《XPC基因多态性与食管鳞状细胞癌、贲门腺癌的发病风险》由会员分享，可在线阅读，更多相关《XPC基因多态性与食管鳞状细胞癌、贲门腺癌的发病风险（13页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、1XPC 基因多态性与食管鳞状细胞癌、贲门腺癌的发病风险作者：郭炜，周荣秒，李琰，王娜，万玲玲【摘要 】 目的 探讨 DNA 修复基因 XPC 第 9 内含子 PAT+/-和第 15 外显子 A2920C 单核苷酸多态性（SNP ）与河北省食管癌、贲门癌高发区磁县和涉县人群食管鳞状细胞癌（ESCC）和贲门腺癌（GCA）遗传易感性的关系。方法 采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性（PCRRFLP ）分析方法检测 327 名 ESCC 患者、253名 GCA 患者和 612 名健康对照个体的 XPC 基因第 9 内含子PAT+/-及第 15 外显子 A2920C SNP 的基因型，比较各组间等位
2、基因及基因型频率的分布。结果 XPC 基因第 9 内含子 PAT+/-和第15 外显子 A2920C 的基因型及等位基因型频率在 ESCC 患者组、GCA 患者组和对照组之间，其总体分布均无显著性差异（P0.05） 。根据吸烟状况和上消化道肿瘤家族史分层分析发现，与 A/A 基因型比较，携带 C/C 基因型可能增加非吸烟个体 ESCC 的发病风险 （经性别、年龄和上消化道肿瘤家族史校正后的OR=2.09，95%CI=1.143.81） 。结论 XPC 基因第 15 外显子C/C 基因型可能是影响河北省食管癌、贲门癌高发区磁县和涉县非吸烟人群 ESCC 发病风险的因素之一。 2【关键词】 食管鳞
3、状细胞癌；贲门腺癌；XPC；基因多态性；肿瘤易感性Correlation of XPC Polymorphisms to the Risk of Esophageal Squamous Cell Carcinoma and Gastric Cardiac AdenocarcinomaAbstract：Objective To investigate the correlation of XPC intron 9 PAT+/- and exon 15 A2920C SNPs with susceptibility to esophageal squamous cell carcinoma (ES
4、CC) and gastric cardiac adenocarcinoma (GCA) in a population of high incidence region of Hebei Province. Methods XPC intron 9 PAT+/- and exon 15 A2920C SNPs were genotyped by polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism (PCRRFLP) analysis in 327 ESCC patients, 253 GCA patients a
5、nd 612 healthy controls. Results The overall genotype and allelotype distributions of XPC intron 9 PAT+/- and exon 15 A2920C in ESCC and GCA patients were not significantly different from that in healthy controls（P0.05）. When stratified for smoking status and UGIC family history, compared with A/A g
6、enotype, C/C 3genotype significantly increased the risk of developing ESCC in nonsmoker group age and gender and UGIC family history adjusted odds ratio (OR)=2.09, 95%CI=1.143.81. Conclusion C/C genotype of XPC exon 15 may be one of the factors that affect the risk of developing ESCC in nonsmoking p
7、opulation in the high incidence region of Hebei Province.Key words：Esophageal squamous cell carcinoma；Gastric cardiac adenocarcinoma；XPC ；Polymorphism; Susceptibility0 引言XPC 基因定位于染色体 3p25，包括 16 个外显子和 15 个内含子，编码一个含 940 个氨基酸的蛋白质，其第 9 内含子和第 15 外显子均存在单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism, SNP）1。 XPC 蛋白
8、是着色性干皮病基因 C 的产物，对于维持基因组的稳定和完整性相当重要，其功能异常可导致 DNA 修复能力下降，因此与疾病易感性有关24 。XPC 第 9 内含子 PAT+/-SNP、第 15 外显子 A2920C SNP 与头颈部、肺等多个部位肿瘤的发病风险关系已有报道512 ，但是，4XPC 基因多态性与食管癌、贲门癌发病风险的关联研究尚未见报道。本研究应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性（Polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism, PCRRFLP）分析方法，探讨河北省食管癌、贲门癌高发区 磁县和涉县
