生物化学第19和20章代谢总论和生物能学

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1、第19章 代谢总论 (General Introduction of Metabolism)一、分解代谢与合成代谢二、能量代谢在新陈代谢中的重要地位 三、辅酶和辅酶的递能作用四、FMN和FAD的递能作用五、辅酶A在能量代谢中的作用六、新陈代谢的调节七、代谢中常见的有机反应机制八、新陈代谢的研究方法新陈代谢的功能新陈代谢简称代谢。人们将代谢的功能概括为5个方面：从周围环境中获得营养物质。将外界引入的营养物质转变为自身需要的结构元件，即大分子的组成前体。将结构元件装配成自身的大分子。合成或降解执行生物体特殊功能所需的生物分子。提供生命活动所需的一切能量。 代谢途径虽然新陈代谢包括数以千计的不同酶催

2、化的反应，但仍可以从错综复杂的代谢网络中总结归纳成一些具有共同规律的途径，并将这些途径称为主要代谢途径。这些主要代谢途径在千差万别的生物界具有相当的普遍性。 一、分解代谢与合成代谢 通过一系列的反应，将有机营养物分解成较小的 、较简单的物质的过程称为分解代谢（catabolism） ，分解代谢的同时，将蕴藏在有机大分子中的能量逐 步释放出来，提供给生命活动使用，同时，分解代谢 的中间产物也可用于合成生命活动所需的新的物质。利用小分子或大分子的结构元件合成生物大分子 或其它所需分子的过程称为合成代谢（anabolism） 。合成代谢需要提供能量。分解代谢途径与合成代谢途径一般是不同的，但 不同的

3、代谢途径之间也可以有重叠的部分。二、能量代谢在新陈代谢中 的重要地位 各种分子之间间的互相转变转变 称为为物质质代谢谢，而伴随着物质质代谢发谢发 生的能量的吸收、转转移、释释放、利用称为为能量代谢谢。太阳能是所有生物最根本的能量来源，能进进行光合作用的植物将光能转变转变 成化学能，这这些化学能提供了植物生命活动动所需的全部能量（有少数特殊情况），动动物和大多数微生物直接或间间接依靠植物光合作用贮贮存的化学能生活。ATP是能量代谢的中心物质生物体直接利用的能量物质质主要是ATP，在分 解代谢谢中，释释放出的能量主要用于合成ATP，在需 要提供能量的反应应或其它生命活动动中，主要由ATP 水解来提

4、供能量，所以ATP是能量代谢谢的中心物质质 。ATP不是一种能量贮贮存物质质，而是一种传递传递 能量 的分子，因为为在一般情况下，ATP分子合成后，在1 分钟钟之内就被利用。生物体对对能量的消耗是惊人的。据计计算，一个 处处于安静状态态的成年人，一日内需消耗40kg的ATP 。在剧剧烈运动时动时 ，ATP的利用可达到每分钟钟0.5kg 。三、辅酶和辅酶的 递能作用 由营养物质的分解代谢释放出的化学能，除了通过合成ATP的途径捕获外，还有另外一种途径，就是以氢原子和电子的形式将自由能转移给生物合成的需能反应。这种具有高能的氢原子是由脱氢反应形成的。脱氢反应产生的氢原子和电子可由辅酶或辅酶接受。当

5、这些辅酶被氧化时，能量又被释放出来。 四、FMN和FAD的递能作用（略）五、辅酶A在能量代谢中 的作用 酯酰CoA中有一个高能的硫酯键，这也可以看成是酰基的一种活化形式。ATP的磷酸酐键水解时释放出30.54 kJ/mol的自由能，而乙酰CoA的硫酯键水解时释放出31.38 kJ/mol的自由能。 六、新陈代谢的调节新陈代谢的调节主要是靠酶数量和活性的调节，细胞中有许多由膜分割的部位，特定的代谢途径在特定的细胞部位进行。物质需要在细胞不同的部位间运输，有时还需要在细胞间或整个机体内运输。物质运输的方向、量及速度也影响代谢。 七、代谢中常见的 有机反应机制（略）八、新陈代谢的研究方法 （一）使用

