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1、绪论1.资源动物的特点、定义、研究对象与任务Characteristics, definition, mission, subject investigated of Animal resource 1.1 特点：动物资源是指能自行繁衍并不断更新的可利用的动物，是在目前的社会经济技术条件下，人类可以利用与可能利用的动物，包括陆地、湖泊、海洋中的一般动物和一些珍稀频危动物。Animal resources are able to reproduce themselves and constantly update the available animals. In the current soc
2、io- economic and technological conditions, Animal resources is that humans can use and possible use of animals, including land, lakes and oceans in general and some rare and endangered animals.1.2. 定义：研究资源动物的分类、地理分布、栖息地、驯化、繁殖、保护和利用以及与人类活动、自然环境相互关系的学科。2.2. 分类Classification2.1.1 传统分类法：以动物形态上或解剖上的相似性和差
3、异性的总和为基础.2.2.1 The traditional taxonomy : Based on animal morphology or anatomical similarities and differences 双名法binominal nomenclature ：品种名Variety name ：杂交种名Hybrid name ：2.分类2.2.2 按用途分类Classification by use (1) 工业用资源动物 Industrial resource animal(2) 食用资源动物Food resource animals 传统食用动物Traditional fo
4、od animals 新型食用动物New food animals 可开发食用动物Potential food animals (3) 特产资源动物 Special resource animals (4) 药用资源动物 Medicinal resources animals全身入药的，如全蝎、蜈蚣、海马、地龙、白花蛇等。部分的组织器官入药的，如虎骨、鸡内金、海狗肾、乌贼骨等。分泌物、衍生物入药的，如麝香、羚羊角、蜂王浆、蟾酥等。排泄物入药的，如五灵脂、望月砂等。生理的、病理的产物入药的，如紫河车（人的胎盘）、蛇蜕为生理的产物；牛黄、马宝为病理的产物等。 (5) 观赏性资源动物（Exihibi
5、ting animals）：是指作为人类玩赏和公园里供人观赏(enjoying human)而饲养的动物，如踏车小白鼠、玩赏犬和猫等。Exihibiting animals is the animals that human enjoy or watch in the park (enjoying human), such as mice treadmill , pet dogs and cats.(6) 实验用资源动物(Laboratory animals)： 是可供实验用的动物(animals for experiment)，主要指作为医学、药学、生物学、兽医学等的科研、教学、医疗、鉴定、
6、诊断、生物制品制造等需要为目的而驯养、繁殖、育成的动物。例如小鼠和大鼠是首先按实验要求，严格进行培育的实验动物，其次如地鼠类、豚鼠、其它啮齿类、鹌鹑等亦已实验动物化。 广义 狭义： (7) 天敌资源动物(Natural enemies) ：自然界中某种动物专门捕食或危害另一种动物，前者即为后者的天敌。或 自然界中专门捕捉或危害另一种生物的生物，这种生物称为另一种生物的天敌。The nature of some animals specialized predator or harm another animal. Or specifically to capture or harm anoth
7、er creatures. 第二章、研究方法Chapter II , research methods第一节 一般研究方法Section I General research methods 1. 系统研究法（Systematics Approach）系统研究法：也可称为传统研究法。 研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动态与发生，是以系统论和实验、计算方法整合研究为特征的方法。研究个体、种群、群落和生态系统的关系。 20世纪中页贝塔朗菲定义“机体生物学”的“机体”为“整体”或“系统”概念，并阐述以开放系统论研究生物学的理论、数学模型与应用计算机方法等。系统生物学不同于以往仅仅关心个别
8、的基因和蛋白质的分子生物学，在于研究细胞信号传导和基因调控网路、生物系统组成之间相互关系的结构和系统功能的涌现。 “系统生物学” (systems biology) 一词在美国NIH 的PubMed 文献库最早可检索到Zieglgansberger W 和Tolle TR 于1993 年发表的一篇神经系统疾病研究的论文摘要中，根据1968 年国际系统理论与生物学 (systems theory and biology) 会议（最早提出systems biology词汇1）定义为采用系统论方法研究生物学，1989 年在美国召开的生物化学系统论与生物数学国际会议探讨了生物学的系统论与计算生物学模型
