的分离纯化 及RNA、DNA的定量测定实验六 1. 了解细胞核分离纯化的基本原理和方法2. 掌握DNA、RNA定量测定的原理及方法3. 掌握离心机的使用一、细胞核的分离与纯化(上午)二、RNA的定量测定三、DNA的定量测定 (下午)一、细胞核的分离与纯化DNA、RNA在细胞中的分布:DNA胞核内(98%)胞质内(2%)RNA胞核内(10%)胞质内(90%)核酸的种类:DNA、RNA结论:DNA主要存在于细胞核, RNA主要存在于细胞质。二、核酸的种类及其分布核 酸 核苷酸 磷 酸 碱 基 戊 糖 定糖法(戊糖

2、的差异)三、核酸的鉴定浓HCl 3H2O+ D核糖 糠醛 糠醛 3,5二羟基甲苯绿色化合物 RNA 水解 D核糖 + Pi + A.G.C.U地衣酚法: (1)核糖核酸RNA的测定DNA 水解D脱氧核糖 + Pi + A.G.C.U-H2O硫酸 脱氧核糖 羟基酮基戊醛蓝色化合物二苯胺法: (2)脱氧核糖核酸DNA的测定1、0.25mol/L蔗糖柠檬酸(含3.3 mmol/L CaCl2) 称取蔗糖86g及CaCl2363mg,用1.5拧檬酸液溶解并稀释 至1000ml。 2、0.88mol/L蔗糖柠檬酸液(含3.3mmol/LCaCl2) 称取蔗糖301g及CaCl2363mg,用1.5柠檬酸

3、液溶解并稀释 至1000ml。 3、核洗液:即0.05mol/L,TrisHCl(pH7.5)0.15mol/L NaCl 液。 在0.2mol/L TrisHCl pH7.5缓冲液250ml中加NaCl8.7g再用蒸 馏水稀释至1000ml。 4、 1.5拧檬酸 5、0.9NaCl 6、0.02N NaOH 7、离心机 8、水浴箱 9、常规玻璃仪器试剂与器材 用颈椎脱臼法杀死小白鼠后,迅速剖开腹部取出肝脏,除去结缔组织,尽快置 于盛有0.9%NaCl的小烧杯中,反复洗涤,尽量除去血液。洗完后将肝脏一分为二, 每个小组半个肝,直接将半个肝放在小烧杯里剪碎,剪碎的肝脏放入匀浆器中,加 入 1.5

4、柠檬酸钠溶液4.5ml,反复研磨制成匀浆,从而破碎细胞。研磨完后,将匀浆 液用单层纱布进行过滤,以除去未研碎的组织。(1)肝细胞匀浆的制备(2)分离细胞质和细胞核将过滤好的匀浆液,放入普通离心机,以3500r/min的转速,离 心15min。缓慢倒出上清液(细胞质),移入另一试管中,保 留待测定核酸时使用。余下的沉淀物为粗制的细胞核,加入0.25mol/L蔗糖-拧檬酸溶 液1ml ,用玻捧搅匀,制成细胞核悬液。另取离心管一支,先加入0.88mol/L蔗糖-柠檬酸液9ml,用滴管 吸取上述核悬液,沿管壁缓缓铺于0.88mol/L蔗糖-柠檬酸溶液 液面上,再以2000r/min转速离心10分钟,倾

5、去上层液,将管倒 立于滤纸上,以吸干余液。沉淀为初步纯化的细胞核。 加入TrisHClNaCl核洗液5ml洗涤沉淀,以2000r/min离心 10min,除去上层液。得到的白色沉淀即为纯化的肝细胞核。 加5ml 0.02mol/L的NaOH使细胞核溶解为核液,保留,待测定核 酸。 0.88 mol/L蔗糖- 柠檬酸溶液9ml核悬液0.25 mol/L0.88 mol/L初步纯化 的细胞核其它的亚 细胞结构半个肝脏1.5%柠檬酸溶液4.5ml,制成匀浆单层纱布过滤1次滤液 离心:3500r/min;15min上清液 (保留!)沉淀加入0.25mol/L 蔗糖柠檬酸溶液1ml 核悬液沿壁缓铺于9m

6、l 0.88mol/L蔗糖柠檬酸液面上 离心:2000r/min;10min上清液(弃去)沉淀核洗液5ml洗涤沉淀上层液(弃去)沉 淀纯化的细胞核 5ml 0.02mol/L NaOH溶解细胞核 待测样品鉴定离心:2000r/min,10min细胞核的分离与纯化实验流程试剂试剂 (ml)12 细细胞质质液1.0-细细胞核液-1.0 1mol/LKOH1.01.02. 显色与比色:取试管三支,编号,按下表操作:试剂试剂 (ml)12空白管 细细胞质质RNA水解液1.0- 细细胞核RNA水解液-2.0- 5三氯氯醋酸1.02.0 3,5一二羟羟基甲苯液3.03.03.01. 水解:取试管二支,编号

7、,按下表操作:混合各管 沸水浴(10min) 冷却加入5%三氯醋 酸 (8ml) 搅匀后离心 2000r/min;5min上清液 立即混合各管 沸水浴(10min)冷却660nm比色测定二、RNA的定量测定试剂试剂 (ml)12 细细胞质质液2.0- 细胞核液-2.0 1mol/L过氯过氯 酸2.02.0试剂试剂 (ml)12空白 管 细细胞质质DNA水解液2.0- 细细胞核DNA水解液-2.0- 0.5mol/L过氯过氯 酸 2.0 二苯胺试剂试剂4.04.04.0混合各管冷却离心 上清液 立即混合各管冷却2000r/min;5min三、DNA的定量测定2. 显色与比色:取试管三支,编号,按

8、下表操作:1. 水解:取试管二支,编号,按下表操作:沸水浴(10min)沸水浴(12min)595nm比色测定表1. RNA的定量结果试管编号1(细胞质液 )2(细胞核液 ) 原始吸光度值 查标准曲线所得数值 提取液中RNA浓度(ug/ml) RNA占总总RNA的百分比提取液中RNA浓度(ug/ml)=显色反应试管中RNA含量稀释倍数 (细胞质液稀释倍数为10倍,细胞核液的稀释倍数为5倍)表2. DNA的定量结果试管编号1(细胞质液 )2(细胞核液 ) 原始吸光度值 提取液中DNA浓度(ug/ml) DNA占总总DNA的百分比1. 酸性溶液,取用要小心。2. 混匀要充分,并且要注意安全,防止液体溢出。3. 沸水浴操作时,要注意自己和别人的安全。4. 离心完后,一定先将上清液转出到另一试管,再吸取所需量的水解液。3. 除了定糖法来测定DNA和RNA的含量,还有已经学习过的哪种方法也可以用来测定DNA和RNA的含量?1. 为什么说本实验的题目不合适?2. 我们已经学习了电泳法来分离蛋白质,请问我们是否可以用这种方法来分离DNA、RNA?实验七 氨基酸的薄层分析下次实验预习内容

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