6、酶的抑制剂 酶的抑制剂可使代谢途径受到阻断，结果造 成其底物积累，为测定该代谢物提供条件。利用 酶的抑制剂可以研究代谢途径，从最初的反应物 经过哪些中间代谢产物，最终形成产物的。 （二）利用遗传缺陷症研究代谢途径某些个体由于遗传缺陷，先天就缺少某种酶。 余同前。（三）气体测量法用瓦氏呼吸计测定反应过程中吸收的气体量或释放的气体量。这不是一种研究方法，而是一种实验技术。 （四）同位素示踪法用放射性同位素示踪，可以跟踪某一原子的去向，从而得知代谢途径。放射性强度测定放射自显影 常用放射性同位素表同位素名称符号放射线类线类 型半衰期氢氢3（氚氚）3H,T12.26年碳1414C 5730年磷3232

7、P 14.3天碘131131I8.070天硫3535S87.1天（五）核磁共振波谱法这也是一种实验技术。 第20章 生物能学 （Bioenergetics）一、有关热力学的一些基本概念二、化学反应中自由能的变化和意义三、高能化合物一、有关热力学的 一些基本概念（自由能的概念)凡是能够用于做功的能量称为自由能。 二、化学反应中自由能 的变化和意义（二）标准自由能变化和化学平衡的关系 化学反应中的标准 自由能变化在化学反应中，反应物和产物各自都有特定的 自由能。产物自由能的总和与反应物自由能的总和 之差，就是该反应的自由能变化。为了计算的方便 ，人们总是规定一些条件作为标准条件，并将在此 条件下所

8、发生的化学反应的自由能变化称为标准自 由能变化。 计算标准自由能变 化时的标准条件标准条件指的是，反应的温度为25，即298K，大气压为101,325 Pa（1atm），反应物和产物的浓度都是1mol/L。标准自由能变化的符号用Go 表示。对于生物化学反应，标准状况还规定反应进行的环境为pH=7，这时的标准自由能变化用G o表示。 G0 和GGo 是在标准条件下，一个化学反应的自由能变化，它是一个常数，而G 是一个化学反应在某一实际条件下的自由能变化，G 随着反应的温度、反应物及产物的浓度、反应介质的pH等的变化而变化。 标准自由能变化的计算公式假设有如下的一个化学反应式：aA + bB cC

9、 + dD 在恒温和恒压下，这一反应的自由能变化公式是 ：式中Go 是该反应的标准自由能变化，R是 气体常数，T是绝对温度，A、B、C、D 代表4种物质的摩尔浓度，严格地应为活度。从以上的公式可以看出，一个化学反应自由能的变化 值G，由两部分决定，一部分是不变因素，即由反应本 身的性质所决定；另一部分是可变因素，即各物质的浓度 、反应的化学当量以及反应的温度。 反应的平衡常数与G0当反应达到平衡时，自由能变化为零，即G = 0，而反应的平衡常数代入上式得当pH为7时根据测得的反应达到平衡时各物质的浓度，可以计算出反应的平衡常数，代入上式可以计算出反应的标准自由能变化值。 注意，生化反应很多都是

10、可逆反应，正反两个方向 反应的G0 的绝对值相同，符号相反。 G是反应能否进行的判据G可用来判断一个反应是否能够自发进行，当G0时（反应放出能量），反应可以自发进行，G负值的绝对值越大，反应自发进行的趋势越大，随着反应的进行，G负值的绝对值越来越小，当G = 0时，反应达到平衡；当G0时，反应不能自发进行。标准生成自由能的概念每一种有机化合物都有自己的标准生成自由 能，用符号Gof 表示。标准生成自由能Gof 的定 义是，由处在标准状态下的最稳定单质合成1mol标准状态的化合物时，其标准自由能的变化值。 由于各种物质的标准自由能都无法测得，人们规 定，在1个大气压下，一定温度时，最稳定的单质的

11、标准自由能为零。这样，由最稳定的单质反应 生成某一种物质的反应的标准自由能变化值就是 这种物质的标准生成自由能。 标准生成自由能的应用利用各种物质的标准生成自由能，也能计算出一个反应的标准自由能变化量Go ，即Go =产物的标准生成自由能反应物的标准生成自由能进一步还可以计算出反应的平衡常数。偶联化学反应标准自由能变化 的可加性及其意义在互相联系或称为偶联的化学反应中，这些相互联系的化学反应的总的自由能变化等于各步反应自由能变化的总和。当其中一个反应的自由能变化为正值时，只要总反应的自由能变化为负值，这个反应也是能够进行的。在生化反应中，常有自由能变化为正值的反应与ATP的水解反应相偶联，也就

