《生物化学》名词解释(打印版)

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1、生物化学名词解释1.氨基酸(amino acid):是含有一个碱性氨基(-NH2)和一个酸性羧基(-COOH)的有机化合物,氨基一般连在-碳上。氨基酸是蛋白质的构件分子。2.必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎动物)(赖氨酸,苏氨酸等)自己不能合成,需要从食物中获得的氨基酸。3.非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成,不需要从食物中获得的氨基酸。4.等电点(pI,isoelectric point):使氨基酸处于兼性离子状态,在电场中不迁移(分子的静电荷为零)的pH值。5.茚三酮反应(ni

2、nhydrin reaction):在加热条件下,氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色(与脯氨酸及羟脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。6.层析(chromatography):按照在移动相和固定相 (可以是气体或液体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。7.离子交换层析(ion-exchange column):一种用离子交换树脂作支持剂的层析技术。8.透析(dialysis):利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开的一种分离纯化技术。9.凝胶过滤层析(gel filtration chromatography,GPC):也叫做分子排阻层析/凝胶渗透层析。一

3、种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。10.亲合层析(affinity chromatograph):利用共价连接有特异配体的层析介质,分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其它分子的层析技术。11.高压液相层析(HPLC):使用颗粒极细的介质,在高压下分离蛋白质或其他分子混合物的层析技术。12.凝胶电泳(gel electrophoresis):以凝胶为介质,在电场作用下分离蛋白质或核酸的分离纯化技术。13.SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE):在去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰氨凝胶电泳。SDS-PAGE只是按照分子的大小,而不是根

4、据分子所带的电荷大小分离的。14.等电聚焦电泳(IEF):利用一种特殊的缓冲液(两性电解质)在聚丙烯酰氨凝胶制造一个pH梯度,电泳时,每种蛋白质迁移到它的等电点(pI)处,即梯度为某一pH时,就不再带有净的正或负电荷了。15.双向电泳(two-dimensional electrophorese):等电聚焦电泳和SDS-PAGE的组合,即先进行等电聚焦电泳(按照pI)分离,然后再进行SDS-PAGE(按照分子大小分离)。经染色得到的电泳图是二维分布的蛋白质图。16.Edman降解(Edman degradation):从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸

5、酯(PITC)修饰,然后从多肽链上切下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。17.同源蛋白质(homologous protein):在不同生物体内行使相同或相似功能的蛋白质,例如血红蛋白。18.构型(configuration):有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。这种排列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。构型的改变往往使分子的光学活性发生变化。19.构象(conformation):由于单键旋转引起的组成原子的不同排列。一种构象改变为另一种构象时,不要求共价键的断裂和重新形成。构象改变不会改变分子的光学活性。20.蛋白质一级结构(pr

6、imary structure):指多肽链的氨基酸序列。21.蛋白质二级结构:蛋白质主链的折叠产生由氢键维系的有规则的构象。常见的二级结构有-螺旋、-折叠片、-转角和无规卷曲。22.蛋白质三级结构(protein tertiary structure):多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具特定走向的紧密球状构象。它包括一级结构中相距较远的肽段之间的几何相互关系和侧链在三维空间中彼此间的相互关系。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用、氢键、范德华力和盐键(离子键)维持的。23.蛋白质四级结构(protein quaternary structure):寡聚蛋白质所有,eg:血红蛋白,寡聚

7、蛋白质中各亚基之间在空间上的相互关系和结合方式。24.-螺旋(-heliv):P207要点12325.超二级结构(super-secondary structure):在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的,种类不多的二级结构组合或二级结构串,在各种蛋白质中充当三级结构的构件。分为,三种26.结构域(domain):多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体。27.疏水相互作用(hydrophobic interaction):水介质中球状蛋白质的折叠总是倾向于把疏水残基埋藏在分子的内

8、部的现象。28.蛋白质变性(denaturation):天然蛋白质受到某些物理因素如加热、紫外线照射、高温和表面张力等或化学因素如有机溶剂、脲、胍、酸、碱等的影响时,生物活性丧失,溶解度降低,不对称程度增高以及其他的物理化学常数发生改变,这种过程称蛋白质变性。其实质是次级键被破坏,但一级结构仍完好。29.蛋白质的三维结构:蛋白质分子所有原子和基团在三维空间结构的构象及走向。30.肌红蛋白(myoglobin):是由一条肽链和一个血红素辅基组成的结合蛋白,是肌肉内储存氧的蛋白质,它的氧饱和曲线为双曲线型。31,复性(renaturation):当变性因素除去后,变性的生物大分子恢复成具有生物活性

9、的天然构象的现象。32.波尔效应(Bohr effect):增加CO2浓度和降低pH都能提高血红蛋白亚基的协同效应,引起红细胞内血红蛋白氧亲和力下降,促进血红蛋白释放氧,反之,增加氧气的浓度,使血红蛋白释放H+及CO2,这种现象称波尔效应。33.血红蛋白(hemoglobin): 是由含有血红素辅基的4个亚基组成的结合蛋白。血红蛋白负责将氧由肺运输到外周组织,它的氧饱和曲线为S型。34.别构效应(allosteric effect):又称为变构效应,寡聚蛋白质一般具多个结合部位,结合在蛋白质分子的特定部位上的配体对该分子的其他部位所产生的影响。35.酶(enzyme):由活细胞产生的在细胞内、