9、人群 XPC 基因第 9 内含子 PAT+/-及第 15 外显子 A2920C SNP 对食管鳞状细胞癌、贲门腺癌易感性的影响。1 资料与方法1.1 研究对象327 名食管鳞状细胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)患者、253 名贲门腺癌(Gastric cardiac adenocarcinoma, GCA)患者均来自河北省食管癌、贲门癌高发区磁县和涉县的癌前普查，612 名健康对照为在相同地区同一时间通过癌前普查获得，所有研究对象均知情同意本项研究，由专门的登记员调查所有研究对象的性别、年龄、吸烟史及上消化道肿瘤家族史。现吸烟或曾吸烟每天
10、 5 支以上并持续 2 年或 2 年以上者定义为吸烟个体。家族中有 1 名以上一级亲属和（或） 2 名以上二级亲属患有食管癌、贲门癌、胃癌者定义为上消化道肿瘤（Upper gastrointestinal cancer, UGIC）家族史阳性。51.2 标本采集及外周血白细胞 DNA 的提取所有研究个体均采集静脉血 5ml，经枸橼酸钠抗凝，4 冰箱保存。采血后一周内，以蛋白酶 K 消化 饱和氯化钠盐析法13提取外周血淋巴细胞染色体 DNA。1.3 XPC SNP 基因分型XPC 基因第 9 内含子基因型检测应用 PCR 方法进行。上游引物为 5TAGCACCCAGCAGTCAAAG3，下游引物
11、为5TGTGAATGTGCTTAATGCTG3。PCR 产物经 3%琼脂糖凝胶电泳，突变基因型 PAT+/+为 344bp，野生基因型 PAT-/-为266bp，杂合子 PAT+/-基因型为 344bp 和 266bp，见图 1。XPC 基因第 15 外显子基因型检测应用 PCRRFLP方法进行。PCR 反应上、下游引物分别为5GGAGGTGGACTCTCTTCTGATG3和下游引物5TAGATCCCAGCAGATGACC3。PCR 产物经限制性内切酶Pvu（Takara）于 37 酶切 16h 后，进行 2%琼脂糖凝胶电泳。突变基因型 C/C 存在 Pvu的识别位点产生 582bp 和 18
12、3bp 两条DNA 片段，而野生基因型 A/A 缺乏 Pvu的识别位点保持原有PCR 后的 765bp 的片段，杂合子 A/C 基因型则表现为6765bp、582bp 和 183bp 三条片段，见图 2。为进行基因型检测的质量控制，每一批 PCR 反应均以灭菌蒸馏水替代模板 DNA 作为阴性对照，XPC 第 9 内含子的扩增产物随机挑取各基因型 1 例进行测序，而 XPC 第 15 外显子随机挑取 10%进行重复实验。1.4 统计学方法经卡方检验比较基因型频率的观察值与预期值，进行HardyWeinberg平衡分析。病例组和对照组的 XPC 基因型及等位基因型分布比较采用行列表的卡方检验进行。
13、应用非条件Logistic 回归模型计算多因素（性别、年龄、吸烟、上消化道肿瘤家族史）校正相对风险度的比值比（Odds ratio，OR ）及其 95%可信区间 CI。P0.05） 。ESCC 患者组、GCA 患者组中吸烟个体比例与对照组相比无显著性差异（P0.05） 。ESCC 患者组、GCA 患者组中 UGIC 家族史阳性个体比例分别为 48.0%、47.8% ，显著高于对照组 34.2%，表明 UGIC 家族史可能增加 ESCC 和 GCA 的发病风险（经性别、年龄和吸烟状况校正后的 OR=1.80 和1.75，95%CI=1.362.38 和 1.292.36） ，见表 1。表 1 食
14、管癌、贲门癌和对照组人口学分布及 XPC PAT+/-和 A2920C 等位基因型频率（略）所有标本均成功进行了基因型分型，测序及所有重复分型结果均与原结果相符。经卡方检验，XPC 第 9 内含子及第 15 外显子 SNP基因型分布均符合 HardyWeinberg平衡（P0.05） 。2.2 XPC 基因第 9 内含子 PAT+/- SNP 与 ESCC、GCA 发病风险的关系XPC 基因第 9 内含子 PAT和 PAT+的等位基因频率及 PAT-/-、PAT+/-、PAT+/+基因型频率在 ESCC、GCA 及对照组之间无显著性差异（P0.05） ，见表 1、2 。按吸烟状况和上消化道肿瘤
15、家族史进行分层分析，未发现 XPC 基因第 9 内含子 PAT+/- SNP影响 ESCC 和 GCA 的发病风险，见表 2。表 2 XPC PAT+/- SNP 8与 ESCC、 GCA 发病风险的相关性分析（略）表 3 XPC A2920C SNP 与 ESCC、GCA 发病风险的相关性分析（略）2.3 XPC 基因第 15 外显子 A2920C SNP 与 ESCC、GCA 发病风险的关系XPC 基因第 15 外显子 A 和 C 等位基因频率及A/A、A/C、C/C 基因型频率在 ESCC、GCA 患者组与对照组之间无显著性差异，见表 1、3 。按吸烟状况和上消化道肿瘤家族史进行分层分析发现，在非吸烟组中 ESCC 患者的 C/C 基因型频率（14.6%）明显高于对照组（8.7%） ，与 A/A 基因型比较，携带 C/C 基因型可能增加非吸烟组 ESCC 的发病风险（经性别、年龄和上消化道肿瘤家族史校正后的 OR=2.09，95%CI=1.143.81，见表 3。2.4 XPC 基因第 9 内含子 PAT+/-及第 15 外显子 A2920C SNP 单体型分布应用 EH 软件和 2LD 软件对 XPC 基因第 9 内含子 PAT+/-及第 15 外显子 A2920C SNP 位点进行的联合分析显示，XPC 基因第9 内含子 PAT-等位基因和第 15 外显