12、是说，ATP水解释放出的能量驱动了某一需能反应。 偶联化学反应的表示方式C+ATPD+ADP+Pi化学反应和自由能关系的 进一步说明 1G 0的反应，即使有催化剂也不能进行。3不稳定的基团自由能高，容易发生反应。能量学用于生物化学反应中 的一些规定1一个稀的水溶液系统，如果有水作为反应物 或产物时，水的浓度规定为1.0。2在生物化学能量学中，通常把标准状况的pH 规定为7.0。而在物理化学中，标准状况规定为 pH0.0（即H+浓度为1.0mmol/L）。不同pH下 Go不同。3标准自由能的单位为 kJ/mol 或 kcal/mol。三、高能化合物 (高能化合物的概念)机体内有许多含磷酸的化合物

13、，当其磷酰基水解时，释放出大量的自由能，这类含磷酸的化合物称为高能磷酸化合物。当这些磷酰基水解时，能释 放出20.92kJ/mol（5 kcal/mol）以上的能量，因此将这些磷酸基团与其它基团之间的键称为“高能键”（high-energy bond），并用符号 表示。注意生物化学中的“高能键”的含义与化学中使用的“键能”含义是完全不同的。 高能磷酸化合物及其它高能 化合物的类型高能磷酸化合物中的磷酸大多数是与另一个酸形成酸酐，与之形成酸酐的酸有羧酸、磷酸、硫酸等。还有磷酸与胍基、烯醇式羟基之间结合的化合物也是高能磷酸化合物。除了含磷酸的高能化合物外，还有不含磷酸的高能化合物，如酰基CoA中的

14、硫酯键、S-腺苷甲硫氨酸中甲基与S之间的硫醚键也是高能键。 磷氧键型高能磷酸化合物乙酰磷酸氨甲酰磷酸1,3-二磷酸甘油酸磷氧键型高能磷酸化合物焦磷酸氨酰腺苷酸酰基腺苷酸磷氧键型高能磷酸化合物ATP磷酸烯醇式丙酮酸氮磷键型高能磷酸化合物磷酸精氨酸磷酸肌酸硫酯键型高能化合物3-腺苷磷酸5-磷酰硫酸酰基CoA甲硫键型高能化合物S-腺苷甲硫氨酸与核糖的 5碳相 连一些磷酸化合物水解的标准自由能变化 化合物Go磷酸基团转团转 移势势能 磷酸烯烯醇式丙酮酮酸-61.9 kJ/mol61.9 kJ/mol 氨甲酰酰磷酸-51.46 kJ/mol51.46 kJ/mol 磷酸肌酸-49.3 kJ/mol49.

15、3 kJ/mol ATP+H2O AMP+PPi -32.2 kJ/mol32.2 kJ/mol ATP+H2OADP+Pi-30.5 kJ/mol30.5 kJ/mol ADP+H2OAMP+Pi-30.5 kJ/mol30.5 kJ/mol PPi+ H2O2Pi-28.8 kJ/mol28.8 kJ/mol 葡萄糖-1-磷酸-20.9 kJ/mol20.9 kJ/mol 葡萄糖-6-磷酸-13.8 kJ/mol13.8 kJ/mol注意ATP位于所列磷酸化合物的中间位置细胞内影响ATP自由能 释放的因素在细胞内环境条件下，在pH7时，ATP及ADP的全部磷酸基团都处于解离状态。细胞内有大

16、量的 Mg2+，Mg2+与ATP4及ADP3形成Mg2+ATP2及 Mg2+ADP的形式，而实际上Mg2+ATP2才是 ATP的活性形式。所以Mg2+浓度、pH、ATP、无机 磷酸的浓度都能影响ATP水解时释放的自由能的量 。 ATP在能量转运中的 地位和作用 1它可以在磷酸转移中起到“共同中间传递 体”的作用。ATP在能量转运中的 地位和作用2在偶联反应中提供能量。磷酸肌酸的作用神经和肌肉等细胞活动的直接供能物质是ATP，但ATP在细胞中的含量很低，在哺乳动物的脑和肌肉中约38mmol/kg。这些ATP只能提供肌肉剧烈活动1s左右的消耗。而肌肉和脑中磷酸肌酸的含量远远超过ATP，在脑中约为ATP的1.5倍，在肌肉中则为ATP的4倍。受过良好训练的运动员其肌肉中磷酸肌酸的含量可高达30mmol/kg。磷酸肌酸可以看成是ATP的后备军，磷酸肌酸中贮存的能量可以很快转移到ATP中