10、外一定条件下,都能起催化作用,具有极高的催化效率的高度专一性的生物大分子。它使错综复杂的生化反应变得顺利和迅速。36.全酶(holoenzyme):脱辅酶与辅因子结合后形成的复合物。37.活性部位(中心)(active energy):酶中含有底物结合部位和参与催化底物转化为产物的氨基酸残基部分。活性部位通常位于蛋白质的结构域或亚基之间的裂隙或是蛋白质表面的凹陷部位,通常都是由在三维空间上靠得很近的一些氨基酸残基组成。38.酸-碱催化(acid-base catalysis):质子转移加速反应的催化作用。39.共价催化(covalent catalysis):一个底物或底物的一部分与催化剂形成

11、共价键,然后被转移给第二个底物。许多酶催化的基团转移反应都是通过共价方式进行的。40.靠近效应(proximity effect):非酶促催化反应或酶促反应速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位处反应剂有效浓度增大的结果,这将导致更频繁地形成过度态。41.寡聚蛋白质:两条或两条以上的具三级结构的多肽链组成的蛋白质。42.米氏方程(Michaelis-Mentent equation):表示一个酶促反应的起始速度()与底物浓度(s)关系的速度方程:=maxs/(Km+s)43.米氏常数(Michaelis constant):对于一个给定的反应,酶促反应的起始速度(0)达到最大反应速度(

12、max)一半时的底物浓度。44.有氧氧化:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成H2O和CO2并放出大量能量的过程。45.双倒数作图(double-reciprocal plot):又称为Lineweaver_Burk作图。一个酶促反应的速度的倒数(1/V)对底物浓度的倒数(1/LSF)的作图。x和y轴上的截距分别代表米氏常数和最大反应速度的倒数。46.竞争性抑制作用(competitive inhibition):通过增加底物浓度可以逆转的一种酶促反应抑制类型。竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一个蛋白质的结合部位。这种抑制使Km增大而max不变。47.非竞争性抑制作用(noncompetiti

13、ve inhibition): 抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使Km不变而max变小。48.反竞争性抑制作用(uncompetitive inhibition): 抑制剂只与酶-底物复合物结合而不与游离的酶结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使Km和max都变小但max/Km不变。49.酶原(zymogen):通过有限蛋白水解,能够由无活性变成具有催化活性的酶前体。50.调节酶(regulatory enzyme):位于一个或多个代谢途径内的一个关键部位的酶,它的活性根据代谢的需要而增加或降低。51.别构酶(allosteric enzyme

14、):活性受结合在活性部位以外的部位的其它分子调节的酶。52.抗体酶(abzyme):又称催化性抗体,为在易变区被赋予了酶属性的免疫球蛋白。53.同工酶(isoenzyme isozyme):催化相同的化学反应但其在蛋白质分子结构、理化性质和免疫性能等方面都存在着明显差异的一组酶。54.别构调节酶/剂(allosteric modulator):称为别构效应物。结合在别构酶的调节部位,调节酶催化活性的生物分子。别构调节物可以是是激活剂,也可以是抑制剂。 55.维生素(vitamin):维持细胞正常功能所必需的需要量很小、机体不能合成或合成量很小,需由食物中供给的一类小分子有机化合物。56,水溶性

15、维生素(water-soluble vitamin):一类能溶于水的有机营养分子。其中包括在酶的催化中起着重要作用的B族维生素以及抗坏血酸(维生素C)及硫辛酸。57,脂溶性维生素(lipid vitamin):由长的碳氢链或稠环组成的聚戊二烯化合物。脂溶性维生素包括A,D,E,和K,这类维生素能被动物贮存。58,辅酶(conzyme):某些酶在发挥催化作用时所需的一类辅助因子,其成分中往往含有维生素。辅酶与酶结合松散,可以通过透析除去。59,辅基(prosthetic group):是与酶蛋白质共价结合的金属离子或一类有机化合物,用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合

16、。60.尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+):含有尼克酰胺的辅酶,在某些氧化还原中起着氢原子和电子载体的作用,常常作为脱氢酶的辅酶。61.黄素单核苷酸(FMN)一种核黄素磷酸,是某些氧化还原反应的辅酶。62.硫胺素焦磷酸(thiamine phosphate):是维生素B1的辅酶形式,参与转醛基反应。63.黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD):是某些氧化还原反应的辅酶,含有核黄素。64.磷酸吡哆醛(pyidoxal phosphate):是维生素B6(吡哆醇)的衍生物,是转氨酶,脱羧酶和消旋酶的酶。65.生物素(biotin):参与脱羧反应的一种酶的辅助因子。66.辅酶A(coenzyme A):一种含有泛酸的辅酶,在某些酶促反应中作为酰

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