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1、SciFinder Web 源于化学，超越化学的一站式检索平台源于化学，超越化学的一站式检索平台 医学院医学院SciFinder 高级培训高级培训 王晓鹏王晓鹏 SciFinder培训专员培训专员 2013年年5月月22日星期三日星期三 提提 纲纲 专题一：专题一： 结构面板的全方位介绍结构面板的全方位介绍 专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质 专题三：反应检索的思路专题三：反应检索的思路 专题四：高级反应检索应用举例专题四：高级反应检索应用举例 2 CAS is a division of the American Chemical Society
2、. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 控制面板上的功能键控制面板上的功能键 3 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 4 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All
3、 rights reserved. 将将CAS号、号、SMILES、InChI等转换等转换 为结构式为结构式 检查原子、键之间是否有空隙，检查原子、键之间是否有空隙， 防止单一结构被当成碎片检索防止单一结构被当成碎片检索 将所画结构存为模板，保存之后将所画结构存为模板，保存之后 的模板可以点击的模板可以点击 直接使用直接使用 对绘图面板进行个性化设置，如对绘图面板进行个性化设置，如 结构式的格式、常用元素等结构式的格式、常用元素等 SciFinder结构绘制工具结构绘制工具 重复基团工具重复基团工具 铅笔铅笔 元素周期表元素周期表 可变基团可变基团 碳链工具碳链工具 选择工具选择工具 旋转工具
4、旋转工具 环锁定工具环锁定工具 正电子正电子 橡皮橡皮 常用基团常用基团 R基团定义工具基团定义工具 可变位置连接工具可变位置连接工具 模版工具模版工具 原子锁定工具原子锁定工具 镜面旋转工具镜面旋转工具 负电子负电子 索套选择工具索套选择工具 常见环，多元环工具常见环，多元环工具 C原子和单键恢复工具原子和单键恢复工具 结构检索选择结构检索选择 单双键，单双键，RS构构 型，不确定键型，不确定键 定义工具定义工具 结构和反应切换功能结构和反应切换功能 SciFinder中的反应定义工具中的反应定义工具 6 反应位置标记工具反应位置标记工具 反应箭头反应箭头 反应官能反应官能 团列表团列表 反
5、应原子标反应原子标 记工具记工具 反应反应角色定义工具角色定义工具 结构和反应切换功能结构和反应切换功能 反应检索反应检索选择选择 7 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 元素周期表元素周期表 常用官能团常用官能团 可变基团可变基团 R基团基团 8 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Ch
6、emical Society. All rights reserved. 可变位置连接工具可变位置连接工具 重复基团定义工具重复基团定义工具 环锁定工具环锁定工具 （保证环结构不成为别的环系的一部（保证环结构不成为别的环系的一部 分；保证链状结构不会成环）分；保证链状结构不会成环） 可以检索到可以检索到 不能检索到不能检索到 原子锁定工具原子锁定工具 （保证原子不发生别的取代）（保证原子不发生别的取代） 9 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society.
7、All rights reserved. 反应角色定义工具反应角色定义工具 原子标记工具原子标记工具 （标记反应前后相对应的原子）（标记反应前后相对应的原子） 反应位置标记工具反应位置标记工具 （标记反应过程中形成或断裂的键）（标记反应过程中形成或断裂的键） 代表任意的键，可以是代表任意的键，可以是 单键、双键或者三键单键、双键或者三键 提提 纲纲 专题一：专题一： 结构面板的全方位介绍结构面板的全方位介绍 专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质 专题三：反应检索的思路专题三：反应检索的思路 专题四：高级反应检索应用举例专题四：高级反应检索应用举例 1
8、0 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 案例一：有机物通式结构的亚结构检索案例一：有机物通式结构的亚结构检索 11 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 亚结构检索以下结构通式的物质亚结构检索以下结构通式的物质 1
9、2 将结构通式绘入画图面板，进行亚结构检索。将结构通式绘入画图面板，进行亚结构检索。 HNROX2-5R=S, P, NH2要求：要求： 1 苯环上任意取代一个卤素苯环上任意取代一个卤素 2 碳链可以重复碳链可以重复2至至5次次 3 R基团可以是基团可以是S, P或氨基或氨基 物质检索界面物质检索界面 13 亚结构检索结果亚结构检索结果 14 链状结构成为环系的一部分，不是我们需要的亚结构链状结构成为环系的一部分，不是我们需要的亚结构 用用Refine对结构式进行进一步限定对结构式进行进一步限定 15 用环锁定工具锁定结构中的环系和碳链，保证环系用环锁定工具锁定结构中的环系和碳链，保证环系 不
10、成为别的环系的一部分，保证碳链不会成环不成为别的环系的一部分，保证碳链不会成环。 限定之后的结果集限定之后的结果集 16 对限定之后的结果集进行对限定之后的结果集进行Substance Role分析，选择有制备信息的物质。分析，选择有制备信息的物质。 得到物质角色为制备的物质结果集得到物质角色为制备的物质结果集 17 再使用再使用Analyze中的中的Elements对物质中的元素进行分析对物质中的元素进行分析 18 继续用继续用Analyze / Refine 进行后处理，获取更多的结构信息。进行后处理，获取更多的结构信息。 提提 纲纲 专题一：专题一： 结构面板的全方位介绍结构面板的全方位
11、介绍 专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质 专题三：反应检索的思路专题三：反应检索的思路 专题四：高级反应检索应用举例专题四：高级反应检索应用举例 19 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. SciFinder反应检索的一般思路反应检索的一般思路 20 反应检索 直接检索反 应 精确检索 Analyze/ Refine 亚结构检索 Analyze/ Refine
12、 重新设计检索策 略，如逆合成分 析、核心结构拆 分等 检索相关物 质，再链接 反应 结合Refine工 具添加反应中 的其他物质 反应检索高级应用举例反应检索高级应用举例 不定环反应定义 结构中包含特定基团的反应查询 21 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 如何定义一个不定环？如何定义一个不定环？ 以下转化在以下转化在SciFinder中并没有找到反应结果，如何进行拓展检索？中并没有找到反应结果，如
13、何进行拓展检索？ 22 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved. 直接检索该反应直接检索该反应 23 首先将反应式画入绘图面板，首先将反应式画入绘图面板， 进行亚结构检索进行亚结构检索 改变检索策略改变检索策略 24 或许我们需要的只是这样的转化或许我们需要的只是这样的转化; 可以对环系进行扩展。可以对环系进行扩展。 定义一个不定环定义一个不定环 25 虚线：虚线：环系可环系可 以是饱和的或以是饱和的或 不饱和的；不饱和的； R基团：基团：R=C , N, O or S; 重复基团定义重复基团定义 工具：工具：环系可环系可 以是以是6员环至员环至8 员环；员环； 原子标记工具：原子标记工具： 反应前后的原反应前后的原 子相对应。子相对应。 进行亚结构检索进行亚结构检索 26 CAS is a division of the
