(生物科技行业)生物化学名词解释

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1、1peptide unit肽单元 参与肽键的6个原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位于同一平面,Ca1和Ca2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 (peptide unit) 2 motif 模序 在蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,并具有相应的功能,被称为模序。3protein denature蛋白质变性。在某些理化因素作用下,致使蛋白质的空间构象破坏,从而改变蛋白质的理化性质和生物活性,称为蛋白质变性。4. glutathione谷胱甘肽由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸组成的三肽,半胱氨酸

2、的巯基是该三肽的功能基团。它是体内重要的还原剂,以保护体内蛋白质或酶分子等中的巯基免遭氧化。5-pleated sheet 在多肽链折叠结构中,每个肽单元以C为旋转点,依次折叠成锯齿状结构,氨基酸残基侧链交替地位于锯齿状结构的上下方。两条以上肽链或一条肽链内的若干肽段的锯齿状结构可平行排列,其走向可相同,也可相反。并通过肽链间的肽键羰基氧和亚氨基氢形成氢键从而稳固-折叠结构。6 chaperon 分子伴侣是一类帮助新生多肽链正确折叠的蛋白质。它可逆的与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开,如此重复进行可以防止错误的聚集发生,使肽链正确折叠。分子伴侣对于蛋白质分子中二硫键的正确形成起到重要作用。7p

3、rotein quaternary structure 蛋白质的四级结构 数个具有三级结构的多肽链,在三维空间作特定排布,并以非共价键维系其空间结构稳定,每一条多肽链称为亚基。这种蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基间的相互作用,称为蛋白质的四级结构。8结构域 蛋白质的三级结构常可分割成1个和数个球状区域,折叠得较为紧密,各行其能,称为结构域。9 蛋白质等电点 在某一pH溶液中,蛋白质分子所带的正电荷和负电荷相等,净电荷为零,此溶液的pH值,即为该蛋白质的等电点。10 -螺旋 -螺旋为蛋白质二级结构类型之一。在-螺旋中,多肽链主链围绕中心轴作顺时钟方向的螺旋式上升,即所谓右手螺旋。每3.6个氨

4、基酸残基上升一圈,氨基酸残基的侧链伸向螺旋的外侧。-螺旋的稳定依靠-螺旋每个肽键的亚氨基氢和第四个肽键的羰基氧形成的氢键维系。11、变构效应蛋白质空间构象的改变伴随其功能的变化,称为变构效应。具有变构效应的蛋白质称为变构蛋白,常有四级结构。以血红蛋白为例,一分子O2与一个血红素辅基结合,引起亚基构象变化,进而引起进相邻亚基构象变化,更易与O2结合。12 蛋白质三级结构 蛋白质三级结构是指整条多肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也即整条多肽链所有原子在三维空间的排布位置。蛋白质三级结构的形成和稳定主要靠次级键-疏水作用、离子键、氢键和Vander Waals力等。13肽键 一个氨基酸的氨基与另

5、一个氨基酸的羧基脱去1分子H2O,所形成的酞胺键称为肽键。肽键的键长为0132nm,具有一定程度的双键性质。参与肽键的6个原子位于同一平面。14核小体 核小体由DNA和组蛋白共同构成。组蛋白分子共有五种,分别称为H1,H2A,H2B,H3和H4。各两分子的H2A,H2B,H3和H4共同构成了核小体的核心,DNA双螺旋分子缠绕在这一核心上构成了核小体。15碱基互补 在DNA双链结构中,碱基位于内侧,两条链的碱基之间以氢键相接触。由于碱基结构的不同造成了其形成氢键的能力不同,因此产生了固有的配对方式,即腺嘌呤始终与胸腺嘧啶配对存在,形成两个氢键(AT),鸟嘌呤始终与胞嘧啶配对存在,形成三个氢键(G

