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1、1本 卷 的 答 案 仅 做 参 考 ， 如 有 疑 问 欢 迎 提 出 。 后 面 的 补 充 复 习 题 要 靠 你 们自 己 整 理 答 案 了 。生 物 信 息 学 复 习 题一、填空题1、 识 别 基 因 主 要 有 两 个 途 径 即 基 因 组 DNA 外 显 子 识 别 和 基 于 EST 策 略 的 基 因鉴 定 。2、 表 达 序 列 标 签 是 从 mRNA 中 生 成 的 一 些 很 短 的 序 列 （ 300-500bp） ， 它 们代 表 在 特 定 组 织 或 发 育 阶 段 表 达 的 基 因 。3、 序 列 比 对 的 基 本 思 想 ， 是 找 出 检 测
2、基 因 和 目 标 序 列 的 相 似 性 ， 就 是通 过 在 序 列 中 插 入 空 位 的 方 法 使 所 比 较 的 序 列 长 度 达 到 一 致 。 比 对 的 数 学 模型 大 体 分 为 两 类 ， 分 别 是 整 体 比 对 和 局 部 比 对 。4、 2-DE 的 基 本 原 理 是 根 据 蛋 白 质 等 电 点 和 分 子 量 不 同 ， 进 行 两 次 电 泳将 之 分 离 。 第 一 向 是 等 电 聚 焦 分 离 ,第 二 向 是 SDS-PAGE 分 离 。 5、 蛋 白 质 组 研 究 的 三 大 关 键 核 心 技 术 是 双 向 凝 胶 电 泳 技 术 、
3、质 谱 鉴 定 技 术 、 计 算 机 图 像 数 据 处 理 与 蛋 白 质 数 据 库 。二 、 判 断 题1、 生 物 体 的 结 构 和 功 能 越 复 杂 的 种 类 就 越 多 ， 所 需 要 的 基 因 也 越 多 ， C 值 越大 ， 这 是 真 核 生 物 基 因 组 的 特 点 之 一 。 （ 对 ）2、 CDS 一 定 就 是 ORF。 （ 对 ）3、 两 者 之 间 有 没 有 共 同 的 祖 先 ， 可 以 通 过 序 列 的 同 源 性 来 确 定 ， 如 果 两 个基 因 或 蛋 白 质 有 着 几 乎 一 样 的 序 列 ， 那 么 它 们 高 度 同 源 ,就
4、 具 有 共 同 的 祖 先 。（ 错 ）4、 STS， 是 一 段 200-300bp 的 特 定 DNA 序 列 ， 它 的 序 列 已 知 ， 并 且 在 基 因 组 中属 于 单 拷 贝 。 （ 对 ）5、 非 编 码 DNA 是 “垃 圾 DNA”， 不 具 有 任 何 的 分 析 价 值 ， 对 于 细 胞 没 有 多 大 的 作用 。 （ 错 ）6、 基 因 树 和 物 种 树 同 属 于 系 统 树 ， 它 们 之 间 可 以 等 同 。 （ 错 ）7、 基 因 的 编 码 序 列 在 DNA 分 子 上 是 被 不 编 码 的 序 列 隔 开 而 不 连 续 排 列 的 。
5、(对 ）8、 对 任 意 一 个 DNA 序 列 ， 在 不 知 道 哪 一 个 碱 基 代 表 CDS 的 起 始 时 ， 可 用 6框 翻 译 法 ， 获 得 6 个 潜 在 的 蛋 白 质 序 列 。 （ 对 ）9、 一 个 机 体 只 有 一 个 确 定 的 基 因 组 ， 但 基 因 组 内 各 个 基 因 表 达 的 条 件 和 表 达 的程 度 随 时 间 、 空 间 和 环 境 条 件 而 不 同 。 （ 对 ）10、 外 显 子 和 内 含 子 之 间 没 有 绝 对 的 区 分 ， 一 个 基 因 的 内 含 子 可 以 是 另 一 个 基 因的 外 显 子 ， 同 一 个
6、 基 因 在 不 同 的 生 理 状 况 或 生 长 发 育 的 不 同 阶 段 ， 外 显 子 组 成 也可 以 不 同 。 （ 对 ）11、 比 较 是 科 学 研 究 中 最 常 见 的 方 法 ， 在 生 物 信 息 学 研 究 中 ， 比 对 是 最 常 用 和 最经 典 的 研 究 方 法 。 （ 对 ）12、 ORF 一 定 就 是 CDS。 （ 错 ）13、 用 不 同 的 方 法 可 以 构 建 不 同 的 系 统 发 育 树 ,为 保 证 分 析 结 果 的 可 靠 性 ,需要 对 进 化 树 进 行 评 估 。 （ 对 ）14、 相 似 性 是 一 种 很 直 接 的 数
7、 量 关 系 ， 无 需 实 验 验 证 。 （ 错 ）15、 基 因 树 和 物 种 树 同 属 于 系 统 树 ， 它 们 之 间 可 以 等 同 。 （ 错 ）16、 蛋 白 质 和 DNA 的 同 源 性 常 常 通 过 它 们 序 列 的 相 似 性 来 判 定 ， 如 果 两 个 基装 订 线2因 或 蛋 白 质 有 着 几 乎 一 样 的 序 列 ， 具 有 高 度 的 相 似 性 ， 那 么 它 们 一 定 是 同 源 。（ 错 ）17、 所 谓 局 部 比 对 是 找 出 两 个 被 比 较 序 列 的 最 类 似 片 段 。 （ 对 ）三 、 不 定 项 选 择 题1、 （
8、 ABC ） 是 现 在 国 际 上 最 主 要 的 三 大 核 酸 序 列 数 据 库A. EMBL B. DDBJ C. GenBank D. NCBI E. EBI2、 RFLP 是 DNA 多 态 性 中 最 多 见 的 一 种 ， 它 产 生 的 机 制 包 括 （ ABE ）A.DNA 分 子 产 生 突 变 ， 使 某 些 酶 切 位 点 数 增 加 B. DNA 分 子 产 生 突 变 ， 使 某 些酶 切 位 点 数 减 少 C. 限 制 性 酶 切 位 点 之 间 重 复 序 列 数 目 变 异 D. 限 制 性 酶 星活 性E. 限 制 性 酶 切 位 点 前 后 的 D
