《东北寒温带冻土湿地中细菌的分离与鉴定》由会员分享,可在线阅读,更多相关《东北寒温带冻土湿地中细菌的分离与鉴定(3页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、专题二环境微生物资源发掘与应用a n dt I l e 如n h e rr e s e a r c ha b o u td e I l i t r i f 弧n g M u l t i V 撕a t es t a t i s t i c a la n de n v i r o n m 锄t a lp a r a m e t e r sa n a l y S e si r I d i c a t e dah e t e r o g e n e D u sd i s t r i b u t i o no ft h eb a c t e I j a l 弱s 朗1 b l a g 鼯i nB o I
2、 I a iB a y A tt l l es a m et i n l e ,m eh i e m r c h i c a lc l u s t e r ( c l u s t e rAt oH ) a n a l y s i so b s e n ,e d 廿1 a tm o s to f B o h a iB a y 办s e q u e n c 鹤h a dt l l e j rc 1 0 s 伪tm a t c h 豁d e t c c t e di I lo 吐l c rs 础m e n t a le n 啊r 讲衄e n 坞,s u c h 鹪丘D mw e t l a n d
3、,I a k e ,a c t i V a t c ds l u 趣e ,g r e 豇l h o 硼蛤s o i l 锄d 0 1 1 I ns p 沁o fm es i I I l i l 撕t y 谢mo n l e r s ,m ed 饥i t r i 6 ,i I l gb a c 矧ao fB o h a iB a ya 1 S o 批a I s oo fc l l a r a c 矧s t i c 血eg e o g r a p h i c a l 龃dp h ) ,s i o c h 锄i c a lf a c t o 塔,d e n 确f i c a t i o n0 c c
4、 u r r e di l lm ec o 舔t a l 删疵n e 锄de s m 撕n e d i I l l e I l t sb l l tt oal e 鹳e re x t ti nt 1 1 er i v e r 幽n e 戚T h ea b 邶d a n c e 锄dd i s m m u t i o nf I l 】r l h e rp r o v e d吐l eu n i V e 啪l 时a n ds p e c i f i c 时o fd e I l i t r i f i c a t i K e y w o r d s :I I l i b i a lc o m m u
5、n i t ) ,;l6 Sr R N A ;f 坶g e o g r a p l l i c a l 勰dp h y s i o c h e I I l i c a lp 猢c t e 幅;吼i v e r 鼢l i t ) ,a n ds p o c i f i c i 哆;东北寒温带冻土湿地中细菌的分离与鉴定王保军1 ,周袖1 ,王莲1 ,王宪伟2 ,郭跃东2 ,宋长春2 ,刘志培1 ,刘双江1( 1 中国科学院微生物研完所,北京1 0 0 l O l ,2 中国科学院东北地理与农业生态研究所,长春1 3 0 0 1 2 )摘要:我国东北寒温带冻土湿地,处于欧亚大陆冻土地带的南缘,冻土深
6、度较薄,与一个世纪之前相比,现今的冻土地带南界已经北移2 0 3 0 公里。究其原因,主要是人类活动的不断加剧,环境温度的升高,加速了湿地中泥炭等有机物质的分解,促进了C 0 2 和C H 4 的释放,进而扩展了温室效应,期间,微生物可能充当重要角色。因此,研究冻土湿地生态系统中微生物的种群组成,生物活性,揭示气候变暖背景下寒温带湿地土壤微生物活性变化及其对碳排放的影响机理,对于保持湿地自然生态平衡,减缓气候变暖影响,具有重要的理论意义和现实意义。2 0 1 0 年秋季,对我国东北寒温带具有典型性的冻土湿地,主要是分布予大兴安岭地区,小兴安岭地区,三江平原地区的沼泽湿地开展了专题科学考察及样品
7、的采集。随后,对采集的全部5 8 个样点的3 0 0余份样品,进行了湿地样品多项基本参数,诸如p H ,干湿比,好氧细菌总数的测定。结果表明:1 沼泽湿地样品的p H 范围为3 7 7 1 尤以p H5 - 6 之间居多,具有明显的偏酸性沼泽湿地地理特征。许多湿地样品,随着土壤纵向剖面层深度的增加,出现了p H 值随之降低的现象;2 湿地样品含水量差异显著,干湿比可从4 延伸至8 7 ;3 好氧细菌总数在1 0 4 1 0 9 个倌( 干重样品) 的范围,大多为1 0 5 1 0 8 个g ,在一些湿地样品中细菌总数与土壤纵向剖面层( o - 1 0 c m ,l O _ 2 0 c m ,2