6、C)。这种配对方式称为碱基互补。16增色效应 DNA的增色效应是指在其解链过程中,DNA的A260NM增加,与解链程度有一定的比例关系。17Tm值 DNA变性过程中,紫外光吸收值达到最大值的50时的温度称为DNA的解链温度(Tm)。在Tm时,核酸分子内50的双链结构被解开。Tm值与DNA的分子大小和所含碱基中的GC比例成正比。18核糖体 核糖体由rRNA与核糖体共同构成,分为大、小两个亚基。核糖体的功能是作为蛋白质合成的场所。核糖体的功能是为细胞内蛋白质的合成提供场所。在核糖体中,rRNA和核糖体蛋白共同形成了mRNA、tRNA与氨基酸的复合物、翻译起始因子、翻译延长因子等多种参与该合成过程的

7、成分的识别和结合部位。19. 核酶 具有自我催化能力的RNA分子自身可以进行分子的剪接,这种具有催化作用的RNA被称为核酶。20核酸分子杂交 热变性的DNA经缓慢冷却过程中,具有碱基序列部分互补的不同的DNA之间或DNA与RNA之间形成杂化双键的现象称为核酸分子杂交。21.反密码环 反密码环位于tRNA三叶草形二级结构的下方,中间的3个碱基称为反密码子,与mRNA上相应的三联体密码可形成碱基互补。不同的tRNA有不同的反密码子,蛋白质生物合成时,靠反密码子来辨认mRNA上相应的三联体密码,将氨基酸正确的安放在合成的肽链上。22Z-DNA 这种DNA是左手螺旋。在体内,不同构象的DNA在功能上有

8、所差异,可能参与基因表达的调节和控制。23固定化酶 是将水溶性酶经物理或化学的方法处理后,成为不溶于水但仍具有酶活性的一种酶的衍生物。固定化酶在催化反应中以固相状态作用于底物,并保持酶的高度特异性和催化高效率。24别构调节 体内有的代谢物可以与某些酶分子活性中心外的某一部位可逆地结合,使酶发生变构并改变其催化活性。此结合部位称为别构部位或调节部位。对酶催化活性的这种调节方式称为别构调节。受别构调节的酶称做别构酶。导致别构效应的代谢物称做别构效应剂。25酶的特异性 酶对其所催化的底物具有较严格的选择性,即一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并产生一定的产物,酶的这种

9、特性称为酶的特异性。根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,酶的特异性可大致分为三种类型,即绝对特异性,相对特异性和立体异构特异性。26酶的活性中心 酶分子中与酶的活性密切相关的基团称做酶的必需基团。这些必需基团在一级结构上可能相距很远,但在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异的结合并将底物转化为产物。这一区域被称为酶的活性中心。酶活性中心内的必需基团有两种:一是结合基团,其作用是与底物相结合,使底物与酶的一定构象形成复合物;另一是催化基团,它的作用是影响底物中某些化学键的稳定性,催化底物发生化学反应并将其转变成产物。活性中心的必需基团可同时具有这两方面的功能。27结合酶

10、 酶分子除含有氨基酸残基形成的多肽链外,还含有非蛋白部分。这类结合蛋白质的酶称为结合酶。其蛋白部分称为酶蛋白,非蛋白部分称为辅助因子,有的辅助因子是小分子有机化合物,有的是金属离子。酶蛋白与辅助因子结合形成的复合物称为全酶,只有全酶才有催化作用。28最适温度 酶促反应速度最快时的环境温度称为酶促反应的最适温度。29Isoenzyme(同工酶) 同工酶是指催化的化学反应相同,酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。30Activators(激活剂) 使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质称为酶的激活剂。激活剂大多为金属离子,少数为阴离子。也有许多有机化合物激活剂。31Zymog

