血清质谱筛查 NSCLC 特异性及 EGFR-TKI 疗效相关性多肽的探索性研究(毕业设计-肿瘤学专业)

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1、分类号 密 级UDC 保密期限硕士学位论文题 目作者姓名指导教师培养单位专业名称论文提交日期学位授予单位答辩委员会主席血 清 质 谱 筛 查 NSCLC 特 异 性 及 EGFR-TKI 疗 效相关性多肽的探索性研究安 娟刘晓晴 主任医师军事医学科学院附属医院肿瘤学2013 年 05 月 17 日中国人民解放军军事医学科学院中国人民解放军军事医学科学院制军事医学科学院研究生学位论文独创性声明秉 承 军 事 医 学 科 学 院 严 谨 的 学 风 和 科 研 作 风 , 本 人 声 明 所 呈 交 的 学 位 论文是本人在导师指导下独立进行的研究工作和取得的研究成果,除了文中特别加以标注和致谢之

2、处外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果 , 也 不 包 含 为 获 得 军 事 医 学 科 学 院 或 其 它 教 育 机 构 的 学 位 或 证 书 而 使 用 过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。论文作者签字: 签 字 日 期 : 年 月 日军事医学科学院保护知识产权声明本学位 论 文作 者 完 全 了解军 事 医 学 科 学 院 对 研 究 生 在学 其 间撰 写 的论文知识产权保护的相关规定。本人撰写的论文是在导师具体指导下,并得到相关研究经费支持下完成的,其数据和研究成果归属于导师和作者本人,知识产权单位属军 事 医

3、学 科 学 院 。 本 人 保 证 毕 业 后 , 以 本 论 文 数 据 和 资 料 发 表论文或使用论 文 工作成果 时 署名第一 单 位仍 然 为军 事 医 学 科 学 院 。 军 事 医学 科 学 院 有 权 保 留 学 位 论 文 及 其 电 子 版 , 公 布 论 文 的 全 部 或 部 分 内 容 , 可 以采 用 影 印 、 缩 印 或 其 他 复 制 手 段 保 存 论 文 、 汇 编 以 供 查 阅 和 借 阅 。( 保 密 学 位 论 文 在 解 密 后 适 用 本 声 明 )论文作者签字: 签 字 日 期 : 年 月 日指导教师签字: 签 字 日 期 : 年 月 日缩

4、略 词 表(按照首字母顺序)英文缩写 英文全称 中文对照BS binding buffer 结合缓冲溶液CAN acetonitrile 乙腈Cu2+ copper 铜离子Da Dalton 道尔顿EGFR epidermal growth factor receptor 表皮生长因子受体ES elution buffer 洗脱缓冲溶液ESI electrospray ionization 电喷雾电离h hour 小时HCCA -cyano-4-hydroxycinnamic acid -氰基 -4-羟 基 肉 桂 酸MALDI matrix assisted lasterdesorption

5、 基质辅助激光解吸电离ionizationMB-IMAC magnetic bead-based immobilized 螯合纳米磁珠metal ion affinityMBS magnetic bead separator 磁珠分离器min minute 分钟ml milliliter 毫升m/z mass-to-charge ratio 质荷比NSCLC non-small cell lung cancer 非小细胞肺癌ppm parts per million 百万分率QC QuickClassifier, 快速分类法r rotate 转英文缩写 英文全称 中文对照SELDI surfa

6、ce-enhanced laser desorption 表面加强激光解析电离ionizationSNN supervised neural network 监督神经网络算法TFA trifluoroacetic acid 三氟乙酸ul microliter 微升WS washing buffer 洗涤缓冲溶液军 事 医 学 科 学 院 硕 士 学 位 论 文目 录摘 要 .1Abstract. 3前 言 6第 一 部 分 MALDI-TOF 质 谱 技 术 在 NSCLC 早 期 诊 断 中 的 应 用 研 究 .81.1 实 验 材 料 . .81.1.1 试 剂 .81.1.2 实 验

7、仪 器 . 91.1.3 实 验 对 象 及 标 本 .91.2 实 验 方 法 .101.2.1 血 清 采 集 、 磁 珠 提 取 多 肽 及 质 谱 检 测 .101.2.1.1 标 本 收 集 步 骤 .101.2.1.2 金 属 螯 合 磁 珠 处 理 血 清 样 品 的 步 骤 .101.2.1.3 点 靶 及 质 谱 检 测 .111.2.2 分 析 . 111.2.2.1 生 物 信 息 学 软 件 ClinProTools 2.1 介 绍 .111.2.2.2 分 析 过 程 .131.3 实 验 结 果 .131.3.1 训 练 组 的 血 清 多 肽 指 纹 图 谱 .1

8、31.3.2 训 练 组 的 血 清 差 异 多 肽 结 果 分 析 .151.3.2.1 肺 癌 相 关 差 异 表 达 多 肽 的 发 现 .151.3.2.2 NSCLC 分 类 模 型 的 建 立 .161.3.3 盲 法 鉴 定 .171.4 讨 论 .181.5 结 论 .211.6 参 考 文 献 . 21第 二 部 分 晚 期 NSCLC 血 清 多 肽 与 EGFR-TKI 疗 效 的 相 关 性 分 析 .232.1 实 验 材 料 .23I军 事 医 学 科 学 院 硕 士 学 位 论 文2.1.1 药 物 及 试 剂 .232.1.2 实 验 仪 器 .242.1.3

9、实 验 对 象 及 标 本 .242.2 实 验 方 法 242.2.1 血 清 采 集 、 随 访 、 磁 珠 提 取 多 肽 及 质 谱 检 测 . 252.2.1.1 标 本 收 集 步 骤 .252.2.1.2 患 者 随 访 .252.2.1.3 金 属 螯 合 磁 珠 处 理 血 清 样 品 的 步 骤 . .252.2.1.4 点 靶 及 质 谱 检 测 . .252.2.2 分 析 . 262.2.2.1 生 物 信 息 学 软 件 介 绍 .262.2.2.1.1 ClinProTools 2.1 软 件 . .262.2.2.1.2 FlexAnalysis 3.0 软 件

10、 .272.2.2.1.3 NCBA6.0 软 件 . .272.2.2.2 分 析 过 程 .282.3 实 验 结 果 .282.3.1 入 组 患 者 临 床 特 征 资 料 .282.3.2 NSCLC 患 者 血 清 多 肽 质 谱 检 测 结 果 .292.3.2.1 训 练 组 的 血 清 差 异 多 肽 结 果 分 析 .302.3.2.1.1 训 练 组 的 血 清 多 肽 指 纹 图 谱 . .302.3.2.1.2 疗 效 相 关 差 异 表 达 多 肽 的 发 现 . .312.3.2.1.3 建 立 模 型 . .322.3.2.2 盲 法 鉴 定 .322.3.2.3 患 者 相 关 临 床 特 征 的 血 清 多 肽 差 异 分 析 .342.4 讨 论 .352.5 结 论 .372.6 参 考 文 献 . 37在 学 期 间 发 表 的 综 述 . 39在 学 期 间 发 表 的 论 著 . 47II军 事 医 学 科 学 院 硕 士 学 位 论 文个 人 简 历 . 61致 谢 .

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