《提取组织rna,反转录,qpcr流程图》由会员分享,可在线阅读,更多相关《提取组织rna,反转录,qpcr流程图(4页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、一、Total RNA 的提取:1. 取出样本,放入灭过菌的研钵中,倒入液氮,研磨,整个过程要始终保持有液氮,10min 左右,研磨充分后加入 1.5ml 的 EP 管,加入 1ml Trizol,充分匀浆。 (另一种,加入 trizol 会冻起来,就一直研磨,直到最后化成液体。 )2. 室温静置 10min,12000g ,4 度,5min ,上清转移到新的 1.5ml的 EP 管中3. 加入 1/4 体积的氯仿,振荡混匀,室温静置 15min,12000g,4 度,15min,上清转移至新管;4. 加入等体积的异丙醇,轻轻摇匀,室温静置 10min,12000g,4度,10min5. 弃上
2、清,留沉淀,加入 1ml 的 75%乙醇清洗沉淀, 7500g,4 度,5min,弃上清保留沉淀。重复三次6. 弃上清留沉淀,自然风干(510min) ,加入 32ul DEPC 处理过的水,测 OD260/280 的值,根据结果调整至 1g/l=1000ng/l,立即进行反转录,剩余的 RNA 标好号存放在 -80下。附:1OD260=40g/ml用样本跑电泳,确定 RNA 的完整性,注意在这之前把胶配好。 (可无)可见明显的两条带,并且 28S 是 18S 亮度的两倍,还有下边一条不太明显的 5SRNA 的条带。证明 RNA 完整无降解。二、反转录:说明书:10 l 反应体系可最大使用 5
3、00 ng 的 Total RNA。20/1g(以前用的 40,下次用 20)20ul 的体系:先把 buffer 和 RNase Free dH20 和 enzyme 配成 mix5PrimeScript Buffer( for Real Time):4lPrimeScript RT Enzyme Mix I :1lOligo dT Primer( 50 M):1lRandom 6 mers( 100 M):1 l总 RNA :1 l(1g/l)RNase Free dH2O :12l反转录反应条件如下:37 15 min (反转录反应)85 5 sec(反转录酶的失活反应)4 -20分装保
4、存(尽量不要反复冻融,avoid freeze-thaw cycles)三、内参检测 -actin 50l 体系试剂 使用量10*taq buffer 5ldNTP 4lPrimer-F(100M) 0.5lPrimer-R( 100M) 0.5lTaq E 0.25l模板500 ng 1l灭菌蒸馏水 加至 50lPCR 反应条件 :扩增 1 kb 的 DNA 片段的 PCR 反应条件如下:预变性:95,3min98 10 sec.55 30 sec.(下次 60,去掉非特异性)72 30 s (对于 80bp 的内参来说是不是可以省去)72 5min.4保存电泳:2% 琼脂糖凝胶,125V,15min,注意换成 20bp 的 marker,不要加太多。四、定量 PCR电泳检测,条件同上。增大至 50 个循环。五、分析数据引物AT1F: GCCCTTCGGCAATCACCTATAT1R: TGAGACACGTGAGCAGGAACAT2F: CCTGGCAAGCATCTTATGTAGTTCAT2R: CCGGAAATAAAATGTTGGCAATACTIN FGCAGATGTGGATCAGCAAGCR GGCGGACTGTTACTGAGCT