11、ens(酶原) 有些酶在细胞内合成或初分泌时只是酶的无活性前体,必须在一定的条件下,这些酶的前体水解开一个或几个特定的肽键,致使构象发生改变,表现出酶的活性。这种无活性酶的前体称做酶原。酶原向酶的转化过程称为酶原的激活。酶原的激活实际上是酶的活性中心形成或暴露的过程。32 Initial velocity(初速度) 反应初速度是指反应刚刚开始时,各种影响酶促反应速度的因素尚未发挥作用,时间进程与产物的生成量呈直线关系时的反应速度。此时,酶促反应速度与酶的浓度成正比。33 Michaelis constant(米氏常数,Km) 米氏常数是单底物反应中酶与底物可逆地生成中间产物和中间产物转化为产物

12、这三个反应的速度常数的综合。即: k1 k3 k2+k3 ESESEP Km- k2 k1 米氏常数等于反应速度为最大速度一半时的底物浓度。34 Allosteric cooperation(别构协同效应) 别构酶分子中常含有多个(偶数)亚基,酶分子的催化部位(活性中心)和调节部位有的在同一亚基内,也有的不在同一亚基内。含有催化部位的亚基称为催化亚基;含有调节部位的亚基称为调节亚基。当第一个亚基与效应剂结合后,此亚基发生构象改变,并将此效应传递到相邻的亚基,使相邻的亚基也发生同样的构象改变,从而改变这一相邻亚基对效应剂的亲和力。这种效应称为协同效应。如果第一个效应剂与酶的结合,使第二个效应剂与

13、酶的结合变得容易,这种协同效应称为正协同效应。相反,如果这种协同效应使第二个效应剂与酶的结合变得困难,即亲和力变小,则称此协同效应为负协同效应。35glycolysis 糖酵解 在缺氧情况下,葡萄糖分解为乳酸的过程称为糖酵解。36glycolytic pathway 酵解途径 葡萄糖分解为丙酮酸的过程称为酵解途径。37tricarboxylic acid cycle (TAC) 三羧酸循环 线粒体内由乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸开始,经反复脱氢、脱羧再生成草酰乙酸的循环反应过程称为三羧酸循环。38citric acid cycle 柠檬酸循环 即为三羧酸循环(见上述)。39. Pasteu

14、r effect 巴斯德效应 糖有氧氧化抑制糖酵解的现象称为Pasteur effect。40pentose phosphate pathway(PPP) 磷酸戊糖途径(或称磷酸戊糖旁路) 6-磷酸葡萄糖经氧化反应及一系列基团转移反应,生成NADPH、CO2、核糖及6-磷酸果糖和3-磷酸甘油醛而进入酵解途径。41glycogenesis 糖原合成 由葡萄糖合成糖原的过程称为糖原合成。42. gluconeogenesis 糖异生 由非糖化合物转变为葡萄糖或糖原的过程称为糖异生。43substrate cycle 底物循环 在代谢过程中由催化单向反应的酶催化两种底物互变的循环称为底物循环。44.

15、 lactic acid cycle 乳酸循环 在肌肉中葡萄糖经糖酵解生成乳酸,乳酸经血液运到肝脏,肝脏将乳酸异生成葡萄糖。葡萄糖释入血液后又被肌肉摄取,这种代谢循环途径称为乳酸循环。45blood sugar 血糖 血液中的葡萄糖称为血糖。其正常水平为 3.89 6.llmmol/L (70110mg/dl)。46. 三碳途径 葡萄糖先分解成丙酮酸、乳酸等三碳化合物,再运至肝脏异生成糖原的过程称为三碳途径或间接途径。47肝糖原分解 肝糖原分解为葡萄糖的过程。48级联放大系统 经一系列酶促反应将激素信号放大的连锁反应称为级联放大系统。49Krebs循环 即为三羧酸循环(见上述)。50糖有氧氧化 葡萄糖在有氧条件下氧化生成CO2和H2O并释放能量的反应过程。51. 糖异生途径 从丙酮酸生成葡萄糖的具体反应过程称为糖异生途径。52. 糖原累积症 由于先天性缺乏与糖原代谢有关的酶类,使体内有大量糖原堆积的遗传性代谢病。53. 活性葡萄糖 在葡萄糖合成糖原的过程中,UDPG

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