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1、1,Vector NTI的使用,2,软件： Vector NTI 8.0 / 10.3 此课件仅是提纲，具体使用看上课时的演示,3,软件的安装 私有序列数据库的维护 限制性内切酶 DNAProtein Contig 序列比对及多重比对 DNA/质粒图谱绘制,4,软件包含两大模块： 数据库模块和功能模块。数据库用于创建、导入导出、维护序列数据、载体数据、蛋白质分子数据、内切酶数据和寡核苷（一般是PCR引物）数据 功能模块主要包括：序列编辑、引物设计、模拟翻译、模拟电泳、序列比对、Contig、第三方附加模块等。,5,一、本机数据模块：,6,数据库分类 核酸分子 蛋白质分子 内切酶 寡核苷酸 电泳
2、marker 引文 BLAST搜索结果 (PCR)分析结果 每类数据库又分为基库(MAIN)和子库(subset) 真正的数据都在基库里，子库只是用户自己建立的数据条目(item)的子集，里面是数据的联接不是数据本身，但是可以象操作数据一样进行直接操作； 对数据条目进行“拷贝”、“粘贴”操作，只会产生一个新的联接，不会产生新的数据；要产生数据复制，需要用“Duplicate”(数据条目上点右键)； 建议：只在子库里对数据进行操作，如果要修改数据，先“duplicate”一个拷贝，以免对原始数据产生不可恢复的影响；,7,分子与序列 在VNTI软件里，molecule与sequence并非等同，m
3、olecule除了包含sequence外，还包含有特性表(feature)等信息 私有序列库的维护 新建库 导入库 导入分子 导入序列 导出分子、序列、库 序列修改,8,9,10,11,12,序列的查看和编辑,13,14,15,序列片段的选取（精确方式，非鼠标操作）,16,序列的编辑 修改、插入、删除 互补序列 翻译（核酸序列蛋白质序列） features的编辑修改 自定义显示、打印,17,18,临时为一段小序列生成互补序列,19,20,21,限制性内切酶 排序与查找 新建一个内切酶 酶切位点图谱 图上的结果不是完整的结果，左边的分析报告才是完整的，明确指明位点个数为“0”才是“无该位点”，因
4、为位点太多(大于5)或该酶未列入分析项目中，都有可能导致不显示出来； 酶切片段 完全酶切 部分酶切,22,23,部分酶切,24,部分酶切,25,部分酶切,26,序列比对,27,28,29,Contig *.abi或*.scf文件与序列文件 构建一个Contig Contig是“contiguous sequences group”的缩写，是将测得的多个序列搭配拼接，能拼成一个连续序列的组合就称为一个group（contig），如果多个contig能拼起来就是染色体了（通常还得补测序） 测序序列的头尾部分，由于技术限制，有可能测不准确的；另外，上游序列中，可能含有克隆载体的部分序列（通用引物与克隆位点之间） 多重比对与Contig,30,示例,31,DNA/质粒图谱绘制 Invitrigen的pEXP38质粒,32,33,34,