8、 0 3 0 c m ,3 0 - 4 0 锄) 之间,呈现出随土壤深度增加而菌量逐渐递减的趋势。选择大兴安岭漠河地区北极村2 号采样点( 多年冻土湿地类型) 和南翁河生态站的样品( 岛状冻土地湿地类型) ,并兼顾到湿地样品具有寒温带沼泽湿地的地域特点,采用改良的R 2 A 细菌培养基( p H 6 5 6 8 ) ,低温1 5 条件下,培养7 - l O 天,从中分离纯化各种细菌总计约3 0 0 株。 纯化后的细菌,采用细菌1 6 S 黼基因P C R 扩增,序列测定,G e n B a n k 中已知序列比对,连同细菌形态学观察,细胞染色等常规鉴定方法,进行细菌分类学鉴定。迄今,已经初步鉴
9、定了各种细菌2 8 5株,其中,北极村样品1 4 5 株;南瓮河样品1 4 0 株。经与G e n B a n l 【中已知的1 6 Sr R N A 基因序列进行比对,在上述2 8 5 株细菌中,发现至少有1 5 株细1 2 0专题二环境微生物资源发掘与应用菌的最大相似性在9 4 9 7 之间。通常认为,细菌1 6 Sr 鼢、A 基因序列同源性低于9 8 以下,有可能是潜在的细菌新种。之后,对其中的5 株细菌,D n 协妇舡s 昀i I lB J C 2 1 A 2 1 ( 最大相似性9 6 8 ) :国砌”伽船s p s 仃a i l lB J C 2 l C 3 ( 最大相似性9 6 2
10、 ) ,o m 妒砌曙溯。删s p s i l lB J C 2 1 D 1 2 ( 最大相似性9 7 2 ) ;D c 讲咖讽皤 s p s 的i n N w H S D 3 0 ( 最大相似性9 7 ) :朋沈恸加c f 仃s p s 蛔i I l B J C 2 1 - B 1 9 ( 最大相似性9 7 ) ;进行了细菌系统学鉴定实验,包括:基于1 6 Sr 对姐基因序列的细菌系统发育树的构建,细菌极性脂分析,G 屺m o 协6 测定,最适生长p H ,最适生长温度,各种生理生化特征检验,细菌醌的提取与组成分析,核酸杂交,脂肪酸组成分析,细胞形态的电镜观察等。在完成全部的系统细菌学鉴定之
11、后,这些曾经生活在茫茫沼泽湿地中的居住者,将会成为公开亮相的微生物大家族中的新成员。太湖沉积物聚磷菌勖以威妇m s 爿卯口朋“励口绌,多样性研究陈楠陈好好杨金水衷红莉( 农业生物技术国家重点实验室,中国农业大学生物学院,北京1 0 0 1 9 3 )摘要:磷是引起水体富营养化的关键因素。沉积物是水体中污染物的总汇和来源,其所含有的磷含量远超出上覆水。水沉积物界面的磷循环很大程度上依赖于微生物,而聚磷菌更与这一过程直接相关。探索与磷循环直接相关的聚磷菌的组成及变化特点,对深层次解析富营养化的微生物学机理具有重要意义。目前对聚磷菌这一特殊资源群的研究主要集中在污水处理系统,对沉积物中聚磷菌的种群组
12、成及其所发挥的作用还缺乏认识。研究表明c 口删z 加嬲彳础研球励旺吮,是污水处理系统中的优势聚磷菌类群。它们在磷的吸收与转化中扮演最重要的角色,在淡水沉积物中这一类群亦广泛存在。l 型多聚磷酸激酶( P P K l ) 是细菌体内催化合成聚磷酸盐的主要酶类,在聚磷菌过量摄取磷的过程中发挥着关键性作用。P P K l 基因序列有较高的保守性,以其为标记基因通过构建克隆文库可以很好的反映污水处理系统中的聚磷菌群落组成。本研究以太湖为对象,通过构建P P K l 基因的克隆文库,研究太湖1 6 号和2 4 号标准采样位点藻华爆发前期( 2 月份) 及爆发期( 8 月份) 沉积物样品( 分别标记为1
13、6 _ 2 ,1 6 8 ,2 4 _ 2 和2 4 8 ) 中聚磷菌的生态分布,为深入了解聚磷菌在水体磷循环及富营养化中的作用机理奠定基础。结果显示,所有四个样品中的C a ,l 比妇f l 岱彳c c l 绷砌铂c f P ,基本均属于该类群的第进化分支( c l a d e ,共有I ,m ) 。1 6 - 2 的菌种丰度最高( 3 3 2 5 ) ,其次为2 4 8 ( 2 1 5 0 ) ,然后是2 4 - 2 ( 1 9 o o ) 和1 6 8( 1 5 2 5 ) ;但在菌种均度上,2 4 _ 2 和2 4 8 的均度高( 分别为O 3 0 6 和0 2 9 9 ) ,其次为1
14、 6 8 ( 0 2 3 9 ) ,最后为1 6 2 ( 0 1 9 9 ) 。1 6 号采样位点样品的沙龙纳威指数( 日) 明显低于2 4 号样品( O 9 0 0 和0 9 1 8 ) ,且同一位点的不同时期的胃差异不显著。2 4 号采样位点的聚磷菌在种类及分布上变化不显著;而1 6 号采样位点在藻华爆发前期具有较高的聚磷菌多样性,并随着藻华爆发大幅减少。这可能是由于2 4 号位点处于水草区,受藻华影响较小,磷含量维持在较稳定的水平,聚磷菌群落组成较为稳定,而1 6 号位点富营养化严重,具有明显的藻华爆发周期性,磷含量交化显著,聚磷菌群落组成也随之变化。综上所述,在富营养化水体沉积物中,聚磷菌与藻华爆发密切相关,但还需更进一步的研究,并结1 2 1东北寒温带冻土湿地中细菌的分离与鉴定东北寒温带冻土湿地中细菌的分离与鉴定作者:王保军, 周楠, 王莲, 王宪伟, 郭跃东, 宋长春, 刘志培, 刘双江 作者单位:王保军,周楠,王莲,刘志培,刘双江(中国科学院微生物研完所,北京 100101), 王宪伟,郭 跃东,宋长春(中国科学院东北地理与农业生态研究所,长春 130012)本文链接:http:/