9、NA 片 断 发 生 插 入 或 删 除3、 下 面 序 列 哪 些 为 反 向 重 复 序 列 ( BD )A. GCACTTGGCACTTG B. GCACTTGCAAGTGCCGTGAACCGTGAAC CGTGAACGTTCACGC. GCACTTGCAAGTGC D. GCACTAGCTAGCGGCGTGAACGTTCACG CGTGATCGATCGCC4、 分 析 EST 序 列 时 首 要 注 意 以 下 几 点 （ ACDE ）A.EST 序 列 中 除 了 AGTC 外 ， 可 能 出 现 未 知 碱 基B.EST 只 是 单 次 测 序 ， 得 出 的 结 果 没 有 可
10、信 度C.EST 序 列 中 可 能 出 现 错 误 的 插 入 和 缺 失 ， 导 致 读 码 框 移 位D.某 个 EST 序 列 是 数 据 库 中 另 一 序 列 的 一 个 片 段E.某 个 EST 序 列 不 在 基 因 的 编 码 区 内5、 人 类 基 因 组 计 划 要 完 成 的 几 张 图 谱 分 别 是 （ ABCE ）A. 物 理 图 谱 B. 遗 传 图 谱 C. 序 列 图 谱 D. 生 物 图 谱 E. 基 因 图 谱6、 最 常 用 的 序 列 相 似 性 查 询 工 具 是 （ AB ）A.FASTA B.BLAST C.SWISS-PROT D.PDB E
11、.PIR7、 下 列 哪 些 分 子 类 型 属 于 非 蛋 白 质 编 码 区 （ ABCDE ）A.内 含 子 B.卫 星 DNA C.伪 基 因 D.启 动 子 E.增 强 子8、 卫 星 DNA 的 多 态 性 是 由 （ D ） 所 决 定 的 。A. DNA 点 突 变 个 数 B. 限 制 性 内 切 酶 识 别 序 列 个 数 不 同 C. DNA 的 二 级 结 构 不同D. 重 复 单 位 不 同 E 重 复 次 数 不 同9、 真 核 基 因 组 特 点 包 括 （ ABCDE ）A. 基 因 组 大 ， 巨 大 的 非 编 码 序 列 ， 重 复 序 列 占 了 绝 大
12、 部 分B. 基 因 结 构 复 杂 ， 无 显 著 长 度 的 开 放 阅 读 框C. 存 在 可 变 剪 接 D. CpG 岛 E. 等 值 区10、 20 世 纪 三 大 著 名 计 划 包 括 （ ACE ）A.阿 波 罗 登 月 计 划 B.卫 星 计 划 C.HGP D.肿 瘤 计 划 E.曼 哈 顿 原 子 弹计 划四 、 名 词 解 释1、 生 物 信 息 学 ： 广 义 的 生 物 信 息 学 是 指 从 事 对 基 因 组 研 究 相 关 的 生 物 信 息 的 获取 、 加 工 、 储 存 、 分 配 、 分 析 和 解 释 。 而 狭 义 的 生 物 信 息 学 是 指
13、 综 合 应 用 信 息 科学 、 数 学 的 理 论 、 方 法 和 技 术 ， 管 理 、 分 析 和 利 用 生 物 分 子 数 据 的 科 学 。2、 蛋 白 质 组 ： 指由一个基因组，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。33、Contig：就是叠连群，是指彼此间可通过重叠序列而连接成较长片段的一组短片段，也指彼此间可通过重叠序列而连接成较长片段的一组短片段。4、序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。 五 、 简 答 题 （ 共 30 分 ）1、 下 面 的 粗 体 部 分 是 从 GenBank 中 查 出 的 记 录 的 部 分 内 容
14、 ， 你 从 中 得 到 什 么 信息 ？ (8 分 )LOCUS AF486325 477bp DNA linear VRL 12-AUG-2002DEFINITION Human papillomavirus type 16 strain NA1 isolate PWH-Q39 E6 protein (E6) gene, complete cds.ACCESSION AF486325VERSION AF486325.1 GI:19744699SOURCE Human papillomavirus type 16REFERENCE 1 (bases 1 to 477)AUTHORS Chan
15、,P.K., Lam,C.W., Cheung,T.H., Li,W.W., Lo,K.W., Chan,M.Y.,Cheung,J.L., Xu,L.Y. and Cheng,A.F.TITLE Human papillomavirus type 16 intratypic variant infection and riskfor cervical neoplasia in southern ChinaJOURNAL J. Infect. Dis. 186 (5), 696-700 (2002)PUBMED 12195358答 ： 第一行第一行第一行第一行：LOCUS AF486325 477bp DNA linera VRL 12-AUG-2002 LOCUS：基因座位，某一特定的基因位于染色体或其他载体所在位置，包括该基因的全部核苷酸序列。Locus 名称由一个英文字母+数字组成总长不超过 10 个字符。在数据库中locus 名称在数据库中必须是独立的、唯一的，以保证检索的不被重复。 477bp 长度 DNA：生物分子类型。有 DNA、RNA 、tRNAmRNArRNA 等 VRL：分类码 三个字母组成。以前按生物种类对序列分类，现在按序列的功能分类，EST、STS 、CON 类等。 12-AIG
