SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用

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1、农业生物技术学报,2010年,第18卷,第4期,第682688页 010, 8,682究报告 晓云 张青林 黄建民 罗正荣 1江西省农业科学院园艺研究所,南昌330200;2华中农业大学园艺植物学教育部重点实验室,武汉430070 通讯作者,b要对异序列扩增多态性;部分柿属植物种质 鉴定和亲缘关系分析中的应用进行了研究,并对每个。基于5个逆转座子引物的25对组合在供试28份柿属()基因型中共扩增出l 300 个位点(多态位点93,每对引物平均产生52个位点(含48个多态位点),表明系数(高多态性的标记系统;经产中国、日 本的柿种质(D及柿的近缘种各自单独成组,该聚类结果与部分已知亲缘关系的试材

2、十分吻合 表明外,在25对引物组合,将在柿属植物遗传关系研究中广泛应用。 关键词柿属植物,种质鉴定,亲缘关系,逆转座子,特异序列扩增多态性( 30200, 0070,039696747968201004009 in of in a 300 214(9338)an is a he of 8 on in to be ur be as a ,0396967401004009 基金项目:本研究由国家自然科学基金(0871686,0921002),教育部高等学校博士学科点专项科研基金(新教师基金) (00805041008),江西省农业科学院创新基金(博士启动项目:2009博8)共同资助。 收稿日期:2

3、0090408 接受日期:20090508 一种检测逆转座子和与其临近的酶切位点 之问et 1997),已广泛应用于植物种质鉴定、 遗传多样性评价、系统进化研究、遗传连锁分析和遗 传图谱构建等许多领域(007;2008;Det 2010)。国内近年也有报道(娄 群峰等,2007;马小峰等,2008)。但现有文献多集中 于大田农作物,在木本果树植物上应用较少且仅限 于品种鉴定。已有的研究初步表明,该标记较其它标 记方法在果树种质鉴别尤其对芽变性状的鉴定方 面更具灵敏性(004;et 2006; et 2001:韦杰,2007)。柿属植物中已经 开发出晓云 和罗正荣,2006;et 2006),但

4、记尚未见报道。本研究在建立柿属植物体系的基础上,探讨其在柿属种质鉴定、亲缘关系 研究和遗传变异分析等领域的应用效果,旨在为柿 属植物种质资源及其利用研究提供技术支撑和基础 资料。 1结果与分析 11 5对引物共扩增出位点1 300个其中多态位 点1 214个(多态位点百分率9338)。扩增片段大 小在50700 引物对扩增产生990个 位点(平均52个)。多态位点率介于8125 100。引物扩增的详细信息见表1;每个引物组合均 产生各异的指纹图谱,同一组合在种问扩增谱带差 异明显。图1所示为12 1不同逆转座子引物组合 of 8 a:括号内数字表示每对b:括号内的数字表示每对a:b:in 业生

5、物技术学报 Jol28:编号对应的试材见表2 l 8 l28:to 应用,供试材料相似指数变化范围从0504(901 34和 美洲柿)到0972(富有和松本早生),平均0729 由图2可见,以相似指数060为阂值,28份试 材聚为2组,供试的6个柿近缘种单独形成一组。柿 组内,在相似指数为08】水平进一步可分为3个亚 组。除900,90399和90134之外的12份中国 柿基因型聚在一起形成组内磨盘柿、宝 盖甜柿、小宝盖甜柿直接相聚,表现较近的亲缘关 系;小果甜柿、四方甜柿与罗田甜柿亲缘关系较近, 而鄂柿1号、宝盖甜柿和小宝盖甜柿与罗田甜柿表 现较远的亲缘关系。因型。其中,前川次郎是次郎的芽变。松本早生是 富有的芽变,在聚类图中各自相聚紧密。表明聚类结 果可靠。9】0,90399和9O134因与其它】2份 中国柿基因型关系较远而自成一组,形成图3为主坐标分析结果反映出的试材间的亲 缘关系与有不同 的是分析结果中合并形成了3个主坐标总 的贡献率为430,第一、第二和第三主坐标贡献率 依次为227,124和80。 总的来看,示了聚类结果与地理起源相关性及种性差异之间 的关系,即柿种下试材依地理起源(中国、日本)的不 同

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