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1、 国家超级计算广州中心 2014 TH-2 用户手册 试用版 V 1.1 W W W.N S C C-G Z.C N 国家超级计算广州中心 TH-2 用户手册（试用版） 修订说明修订说明 版本版本 修订人修订人 修订内容修订内容 修订日期修订日期 1.0 钟英 用户手册试用版 2014-06-05 国家超级计算广州中心 TH-2 用户手册（试用版） 国家超级计算广州中心 TH-2 用户手册（试用版） i 目目 录录 1 TH-2 系统基本环境 . 1 1.1 TH-2 系统概述 . 1 1.1.1 硬件环境 . 1 1.1.2 软件环境 . 2 1.2 编译环境 . 3 1.2.1 Intel
2、 编译器 . 3 1.2.2 GCC 编译器 . 6 1.2.3 MPI 编译环境 . 6 1.2.4 MIC 编译环境 . 7 2 TH-2 使用方式 . 8 2.1 基本条件 . 8 2.2 登录和数据传输 . 8 2.2.1 VPN 远程连接 . 8 2.2.2 非远程连接方式 . 9 2.2.3 文件传输 . 9 2.3 环境变量设置 . 9 2.4 退出系统 . 10 2.5 用户账号密码修改 . 10 3 TH-2 作业提交 . 11 3.1 使用限制 . 11 3.1.1 分区限制 . 11 3.1.2 用户限制 . 12 3.2 状态查看命令 . 12 3.2.1 结点状态查看
3、 yhinfo 或 yhi . 12 3.2.2 作业状态信息查看 yhqueue 或 yhq . 13 3.3 提交作业 . 13 3.3.1 交互式作业提交 yhrun . 13 3.3.2 批处理作业 yhbatch . 17 国家超级计算广州中心 TH-2 用户手册（试用版） ii 3.3.3 分配模式作业 yhalloc . 19 3.4 任务取消 yhcancel . 20 3.5 备注 . 21 国家超级计算广州中心 TH-2 用户手册（试用版） 1 1 TH-2 系统基本环境系统基本环境 1.1 TH-2 系统系统概述概述 天河二号超级计算机系统是国家 863 计划和核高基重大
4、专项的标志性成果， 是新一代银河高性能计算机关键技术突破的成功应用， 由国防科学技术大学研制。 广东省和广州市提供了研制经费配套支持， 采用天河二号作为广州超级计算中心业务主机。 天河二号峰值计算速度每秒 5.49 亿亿次、持续计算速度每秒 3.39 亿亿次、能效比每瓦特 19 亿次，双精度浮点运算。天河二号峰值计算速度、持续计算速度以及综合技术水平处于国际领先地位，2013年 6 月份，第 41 届国际超级计算机 500 强排名世界第一，是我国超级计算技术发展取得的重大进展。 天河二号由 170 个机柜组成，包括 125 个计算机柜、8 个服务机柜、13 个通信机柜和24 个存储机柜,占地面
5、积 720 平方米。内存总容量 1.4PB，存储总容量 12.4PB，最大运行功耗 17.8 兆瓦。 1.1.1 硬件环境硬件环境 天河二号硬件系统由计算阵列、服务阵列、存储子系统、互连通信子系统、监控诊断子系统等五大部分组成。 图 1 天河二号硬件系统组成图 国家超级计算广州中心 TH-2 用户手册（试用版） 2 1.1.1.1 登录结点登录结点 ln0-5 LN0-5 登录结点，主要作用是实现用户登录，程序开发，提交任务等工作。 LN0-5 登录结点由 4 路 8 核 Xeon E5-4640 服务器构成，登录结点硬件配置如下： 4 块 Intel Xeon E5-4640 CPU 组成，核心数量 32 核，CPU 主频 2GB； 内存 128GB； 1.1.1.2 计算结点计算结点 计算阵列包含 16,000 个计算结点。每个计算结点包含 2 个 Xeon E5 12 核心的多核中央 处理器和 3 个 Xeon Phi 57 核心的众核加速器，共 312 万个计算核心。每个结点拥有 64GB 主存，而每个 Xeon Phi 协处理器板载 8GB 内存，故每结点共 88GB 内存，整体总计内存 1.408PB。 1.1.1.3 互连系统互连系统 互连通信子系统为自主定制的高速互连系统，采用光电混合技术、胖树拓扑结构、点点 带宽 160Gbps，可高效均衡扩展。 1.1.2 软
