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1、蛋白数据库应 用解析内容1：蛋白数据库2：免疫学数据库 （结合本周教学主题）方式网络在线操作演示为主蛋白质数据库序列数据库模体及结构域数据库结构数据库分类数据库PIR（protein information resource）SWISS-PROTTrEMBL序列数据库UNIPROT（Universal Protein Resource）结构数据库PDB（Protein Data Bank）蛋白结构显示软件PyMol RasMol VMD Cn3DPyMOL-created Journal Covers 蛋白结构显示软件PyMolPymol 软件演示数据库库网址说说明 IMGThttp:/img
2、t.cines.fr/一个高质量的关于免疫球蛋白、T细胞受体、主 要的组织相容性复合体以及人类和 哺乳动物免 疫系统相关的综合数据库，可免费检索KABAThttp:/immuno.bme.nwe.ed u/包含较完整的免疫学相关蛋白的基本信息和分 类及不同物种的MHC, IG, TCR以及其他免疫相 关分子序列 SYFPEITHIhttp:/www.syfpeithi.de/收录了来自人类和其他物种MHC-I类和II类配体 的序列和基序 HIV databaseshttp:/www.hiv.lanl.gov/co ntent/index收录HIV细胞毒性T细胞表位、辅助性T细胞表 位和抗体结合
3、位点，提供了表位比对、基序检 索、序列定位等免疫信息学工具 HCV immunologyhttp:/hcv.lanl.gov/content/ immuno/immuno- main.html收录CD8+和CD4+ T细胞的HCV抗原表位，蛋 白组表位图谱dbHMChttp:/www.ncbi.nlm.nih.g ov/mhcNCBI为人类主要组织相容性复合物相关的DNA 和临床数据创建的一个开放平台免疫信息学数据库数据库库网址说说明 AntiJenhttp:/www.jenner.ac.uk/A ntiJen含T细胞表位、B细胞表位、TCR-MHC相互作用 以及MHC和TAP配体定量结合数据
4、的关系型数 据库，数据来源于已发表的结果 Bcipephttp:/www.imtech.res.in/r aghava/bcipep/收录能引起体液免疫应答的B细胞表位，有助于 B细胞表位预测方法的开发、合成肽疫苗设计 和疾病的诊断 SDAPhttp:/fermi.utmb.edu/SDA P/提供了肽段匹配工具，可筛检蛋白质中是否含 有已知变应原的IgE表位，能迅速确定变应原之 间的交叉反应性 Allergenhttp:/allergen.csl.gov.uk/过敏原数据库 Protallhttp:/www.ifrn.bbsrc.ac.u k/protall收录导致IgE超敏反应的植物性食物
5、变应原及其 生化与临床信息 CIDhttp:/www2.licr.org/Canc erImmunomeDB/肿瘤免疫组数据库CD40Lbasehttp:/www.expasy.org/cd4 0lbase/收录了CD40配体缺陷引起X染色体连锁高IgM 综合征得临床与分子数据 HDBhttp:/www.atcc.org/comm on/catalog/cellBiology/hdb. cfm杂交瘤数据库数据库库网址说说明 IEBDhttp:/www.immuneepitop e.org/home.do抗体和T细胞表位数据库，同时提供T细胞和B 细胞表位预测及表位保守度和同源图谱分析工 具 M
6、PIDhttp:/surya.bic.nus.edu.sg/MHC-多肽相互作用数据库，收录MHC-I和II类 分子与相应配体相互作用的结构信息及特征 IPD-MHChttp:/www.ebi.ac.uk/ipd/ mhc/收录了大量物种的MHC序列MHCBNhttp:/imtech.res.in/raghav a/mhcbnMHC结合肽或非结合肽数据库，提供与MHC相 关联的自身免疫疾病信息 APDhttp:/aps.unmc.edu/AP/ma in.php抗菌肽数据库，提供BLAST比对，关键词检 索 等多项服务 FIMMhttp:/sdmc.lit.org.sg:8080/ fimm/集成功能免疫学数据库HLA- ligand/motifhttp:/hlaligand.ouhsc.edu/i ndex_2.htmlMHC配体、T细胞表位及结合基序数据库MotifScanhttp:/www.hiv.lanl.gov/co ntent/immunology/motif_s can/motif_scanHLA基序数据库摘自：现代检验医学杂志，2009；24（1）：110-112免疫多态数据库 Immuno polymorphism database国际免疫遗传学数据库 the international immunogenetics database多上网多交流多实践
