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1、中心法则:是指遗传信息从DNA传递给 RNA ,再从 RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给 DNA ,即完成 DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。在某些病毒中的RNA自我复制(如烟草花叶病毒等) 和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程(某些致癌病毒)是对中心法则的补充。基因表达:指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。 (差别基因表达(differential gene expression):指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表达,表达的基因数约占基因总数的5 10
2、。也就是说,某些特定奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞,另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞,这就是基因的差别表达。其本质是开放某些基因,关闭某些基因,导致细胞的分化。)编码链:双链DNA中,不能进行转录的那一条DNA链,该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致(在 RNA中是以 U 取代了 DNA中的 T) ,又称有义链(sense strand) 。模板链 (template strand ) :可作为模板转录为RNA的那条链,该链与转录的RNA碱基互补( A-U,G-C) 。在转录过程中, RNA聚合酶与模板链结合,并沿着模板链的3 5; 方向移动,按照5 3 方
3、向催化RNA的合成。又称为反义链(antisence strand)。启动子( promoter ) :指 RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。启动子是基因(gene)的一个组成部分,控制基因表达(转录)的起始时间和表达的程度。但是启动子本身并不控制基因活动,而是通过与称为转录( transcription)因子的这种蛋白质(proteins)结合而控制基因活动的。一般分为广谱表达型启动子、组织特异性启动子、肿瘤特异性启动子等多种形式。基因的启动子部分发生改变(突变),则导致基因表达的调节障碍。这种变化常见于恶性肿瘤。转录起始点:指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,研究证
4、实通常为一个嘌呤。常把起点前面,即 5末端的序列称为上游(upstream ) ,而把其后而即3未端的序列称为下游(downstream) 。在描述碱基的位置时,一般用数字表示,起点为+1,下游方向依次为+2、+3,上游方向依次为-l 、-2、-3。转录单位:是一段从启动子开始至终止子(terminator)结束的DNA序列, RNA聚合酶从转录起点开始沿着模板前进,直到终止子为止,转录出一条RNA链。在细胞中,一个转录单元可以是一个基因,也可以是几个基因。转录泡( transcription bubble) :在转录延伸阶段,具有RNA聚合酶活性的转录复合体结合并解开DNA双链、合成RNA链
5、,外观类似泡状。/ 转录泡是由RNA聚合酶核心酶、 DNA模板链以及转录形成的RNA新链三者结合形成的转录复合物。在转录的延伸阶段,RNA聚合酶使 DNA双螺旋解链,暴露出长度约为17bp的局部单链区,因外形酷似泡状结构故称之为转录泡。转录泡能够沿模板链35方向移动,速度约为2050nt 每秒,位于RNA聚合酶前端的DNA双链不断解旋,而后端转录过的DNA单链又恢复双螺旋结构。上游序列:转录起点5端的序列为上游序列。下游序列:转录起始点3端的序列为下游序列。普里布诺框( Pribnow box ) :原核基因转录起始区上游10bp 处一段富含AT碱基对的保守序列,其一致序列为 TATAAT 。
6、终止子( terminator) :给与 RNA聚合酶转录终止信号的DNA 序列。封闭的转录起始复合物(closed promoter complex) :RNA聚合酶全酶与双链DNA非特异性结合后,沿着DNA的一个方向滑动扫描,首先遇到-35 区,形成的不稳定复合物称为封闭的转录起始复合物。开放的转录起始复合物(open promoter complex) :因子使 DNA部分解链,一旦DNA解链, DNA产生一个小的发夹环,导致DNA模板链进入活性中心,封闭复合物2 转变成稳定的开放复合物。全酶( holoenzyme ) :具有催化活性的酶,包括所有的必需的亚基、辅基和其它的辅助因子。核
7、心酶( core enzyme ) :大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5 个亚基组成( 2,) ,没有 基的酶叫核心酶。核心酶只能使已开始合成的RNA链延长,但不具有起始合成RNA的能力,必须加入基才表现出全部聚合酶的活性。无效转录( abortive initiation) :开放复合物内的RNA聚合酶往往会重复催化短RNA分子的合成并释放它们,这样的合成称为无效合成,无效转录物长度一般在6nt 左右。启动子清空( promoter clearance) :指聚合酶离开启动子以实现转录从起始进入延伸的过程。一致序列( consensus sequence) :在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出现的核苷酸或氨基酸组成的序列。rut 位点:在依赖 因子的转录终止中,因子优先结合的位点被称为Rho因子利用位点,简称rut位点。