9、研究。 系统理论和系统思想对于我国知识分子并不陌生，1980 年代在我国学术界曾经流行过“三论”系统论、信息论和控制论与系统科学。美籍奥地利科学家贝塔朗菲 (L. Bertalanffy) 在 1970 年代创立的“一般系统论” (general system theory)，尽管贝塔朗菲是以生物学家的身份思考、研究，并不仅适用于生命科学，而且广泛应用于物理学、心理学、经济学和社会科学等各门学科；因而，过去所谈论的主要是在理论生物学层面上和普适性强的一般系统论，本文所要介绍的系统生物学 (systems biology)，则是生命科学研究领域的一门组学、计算和转基因系统生物技术等成熟的迅速发展
10、学科。 19241928 年贝塔郎菲多次发表系统论的文章，阐述生物学中有机体概念，提出把有机体当作一个整体或系统来研究，1950年发表生物学与物理学中的系统论和1952年发表抗体系统论注2等开创了系统生物学，第10 届国际分子系统生物学会议称贝塔郎菲为第一个系统生物学家（理论层面），贝塔郎菲开创的系统生物学模型至今仍然很现代。自20 世纪60 年代系统生物学概念和词汇的提出和60-80年代系统生态学、系统生理学的进展，90年代系统生物医学、系统医学、系统生物工程与系统遗传学的概念发表，20 世纪未细胞信号传导与基因调控的研究与系统论方法的结合，进入了分子细胞层次的系统生物学（实验与理论结合）研
11、究与发展时期。 作为人类基因组计划的发起人之一，美国科学家莱诺伊胡德 (Leroy Hood) 也是组学 (omics) 生物技术开创者之一。在胡德看来，系统生物学的重新提出和人类基因组计划有着密切的关系。正是在基因组学、蛋白质组学等新型大科学发展的基础上，孕育了系统生物学的高通量生物技术和生物信息技术。反之，系统生物学的诞生进一步提升了后基因组时代的生命科学研究能力。1996 年在北京举办的第 1 届国际转基因动物学术研讨会，中科院曾邦哲（曾杰）阐述了系统论与生物遗传学、转基因研究等，1999 年元月于德国建立了系统生物科学与工程网（英文），表述生物系统结构论（structurity the
12、ory）的结构整合 (integrative)、调适稳态（stability）与层级建构(constructive) 等综合（synthetic）系统理论规律，并定义实验、计算 (computational)、工程方法的生物系统分析与人工生物系统研究，同系统科学、计算机科学、纳米科学和生物医学、生物工程等领域国际科学家广泛通讯，倡导分子生物技术和计算机科学 -实验生物学家与计算生物学家结合研究生物系统，唤起了一大批生物学研究领域以外的专家的关注。 基于这一信念，在系统生物学已经就要成为新的学术潮流时，1992年建立华盛顿大学分子生物技术系的胡德，在1999 年年底辞去了美国西雅图市华盛顿大学的
13、教职，与另外两名志同道合的科学家一起2000 年创立了世界上第一个系统生物学研究所 (Institute for Systems Biology)。与此同时或1999年更早的中期不少科学家开始了论述，2000 年日本举办了国际系统生物学会议，2000 年美国 E. Kool 重新提出合成生物学 - 基于系统生物学的基因工程。随后，系统生物学便逐渐重新得到了生物科学界的认同。2002 年03 月，美国科学周刊登载了系统生物学专集，该专集导论中的第一句话这样写道：“如果对当前流行的、时髦的关键词进行一番分析，那么人们会发现，系统高居在排行榜上。” 系统生物学的基本工作流程有这样四个阶段。首先是对选
14、定的某一生物系统的所有组分进行了解和确定，描绘出该系统的结构，包括基因相互作用网络和代谢途径，以及细胞内和细胞间的作用机理，以此构造出一个初步的系统模型。第二步是系统地改变被研究对象的内部组成成分（如基因突变）或外部生长条件，然后观测在这些情况下系统组分或结构所发生的相应变化，包括基因表达、蛋白质表达和相互作用、代谢途径等的变化，并把得到的有关信息进行整合。第三步是把通过实验得到的数据与根据模型预测的情况进行比较，并对初始模型进行修订。第四阶段是根据修正后的模型的预测或假设，设定和实施新的改变系统状态的实验，重复第二步和第三步，不断地通过实验数据对模型进行修订和精练。第一到第三阶段，也就是以下
15、的“整合”- 系统理论、“干涉”- 实验生物学和“信息”- 计算生物学等研究，即系统论和实验（experimental）、计算（computational）方法整合的系统生物学概念，目标就是要得到一个理想的模型，使其理论预测能够反映出生物系统的真实性。 2. 民族研究法（Ethrobotany Approach） (1) 图腾totem：；(2) 禁忌prohibition：(3) 民俗custom：(4) 民族药ethnodrug：3. 综合评价法（Integrated Assessment Approach） 运用多个指标对多个参评单位进行评价的方法，称为多变量综合评价方法，或简称综合评价
16、方法。其基本思想是将多个指标转化为一个能够反映综合情况的指标来进行评价。如不同动物数量，不同地区动物的种类，动物的生产量，经济效益评价等。Use multiple indicators to evaluate multiple units method called multivariate comprehensive evaluation method, or simply called the comprehensive evaluation method. The basic idea is to transform multiple indicators to the consolidation indicators. (1)主成分分析法。主成分分析是多元统计分析的一
